| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 816,907 | C→T | intergenic (+267/‑222) | unknown → / → unknown | NADP‑specific glutamate dehydrogenase (EC 1.4.1.4)/Catalase KatE (EC 1.11.1.6) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 816,907 | 0 | C | T | 100.0% | 159.3 / NA | 46 | intergenic (+267/‑222) | unknown/unknown | NADP‑specific glutamate dehydrogenase (EC 1.4.1.4)/Catalase KatE (EC 1.11.1.6) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (28/18); total (28/18) | |||||||||||
CGCACTTTGATCTGCCCTCCCAAAGAGGACGCCGCCGCCAATCAATTAAAATGCAGGTTTTTATAGGAAAACATTATTTAATCGGAATATTTTTATTCCCGCCGGTTTAACTACATGATGAACCCGGGCGGACGATGAATATATTCGTTATTATTGAGGAGCGTAATTAAGCTTAAGTTAAACAATTTGAGCCCTGTGCAGTGCAGAGCTCAATATTTAACTTAGGTTTAGCTATCCGCCCGGTTTTAGGGTGCAGATCAAAGTGCGATCATTTTCTTTTCTCATTTCTTTTTTCTTGATTAAATCAATTCTAACTATTAATAGTTATTTTTTAATCGTCAAATATTATTAATTTAATAGATTGAGAACTTTTTGCTGGTATTTATAATTTCTGTCAATCGATCATCCATAAAAATGGATATTTTTTACTCTACTACTCAAAAATTAAGGAAACGATTATGT > 1/816671‑817132 | cGCACTTTGATCTGCCCTCCCAAAGAGGACGCCGCCGCCAATCAATTAAAATGCAGGTTTTTATAGGAAAACATTATTTAATCGGAATATTTTTATTCCCGCCGGTTTAACTACATGATGAACCCGGGCGGACGATGAATATATTCGTTATTATTGAGGAGCGTAATTAAGCTTAAGTTAAACAATTTGAGCCCTGTGCAGTGCAGAGCTCAATATTTAACTTAGGTTTAGCTATCTGCCCGGTTTTAggg < 1:320887/251‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) aaCTTAGGTTTAGCTATCTGCCCGGTTTTAGGGTGCAGATCAAAGTGCGATCATTTTCTTTTCTCATTTCTTTTTTCTTGATTAAATCAATTCTAACTATTAATAGTTATTTTTTAATCGTCAAATATTATTAATTTAATAGATTGAGAAc < 1:525501/151‑1 (MQ=255) aCTTAGGTTTAGCTATCTGCCCGGTTTTAGGGTGCAGATCAAAGTGCGATCATTTTCTTTTCTCATTTCTTTTTTCTTGATTAAATCAATTCTAACTATTAATAGTTATTTTTTAATCGTCAAATATTATTAATTTAATAGATTGAGAACTTTTTGCTGGTATTTATAATTTCTGTCAATCGATCATCCATAAAAATGGATATTTTTTACTCTACTACTCAAAAATTAAgg > 1:529649/1‑231 (MQ=255) | CGCACTTTGATCTGCCCTCCCAAAGAGGACGCCGCCGCCAATCAATTAAAATGCAGGTTTTTATAGGAAAACATTATTTAATCGGAATATTTTTATTCCCGCCGGTTTAACTACATGATGAACCCGGGCGGACGATGAATATATTCGTTATTATTGAGGAGCGTAATTAAGCTTAAGTTAAACAATTTGAGCCCTGTGCAGTGCAGAGCTCAATATTTAACTTAGGTTTAGCTATCCGCCCGGTTTTAGGGTGCAGATCAAAGTGCGATCATTTTCTTTTCTCATTTCTTTTTTCTTGATTAAATCAATTCTAACTATTAATAGTTATTTTTTAATCGTCAAATATTATTAATTTAATAGATTGAGAACTTTTTGCTGGTATTTATAATTTCTGTCAATCGATCATCCATAAAAATGGATATTTTTTACTCTACTACTCAAAAATTAAGGAAACGATTATGT > 1/816671‑817132 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |