| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 755,436 | C→T | intergenic (+59/‑240) | unknown → / → unknown | Transcriptional regulator, MerR family/Type I restriction‑modification system, DNA‑methyltransferase subunit M (EC 2.1.1.72) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 755,436 | 0 | C | T | 100.0% | 158.4 / NA | 47 | intergenic (+59/‑240) | unknown/unknown | Transcriptional regulator, MerR family/Type I restriction‑modification system, DNA‑methyltransferase subunit M (EC 2.1.1.72) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (24/23); total (24/23) | |||||||||||
ATTACAAGACAACCCGCAACGCAACAGCCGCGAAGTGAAAAAACTCACCGCGCAACACATTGAAACCTTAAACGACCAAATACAGGCGTTACAAAAAATGGTCACCGAACTGCAACGTTGGCACGACAACTGCCAAGGTAACGACTGCCCGGAATGCTCGATTTTGGAGGGCTTGAGTGAGTGAAAAGTGCGGTGATTTTTCATTGCAATTTTAAGTAGAAATATAATTAAAAAATCTCTCACGCTTATCTTTTAAACATGCACAATTCCTATAAAATAGGTATATTTTTTTATTTACTCACTTTACAAAGGACAAATTTTATGCAGAAGCCAGAAGCCAGAAGCCAGAAGCCAGAAGCCACCAAGATTATGTTGAAAATTCAGCCACACAACAAGCCTTCCTAAACGACCTCGACGAAAAACTTTGGTCTTCCGCCGACCGTCTCCGCCAGCAACTCGACGCCGCCAACTACAAA > 1/755194‑755669 | aTTACAAGACAACCCGCAACGCAACAGCCGCGAAGTGAAAAAACTCACCGCGCAACACATTGAAACCTTAAACGACCAAATACAGGCGTTACAAAAAATGGTCACCGAACTGCAACGTTGGCACGACAACTGCCAAGGTAACGACTGCCCGGAATGCTCGATTTTGGAGGGCTTGAGTGAGTGAAAAGTGCGGTGATTTTTCATTGCAATTTTAAGTAGAAATATAATTAAAAAATCTCTCATGCTTAt > 1:867525/1‑249 (MQ=255) 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aaTTAAAAAATCTCTCATGCTTATCTTTTAAACATGCACAATTCCTATAAAATAGGTATATTTTTTTATTTACTCACTTTACAAAGGACAAATTTTATGCAGAAGCCAGAAGCCAccaagattatgttgaaaattcagccacacaacaagccttcctaaacgacctcgacgaaaaactttggtcttccgccgaccgtctccgccagcaactcgacgccgccaactacaaacacattgtgcttggcttaatc < 1:693288‑M1/251‑137 (MQ=255) ctctcATGCTTATCTTTTAAACATGCACAATTCCTATAAAATAGGTATATTTTTTTATTTACTCACTTTACAAAGGACAAATTTTATGCAGAAGCCAGAAGCCAccaagattatgttgaaaattcagccacacaacaagccttcctaaacgacctcgacgaaaaactttggtcttccgccgaccgtctccgccag > 1:80567‑M1/1‑104 (MQ=255) | ATTACAAGACAACCCGCAACGCAACAGCCGCGAAGTGAAAAAACTCACCGCGCAACACATTGAAACCTTAAACGACCAAATACAGGCGTTACAAAAAATGGTCACCGAACTGCAACGTTGGCACGACAACTGCCAAGGTAACGACTGCCCGGAATGCTCGATTTTGGAGGGCTTGAGTGAGTGAAAAGTGCGGTGATTTTTCATTGCAATTTTAAGTAGAAATATAATTAAAAAATCTCTCACGCTTATCTTTTAAACATGCACAATTCCTATAAAATAGGTATATTTTTTTATTTACTCACTTTACAAAGGACAAATTTTATGCAGAAGCCAGAAGCCAGAAGCCAGAAGCCAGAAGCCACCAAGATTATGTTGAAAATTCAGCCACACAACAAGCCTTCCTAAACGACCTCGACGAAAAACTTTGGTCTTCCGCCGACCGTCTCCGCCAGCAACTCGACGCCGCCAACTACAAA > 1/755194‑755669 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |