| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,379,260 | (ATATA)2→1 | coding (187‑191/192 nt) | unknown → | Permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1379260 | 1379264 | 5 | 77 [0] | [0] 75 | unknown | Permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1379259 | 0 (0.000) | 73 (0.850) | 49/420 | 0.5 | 100% | coding (186/192 nt) | unknown | Permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily |
| ? | 1 | 1379265 = | 0 (0.000) | coding (192/192 nt) | unknown | Permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily | |||||
GGCATGGACTTCCTACTTAAGGGAAAGTTTATCACTTAAATACGGTTCGGTAGTATCAATGCCTTACCAATATATTGCCGTAGCAATAGCCGGATTAGGAATGGTATTTACTCTGGGGTTAGACTTATCCCAGATCAAAATTATTTTCAGTAGCCCGCTTTTAATTGCTTTATTGATCTTTCTTGGAATGGGTATTTCCGGCGGTAGTTATTTAATCCAGCTTTACTCTTTCAAACATCATATAATATAGGTGTAGAAAATTCAACAATGACATTAAATTTAATGCCATTATTAGGATATGTAACGTAATCATAACATTAGGTGAAGAAATGGTACTTAGCAAAACAATCATTGTCACAATCATAGTAATTGCATTGTATGTTTTCACTCAGTATGGCGATAAAGGAGAGAACTAACATAAAGGAGAAAAATTTATCTATAAGTAAAACCCTGCATATTACTATCTTATTAAATGTCAAATACCAGGTTTTCCTAATA > 1/1379016‑1379513 | tcactggcatggacttcctacttaagggaaagtttatcacttaaatacggttcggtagtatcaatgccttaccaatatattgccgtagcaatagccggattaggaatggtatttactctggggttagacttatcccagatcaaaattattttcagtagcccgcttttaattgctttattgatctttcttggaatgggtatttccggcggtagttatttaatccagctttactctttcaaacatcatatagg < 1:843473‑M2/2‑1 (MQ=255)tcactggcatggacttcctacttaagggaaagtttatcacttaaatacggttcggtagtatcaatgccttaccaatatattgccgtagcaatagccggattaggaatggtatttactctggggttagacttatcccagatcaaaattattttcagtagcccgcttttaattgctttattgatctttcttggaatgggtatttccggcggtagttatttaatccagctttactctttcaaacatcatatagg < 1:732663‑M2/2‑1 (MQ=255)tcactggcatggacttcctacttaagggaaagtttatcacttaaatacggttcggtagtatcaatgccttaccaatatattgccgtagcaatagccggattaggaatggtatttactctggggttagacttatcccagatcaaaattattttcagtagcccgcttttaattgctttattgatctttcttggaatgggtatttccggcggtagttatttaatccagctttactctttcaaacatcatatagg < 1:770436‑M2/2‑1 (MQ=255) gcatggacttcctacttaagggaaagtttatcacttaaatacggttcggtagtatcaatgccttaccaatatattgccgtagcaatagccggattaggaatggtatttactctggggttagacttatcccagatcaaaattattttcagtagcccgcttttaattgctttattgatctttcttggaatgggtatttccggcggtagttatttaatccagctttactctttcaaacatcatatagg > 1:168091‑M2/244‑245 (MQ=255) 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> 1:118518‑M2/180‑251 (MQ=255) ccaatatattgccgtagcaatagccggattaggaatggtatttactctggggttagacttatcccagatcaaaattattttcagtagcccgcttttaattgctttattgatctttcttggaatgggtatttccggcggtagttatttaatccagctttactctttcaaacatcatataGGTGTAGAAAATTCAACAATGACATTAAATTTAATGCCatta > 1:809110‑M2/179‑220 (MQ=255) ccaatatattgccgtagcaatagccggattaggaatggtatttactctggggttagacttatcccagatcaaaattattttcagtagcccgcttttaattgctttattgatctttcttggaatgggtatttccggcggtagttatttaatccagctttactctttcaaacatcatataGGTGTAGAAAATTCAACAATGACATTAAATTTAATGCCATTATTAGGATATGTaa < 1:637313‑M2/55‑1 (MQ=255) atatattgccgtagcaatagccggattaggaatggtatttactctggggttagacttatcccagatcaaaattattttcagtagcccgcttttaattgctttattgatctttcttggaatgggtatttccggcggtagttatttaatccagctttactctttcaaacatcatataGGTGTAGAAAATTCAACAATGACATTAAATTTAATGCCATTATTAGGATATGTAACGTAATCATAACAt > 1:476114‑M2/176‑244 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |