| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 755,534 | (GAAGCCA)5→2 | intergenic (+157/‑122) | unknown → / → unknown | Transcriptional regulator, MerR family/Type I restriction‑modification system, DNA‑methyltransferase subunit M (EC 2.1.1.72) |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 755534 | 755554 | 21 | 55 [0] | [0] 56 | unknown/unknown | Transcriptional regulator, MerR family/Type I restriction‑modification system, DNA‑methyltransferase subunit M (EC 2.1.1.72) |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 755533 | 0 (0.000) | 47 (0.580) | 34/398 | 1.1 | 100% | intergenic (+156/‑143) | unknown/unknown | Transcriptional regulator, MerR family/Type I restriction‑modification system, DNA‑methyltransferase subunit M (EC 2.1.1.72) |
| ? | 1 | 755555 = | 0 (0.000) | intergenic (+178/‑121) | unknown/unknown | Transcriptional regulator, MerR family/Type I restriction‑modification system, DNA‑methyltransferase subunit M (EC 2.1.1.72) | |||||
GCCAAGGTAACGACTGCCCGGAATGCTCGATTTTGGAGGGCTTGAGTGAGTGAAAAGTGCGGTGATTTTTCATTGCAATTTTAAGTAGAAATATAATTAAAAAATCTCTCACGCTTATCTTTTAAACATGCACAATTCCTATAAAATAGGTATATTTTTTTATTTACTCACTTTACAAAGGACAAATTTTATGCAGAAGCCAGAAGCCAGAAGCCAGAAGCCAGAAGCCACCAAGATTATGTTGAAAATTCAGCCACACAACAAGCCTTCCTAAACGACCTCGACGAAAAACTTTGGTCTTCCGCCGACCGTCTCCGCCAGCAACTCGACGCCGCCAACTACAAACACATTGTGCTTGGCTTAATCTTCTTAAAATACATCTCCGACAGCTTCACCGCACAGCAAGACAAAATCCGTGTCGAGCTTTCTAATCCTGAAAATCCCCTTTATCTTGACCGCACTTTTTACAACTCCGATGAAG > 1/755325‑755805 | tgcaacgttggcacgacaactgccaaggtaacgactgcccggaatgctcgattttggagggcttgagtgagtgaaaagtgcggtgatttttcattgcaattttaagtagaaatataattaaaaaatctctcatgcttatcttttaaacatgcacaattcctataaaataggtatatttttttatttactcactttacaaaggacaaattttatgcagaagccagaagccaCCAAGATTATGTTGAAAAtt > 1:605221‑M2/231‑250 (MQ=255) 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cttttaaacatgcacaattcctataaaataggtatatttttttatttactcactttacaaaggacaaattttatgcagaagccagaagccaCCAAGATTATGTTGAAAATTCAGCCACACAACAAGCCTTCCTAAACGACCTCGACGAAAAACTTTGGTCTTCCGCCGACCGTCTCCGCCAGCAACTCGACGCCGCCAACTACAAACACATTGTGCTTGGCTTAATCTTCTTAAAATACATCTCCGACAg > 1:71908‑M2/92‑250 (MQ=255) cttttaaacatgcacaattcctataaaataggtatatttttttatttactcactttacaaaggacaaattttatgcagaagccagaagccaCCAAGATTATGTTGAAAATTCAGCCACACAACAAGCCTTCCTAAACGACCTCGACGAAAAACTTTGGTCTTCCGCCGACCGTCTCCGCCAGCAACTCGACGCCGCCAACTACAAACACATTGTGCTTGGCTTAATCTTCTTAAAATACATCTCCGACAg > 1:215752‑M2/92‑250 (MQ=255) cttttaaacatgcacaattcctataaaataggtatatttttttatttactcactttacaaaggacaaattttatgcagaagccagaagccaCCAAGATTATGTTGAAAATTCAGCCACACAACAAGCCTTCCTAAACGACCTCGACGAAAAACTTTGGTCTTCCGCCGACCGTCTCCGCCAGCAACTCGACGCCGCCAACTACAAACACATTGTGCTTGGCTTAATCTTCTTAAAATACATCTCCGACAg > 1:152342‑M2/92‑250 (MQ=255) 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> 1:367683‑M2/25‑250 (MQ=255) attttatgcagaagccagaagccaCCAAGATTATGTTGAAAATTCAGCCACACAACAAGCCTTCCTAAACGACCTCGACGAAAAACTTTGGTCTTCCGCCGACCGTCTCCGCCAGCAACTCGACGCCGCCAACTACAAACACATTGTGCTTGGCTTAATCTTCTTAAAATACATCTCCGACAGCTTCACCGCACAGCAAGACAAAATCCGTGTCGAGCTTTCTAATCCTGAAAATCCCCTTTATCTTGAc > 1:89832‑M2/25‑250 (MQ=255) gaagccagaagccaCCAAGATTATGTTGAAAATTCAGCCACACAACAAGCCTTCCTAAACGACCTCGACGAAAAACTTTGGTCTTCCGCCGACCGTCTCCGCCAGCAACTCGACGCCGCCAACTACAAACACATTGTGCTTGGCTTAATCTTCTTAAAATACATCTCCGCCAGCTTCACCGCACAGCAAGACAAAATCCGTGTCGAGCTTTCTAATCCTGAAAATCCCCTTTATCTTGACCGCACTTTTTa > 1:447213‑M2/15‑251 (MQ=255) gaagccagaagccaCCAAGATTATGTTGAAAATTCAGCCACACAACAAGCCTTCCTAAACGACCTCGACGAAAAACTTTGGTCTTCCGCCGACCGTCTCCGCCAGCAACTCGACGCCGCCAACTACAAACACATTGTGCTTGGCTTAATCTTCTTAAAATACATCTCCGACAGCTTCACCGCACAGCAAGACAAAATCCGTGTCGAGCTTTCTAATCCTGAAAATCCCCTTTATCTTGACCGCACTTTTTa > 1:807542‑M2/15‑251 (MQ=255) 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GCCAAGGTAACGACTGCCCGGAATGCTCGATTTTGGAGGGCTTGAGTGAGTGAAAAGTGCGGTGATTTTTCATTGCAATTTTAAGTAGAAATATAATTAAAAAATCTCTCACGCTTATCTTTTAAACATGCACAATTCCTATAAAATAGGTATATTTTTTTATTTACTCACTTTACAAAGGACAAATTTTATGCAGAAGCCAGAAGCCAGAAGCCAGAAGCCAGAAGCCACCAAGATTATGTTGAAAATTCAGCCACACAACAAGCCTTCCTAAACGACCTCGACGAAAAACTTTGGTCTTCCGCCGACCGTCTCCGCCAGCAACTCGACGCCGCCAACTACAAACACATTGTGCTTGGCTTAATCTTCTTAAAATACATCTCCGACAGCTTCACCGCACAGCAAGACAAAATCCGTGTCGAGCTTTCTAATCCTGAAAATCCCCTTTATCTTGACCGCACTTTTTACAACTCCGATGAAG > 1/755325‑755805 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |