| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 954,509 | +AAT | coding (225/351 nt) | unknown → | hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 954506 | 0 (0.000) | 68 (0.790) +AAT |
52/418 | 0.4 | 100% | coding (222/351 nt) | unknown | hypothetical protein |
| ? | 1 | 954507 = | 0 (0.000) | coding (223/351 nt) | unknown | hypothetical protein | |||||
ATTATCTTACAGGGAGAATACATATGTCTGGCAGCGGTAATAGTGATTTTTCAAATAACCCGATCTTTAATAATGGTATAGGAGGCTTTGAAGGAGGTAATAGTGCGTCATCATGTGAATTACTACAAAAAAGCACTCAATTAATATCACCACAACCCAAAACTATAGAAAGCTTACTTATTGGAGATCGTTTAACTTTACAGATAAACAAACAAGAAGGATTTACATCTATTGAAGCATACAAAAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAGAAAGTATTATTGAAGGACAAGTTCAAGTATCTATCAAACATATCTGAGTCTTAATTATGTCAAATAATAAATGTATTACTGTTATTGGTGGTGTATATATTGAGCGGTGCGCTTGGCCACATTGGGATGAATTATACGGTTCTGGAGGA > 1/954262‑954737 | atcttacagggagaatacatatgtctggcagcggtaatagtgatttttcaaataacccgatctttaataatggtataggaggctttgaaggaggtaatagtgcgtcatcatgtgaattactacaaaaaagcactcaattaatatcaccacaacccaaaactatagaaagcttacttattggagatcgtttgactttacagataaacaaacaagaaggatttacatctattgaagcatacaaaaatAatgat > 1:391189‑M2/246‑251 (MQ=255)atcttacagggagaatacatatgtctggcagcggtaatagtgatttttcaaataacccgatctttaataatggtataggaggctttgaaggaggtaatagtgcgtcatcatgtgaattactacaaaaaagcactcaattaatatcaccacaacccaaaactatagaaagcttacttattggagatcgtttaactttacagataaacaaacaagaaggatttacatctattgaagcatacaaaaatAatgat > 1:448769‑M2/246‑251 (MQ=255)atcttacagggagaatacatatgtctggcagcggtaatagtgatttttcaaataacccgatctttaataatggtataggaggctttgaaggaggtaatagtgcgtcatcatgtgaattactacaaaaaagcactcaattaatatcaccacaacccaaaactatagaaagcttacttattggagatcgtttaactttacagataaacaaacaagaaggatttacatctattgaagcatacaaaaatAatgat > 1:375185‑M2/246‑251 (MQ=255) gggagaatacatatgtctggcagcggtaatagtgatttttcaaataacccgatctttaataatggtataggaggctttgaaggaggtaatagtgcgtcatcatgtgaattactacaaaaaagcactcaattaatatcaccacaacccaaaactatagaaagcttacttattggagatcgtttaactttacagataaacaaacaagaaggatttacatctattgaagcatacaaaaatAATGATGATagag > 1:612873‑M2/238‑250 (MQ=255) 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attgaagcatacaaaaatAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAGAAAGTATTATTGAAGGACAAGTTCAAGTATCTATCAAACATATCTGAGTCTTAATTATGTCAAATAATAAATGTATTACTGTTATTGGTGGTGTATATATTGAGCGGTGCGCTTGGCCACATTGGGATGAATTATAc < 1:765811‑M2/219‑1 (MQ=255) attgaagcatacaaaaatAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACT‑CTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAat > 1:838630‑M2/19‑84 (MQ=255) agcatacaaaaatAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTa < 1:482742‑M2/76‑1 (MQ=255) caaaaatAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAGAAAGTATTATTGAAGGACAAGTTCAAGTATCTATCAAACATATCTGAGTCTTAAtt > 1:88206‑M2/8‑145 (MQ=255) caaaaatAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAGAAAGTATTATTGAAGGACAAGTTCAAGTATCTATCAAACATATCTGAGTCTTAATTATGTCAAATAATAAATGTATTACTGTTATTGGTGGTGTATATATTGAGCGGTGCGCTTGGCCACATTGGGATGAATTATACGGTTCTggagga > 1:617898‑M2/8‑238 (MQ=255) aaTGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAGAAAGTATTATTGAAGGACAAGTTCAAGTATCTATCAAACATATCTGAGTCTTAATTATGTCAAATAATAAATGTATTAc > 1:88453/1‑161 (MQ=255) | ATTATCTTACAGGGAGAATACATATGTCTGGCAGCGGTAATAGTGATTTTTCAAATAACCCGATCTTTAATAATGGTATAGGAGGCTTTGAAGGAGGTAATAGTGCGTCATCATGTGAATTACTACAAAAAAGCACTCAATTAATATCACCACAACCCAAAACTATAGAAAGCTTACTTATTGGAGATCGTTTAACTTTACAGATAAACAAACAAGAAGGATTTACATCTATTGAAGCATACAAAAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAGAAAGTATTATTGAAGGACAAGTTCAAGTATCTATCAAACATATCTGAGTCTTAATTATGTCAAATAATAAATGTATTACTGTTATTGGTGGTGTATATATTGAGCGGTGCGCTTGGCCACATTGGGATGAATTATACGGTTCTGGAGGA > 1/954262‑954737 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |