| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 584,828 | +AGTCC | intergenic (+76/‑78) | unknown → / → unknown | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport/Lactoylglutathione lyase (EC 4.4.1.5) |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 584828 | 0 (0.000) | 76 (0.890) +AGTCC |
57/420 | 0.3 | 100% | intergenic (+76/‑78) | unknown/unknown | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport/Lactoylglutathione lyase (EC 4.4.1.5) |
| ? | 1 | 584829 = | 0 (0.000) | intergenic (+77/‑77) | unknown/unknown | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport/Lactoylglutathione lyase (EC 4.4.1.5) | |||||
GTGAACGATTTCTACGTCACATGGAAACCGGTTGAAAACATCAACGTTAACTTGGCGTTAAATAATGCGTTTAATAAATATTATCGCAGCCACAGCCAACGTGCAGGTGTTTCCACCCTACCCGAACCGGGTCGCGATGTTCGCTTAAATGTCAATTACACCTTCTAAGCCATAAAAGTGCGGTGGGTTTTCACCGTGTTTCTATGATGCGTCATATTCAAAAAGGATTAAGCCTAAGCTGCTTTTTTTATTTTCTCCAAACAAATGCCCTCATTCTGTGGCATAATTGGCGCAGTTTTTAGTTATGTGAGGGAGAATACCATGCGAATTTTACACACCATGTTACGCGTCGGCGATTTACAACGTTCCATTCGATTTTATCAAGATGTGTTGGGTATGCGTTTATTGCGCACCGGCGAAAATCCCGAATACAAATATTCTCTGGCATTTTTAGGTTACGACGATGAAGACAAAACCTCCGTGTTGGAACTGA > 1/584585‑585077 | cgatttctacgtcacatggaaaccggttgaaaacatcaacgttaacttggcgttaaataatgcgtttaataaatattatcgcagccacagccaacgtgcaggtgtttccaccctacccgaaccgggtcgcgatgttcgcttaaatgtcaattacaccttctaagccataaaagtgcggtgggttttcaccgtgtttctatgatgcgtcatattcaaaaaggattaagcctaagctgcttagtccTTTTTAt > 1:264053‑M2/245‑251 (MQ=255) 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GTGAACGATTTCTACGTCACATGGAAACCGGTTGAAAACATCAACGTTAACTTGGCGTTAAATAATGCGTTTAATAAATATTATCGCAGCCACAGCCAACGTGCAGGTGTTTCCACCCTACCCGAACCGGGTCGCGATGTTCGCTTAAATGTCAATTACACCTTCTAAGCCATAAAAGTGCGGTGGGTTTTCACCGTGTTTCTATGATGCGTCATATTCAAAAAGGATTAAGCCTAAGCTGCTTTTTTTATTTTCTCCAAACAAATGCCCTCATTCTGTGGCATAATTGGCGCAGTTTTTAGTTATGTGAGGGAGAATACCATGCGAATTTTACACACCATGTTACGCGTCGGCGATTTACAACGTTCCATTCGATTTTATCAAGATGTGTTGGGTATGCGTTTATTGCGCACCGGCGAAAATCCCGAATACAAATATTCTCTGGCATTTTTAGGTTACGACGATGAAGACAAAACCTCCGTGTTGGAACTGA > 1/584585‑585077 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |