| New junction evidence | |||||||||||
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TCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTCATAGTCTTTAACAACCCTTACAGACCTAAAGTCTGGG > 1/221890‑222339 | tCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCCCCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCtctttctctttatc < 1:314135/251‑1 (MQ=18)tCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCtctttctctttatc < 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ccTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTCATAGt < 1:677067/250‑1 (MQ=255) aCCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTCATAGTCTTTaac < 1:301862/251‑1 (MQ=255) aCCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTCATAGTCTTTaac < 1:651197/251‑1 (MQ=255) aCCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTCATAGTCTTTaac < 1:610342/251‑1 (MQ=255) aCTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTCATAGTCTTTAACAAcc < 1:275898/251‑1 (MQ=255) cttccttcCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTCATAGTCTTTAACAAcc > 1:735205/1‑250 (MQ=255) cAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTCATAGt < 1:803246/228‑1 (MQ=255) cTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACgtg > 1:655704/1‑174 (MQ=255) cTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTCATAGTCTTTAACAACCCTTACAGACCTAAAg > 1:151547/1‑251 (MQ=255) cccTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGtt > 1:642874/1‑174 (MQ=255) ctcCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAacac < 1:191165/94‑1 (MQ=255) ctcCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTCATAGTCTTTaac > 1:756384/1‑226 (MQ=255) ctcCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTCATAGTCTTTAACAACCCTTACAGACCTAAAGTCTggg > 1:657456/1‑251 (MQ=255) gAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTCAt < 1:210908/211‑1 (MQ=255) ttctctttctctttctctttctctTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTacac > 1:384645/1‑173 (MQ=33) ttctctttctctttctctttctctTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATAAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTacac > 1:324950/1‑173 (MQ=18) | TCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTCATAGTCTTTAACAACCCTTACAGACCTAAAGTCTGGG > 1/221890‑222339 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |