| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 3 | = 2032 | 0 (0.000) | 57 (1.550) | 37/430 | 0.0 | 100% | intergenic (+2/–) | unknown/– | Type II secretory pathway, component PulD/– |
| ? | 6 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
CCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGCGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 3/1785‑2032‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTA‑TTTTCCGCTTGC‑GGAAAATGCAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAATAATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTGTTGCGCGCTGATGATTTTAATCGAG > 6/1‑148 CCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGAC < 1:608949/251‑1CCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGAC < 1:800716/251‑1CCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGAC < 1:376424/251‑1 GATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGAC < 1:371293/246‑1 ATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATAT < 1:123915/251‑1 ATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATAT < 1:265297/251‑1 AAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTG < 1:411575/251‑1 GCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGAT > 1:831889/1‑243 CGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTG > 1:847688/1‑247 ATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGAC > 1:786945/1‑232 ATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGAC > 1:207262/1‑232 ATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTG < 1:9866/251‑1 CTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATTGTG > 1:208128/1‑216 CTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGAC > 1:210037/1‑206 ATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTA‑TTTTtga > 1:897988/1‑248 ATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTC < 1:735103/238‑1 ATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTA‑TTTTtgagcaag > 1:47361/1‑243 GACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTA‑TTTTtgagcaagctcaaaaatg > 1:631333/1‑233 GACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTA < 1:645917/225‑1 GACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGAC < 1:356024/189‑1 GGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAATAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTA‑TTTTtgagcaagctcaaaaatgtag > 1:92644/1‑230 GGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGAC > 1:126598/1‑186 GATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTA‑TTTTtgagcaagctcaaaaatgtagg > 1:60513/1‑229 GATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTG > 1:710266/1‑195 TACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTAC > 1:740583/1‑200 TACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTG < 1:573317/193‑1 ACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAAc < 1:828510/251‑2 ACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTCTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAAc < 1:639394/251‑2 CACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAAcc < 1:119271/251‑3 ACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAAcca < 1:283417/251‑4 CTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGAC < 1:700016/158‑1 TAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTC < 1:21991/251‑1 AAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAAc > 1:882242/1‑241 ACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATG < 1:871823/251‑1 CGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGT < 1:796521/251‑1 CGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTA < 1:624089/251‑1 GTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGG > 1:315815/1‑250 TCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCA > 1:321878/1‑251 TCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGC < 1:251811/250‑1 TCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGT < 1:92661/241‑1 TCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATAT > 1:119379/1‑145 GATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTT > 1:791560/1‑250 GATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGA < 1:472060/145‑1 ATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTA > 1:18069/1‑251 ATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACT < 1:595573/163‑1 TAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAGCCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTT < 1:721810/251‑1 GTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTG > 1:645560/1‑137 GTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAG < 1:602292/133‑1 ATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGtacctaaatt > 1:212832/1‑241 TGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGtacctaaatttaa > 1:137407/1‑238 TGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGtacc < 1:57031/242‑5 GTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGtacctaaatttaatcgag > 1:717953/1‑233 GTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGtacctaaatttaatcgag > 1:322230/1‑233 GTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGtacctaaat < 1:275550/242‑10 AAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAAc > 1:587545/1‑173 gtGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAAC < 1:181126/103‑1 TACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTA > 1:847470/1‑49 CCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGCGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 3/1785‑2032‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTA‑TTTTCCGCTTGC‑GGAAAATGCAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAATAATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTGTTGCGCGCTGATGATTTTAATCGAG > 6/1‑148 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |