| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP028101 | 1027344 = | 137 (0.760) | 4 (0.020) | 3/424 | 3.8 | 3.4% | coding (151/810 nt) | C7Y58_04985 | class I SAM‑dependent methyltransferase |
| ? | CP028101 | 1027705 = | 93 (0.540) | coding (10/402 nt) | C7Y58_04990 | DUF1311 domain‑containing protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
CTCTATCATTTTCTTTAAAAAGTAATTTTCTATTTTCCATAACTTCTGGCAAATCAAGATTATACCAAGTTATTTTTCCATTATCTACTCTTTCAAATCTAGTATCAAGCCCACAACCTATTGAGACTATTGTACAATCTGGATATTTTTCTATAAATTTTTTAACTTCTTCATCCATTATATATGCTCTTGCTAATACTCCATAATAACTAGCCCAAGCAGTATCAAATTTTTTAAAATCATAATCTAATTGTGAAGCAATTTCAAAAGATTTCTTATCATGTAACACTGATTTAGGACTTTTATAATCTTTAGCTCTTGCATTTAATGTTATAAGTAATGTTTCTGCTACTCCATCTAATTTAATTTTCATAAAACCCTCCAATATAATTAAGTTATAATATTAAGTTTATATTATTATTATACTCCTTATAAAAAAATATTTCTATATAAAAGTT > CP028101/1027110‑1027567 | ctATCATTTTCTTTAAAAAGTAATTTTCTATTTTCCATAACTTCTGTCAAATCAAGATTATACCAAGTTATTTTTCCATTATCTACTCTTTCAAATCTAGTATCAAGCCCACAACCTATTGAGACTATTGTACAATCTGGATATTTTTCTATAAATTTTTTAACTTCTTCATCCATTATATATGCTCTTGCTAATACTCCATAATAACTAGCCCAAGCAGTATCAAATTTTTTAAAATCATAATCTAATtg < 1:750979/251‑1 (MQ=255) ctATCATTTTCTTTAAAAAGTAATTTTCTATTTTCCATAACTTCTGGCAAATCAAGATTATACCAAGTTATTTTTCCATTATCTACTCTTTCAAATCTAGTATCAAGCCCACAACCTATTGAGACTATTGTACAATCTGGATATTTTTCTATAAATTTTTTAACTTCTTCATCCATTATATATGCTCTTGCTAATACTCCATAATAACTAGCCCAAGCAGTATCAAATTTTTTAAAATCATAATCTAATtg < 2:85374/251‑1 (MQ=255) ctATCATTTTCTTTAAAAAGTAATTTTCTATTTTCCATAACTTCTGGCAAATCAAGATTATACCAAGTTATTTTTCCATTATCTACTCTTTCAAATCTAGTATCAAGCCCACAACCTATTGAGACTATTGTACAATCTGGATATTTTTCTATAAATTTTTTAACTTCTTCATCCATTATATATGCTCTTGCTAATACTCCATAATAACTAGCCCAAGCAGTATCAAATTTTTTAAAATCATAATCTAATtg < 2:839295/251‑1 (MQ=255) aTCATTTTCTTTAAAAAGTAATTTTCTATTTTCCATAACTTCTGGCAGATCAAGATTATACCAAGTTATTTTTCCATTATCTACTCTTTCAAATCTAGTATCAAGCCCACAACCTATTGAGACTATTGTACAATCTGGATATTTTTCTATAAATTTTTTAACTTCTTCATCCATTATATATGCTCTTGCTAATACTCCATAATAACTAGCCCAAGCAGTATCAAATTTTTTAAAATCATAATCTAATtgtg > 1:264057/1‑251 (MQ=255) aTCATTTTCTTTAAAAAGCAATTTTCTATTTTCCATAACTTCTGGCAAATCAAGATTATACCAAGTTATTTTTCCATTATCTACTCTTTCAAATCTAGTATCAAGCCCACAACCTATTGAGACTATTGTACAATCTGGATATTTTTCTATAAATTTTTTAACTTCTTCATCCATTATATATGCTCTTGCTAATACTCGATAATAACTAGCCCAAGCAGTATCAAATTTTTTAAAATCATAATCTAATtgtg > 1:663599/1‑251 (MQ=255) aTTTTCTATTTTCCATAACTACTGGCAAATCAAGATTATACCAAGTTATTTTTCCATTATCTACTCTTTCAAATCTCGTATCAAGCATACAACCTATTGAGACTATTGTACAATCTGGATATTTTTCTATAAATTTTTTACCTTCTTCATCCATTATATATGCTCTTGCTAATACTCCATAATAACTAGCCCAAGCAGTATCAAATTTTTTAAAATCATAATCTAATTGTGAAGCAATTTCAAAAGATTTc < 2:485312/251‑1 (MQ=255) ttCCATAACTTCTGGCAAATCAAGATTATACCAAGTTATTTTTCCATTATCTACTCTTTCAAATCTAGTATCAAGCCCACAACCTATTGAGACTATTGTACAATCTGGATATTTTTCTATAAATTTTTTAACTTCTTCATCCATTATATATGCTCTTGCTAATACTCCATAATAACTAGCCCAAGCAGTATCAAATTTTTTAAAATCATAATCTAATTGTGAAGCAATTTCAAAAGATTTCTTATCATGTa > 1:20159/1‑251 (MQ=255) ccATAACTTCTGGCAAATCAAGATTATACCAAGTTATTTTTCCATTATCTACTCTTTCAAATCTAGTATCAAGCCCACAACCTATTGAGACTATTGTACAATCTGGATATTTTTCTATAAATTTTTTAACTTCTTCATCCATTATATATGCTCTTGCTAATACTCCATAATAACTAGCCCAAGCAGTATCAAATTTTTTAAAATCATAATCTAATTGTGAAGCAATTTCAAAAGATTTCTTATCATGTaa > 1:381239/1‑250 (MQ=255) ccATAACTTCTGGCAAATCAAGATTATACCAAGTTATTTTTCCATTATCTACTCTTTCAAATCTAGTATCAAGCCCACAACCTATTGAGACTATTGTACAATCTGGATATTTTTCTATAAATTTTTTAACTTCTTCATCCATTATATATGCTCTTGCTAATACTCCATAATAACTAGCCCAAGCAGTATCAAATTTTTTAAAATCATAATCTAATTGTGAAGCAATTTCAAAAGATTTCTTATCATGTAac < 2:243329/251‑1 (MQ=255) aTAACTTCTGGCAAATCAAGATTATTCCAAGTTATTTTTCCATTATCTACTCTTTCAAATCTAGTATCAAGCCCACAACCTATTGAGACTATTGTACAATCTGGATATTTTTCTATAAATTTTTTAACTTCTTCATCCATTATATATGCTCTTGCTAATACTCCATAATAACTAGCCCAAGCAGTATCAAATTTTTTAAAATCATAATCTAATTGTGAAGCAATTTCAAAAGATTTCTTATCATGTAacac < 1:131542/251‑1 (MQ=255) aTAACTTCTGGCAAATCAAGATTATACCAAGTTATTTTTCCATTATCTACTCTTTCAAATCTAGTATCAAGCCCACAACCTATTGAGACTATTGTACAATCTGGATATTTTTCTATAAATTTTTTAACTTCTTCATCCATTATATATGCTCTTGCTAATACTCCATAATAACTAGCCCAAGCAGTATCAAATTTTTTAAAATCATAATCTAATTGTGAAGCAATTTCAAAAGATTTCTTATCATGTAacac < 1:506841/251‑1 (MQ=255) aTAACTTCTGGCAAATCAAGATTATACCAAGTTATTTTTCCATTATCTACTCTTTCAAATCTAGTATCAAGCCCACAACCTATTGAGACTATTGTACAATCTGGATATTTTTCTATAAATTTTTTAACTTCTTCATCCATTATATATGCTCTTGCTAATACTCCATAATAACTAGCCCAAGCAGTATCAAATTTTTTAAAATCATAATCTAATTGTGAAGCAATTTCAAAAGATTTCTTATCATGTAacac < 2:651164/251‑1 (MQ=255) aTAACTTCTGGCAAATCAAGATTATACCAAGTTATTTTTCCATTATCTACTCTTTCAAATCTAGTATCAAGCCCACAACCTATTGAGACTATTGTACAATCTGGATATTTTTCTATAAATTTTTTAAATGATGAAGAAAGGAGAGGGAGGCTTGCTAATACTCCATAATAACTAGCCCAAGCAGTATCAAATTTTTTAAAATCATAATCTAATTGTGAAGCAATTTCAAAAGATTTCTTATCATGTAacac < 1:287658/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |