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TGTCAAATAAGCTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATAT < 2:280040/251‑1 TGTCAAATAAGCTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATAT < 1:392277/251‑1 TCAAATAAGCTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTG < 2:556769/251‑1 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AAATAAGCTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAG > 1:146908/1‑251 AATAAGCTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAATATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATCTATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACCTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGA < 1:801883/251‑1 agCTATTGCTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATAT > 1:891463/3‑251 agCTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATAT > 1:12206/3‑251 agCTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGA > 1:355828/3‑247 gCTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATG > 2:508166/2‑251 CTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAGAAATATTTATGTACTCAAGAAAAGATTTCTACGAAAATGATGATATTGCTAAAAACT > 1:717144/1‑217 CTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATG < 1:591551/250‑1 CTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATG < 1:417582/250‑1 CTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATG < 2:81186/250‑1 CTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACT < 2:717144/217‑1 GTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGA < 2:424917/237‑1 TTAAGCGCAAACTTAGCAGTGAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCTCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATGTTTGAATCAAATATTACT < 1:603552/251‑1 CTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATGTTTGAATCAAATATTACTAATGGAGTAAT < 2:466755/251‑1 TAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATGTTTGAATCAAATATTACTAATGGAGTAATAG < 1:508166/251‑1 TAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATGTTTGAATCAAATATTACTAATGGAGTAATAG < 2:804396/251‑1 TAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATGTTTGAATCAAATATTACTAATGGAGTAATAG < 1:117341/251‑1 TAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCGAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACGATATTGAGAATATGTTTGAATCAAATATTACTAATGGAGTAATAG < 2:756335/251‑1 CAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATGTTTGAATCAAATATTACTAATGGAGTAATAGAG < 2:770341/250‑1 CAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATGTTTGAATCAAATATTACTAATGGAGTAATAGAG < 2:94020/250‑1 CAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATGTTTGAATCAAATATTACTAATGGAGTAATAGA < 2:449782/249‑1 AGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAg < 2:488899/187‑2 AGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATGTTTGAATCAAATATTACTAATGGAGTAATAGAGGGTTTAA > 2:286508/1‑251 AGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAA > 1:488899/1‑187 GTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAG < 2:560431/133‑1 GTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAG > 1:560431/1‑133 |||||||||| GTATACTCCATATATTAGTTTAGTTAATTCTATTTTTCCTAATGCAAAAATAGTGTTAGATAAATTTCATATTGTTAATCTTGTTAATAGAGCATTCAATCAAACTAGAATATCTATTATGAATTCTATTCAAGATGATTCATTAAAAAGAAAATTTAAACTATTCTGGAAATCATTATTAAAATATTATCCTGATCTTTGTCAAATAAACTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP028101/900966‑900717‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTGAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGCACTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATGTTTGAATCAAATATTACTAATGGAGTAATAGAGGGTTTAA < CP028101/900717‑900478 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |