| Read alignment evidence... | |||||||||||
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Only 100 of 366 total aligned reads displayed.
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1:529397/250‑1 (MQ=16) cACGTTTGGAATAGATAACCGCTGAAAGCATCTAAGCGGGAAACTAACTTCAAGATAAGTATTCTTTAAGATACCTTCGAGCCTAGGAGGTTGATAGGTTGGGGGTGTAAGTACAGCAATGTATTTAGCTGAGCAATACTAATTATCGAAGTTTTAATCTAATATCTACTATATAGTTTCAAGTGTTCAGACTTGCGCATAAGAATATTATGTGATAAAATACATATGCTTGGTGAGTATAGCTATggggg < 2:8156/251‑1 (MQ=18) cGTTTGGAATAGATAACCGCTGAAAGCATCTAAGCGGGAAACTAACTTCAAGATAAGTATTCTTTAAGATACCTTCGAGCCTAGGAGGTTGATAGGTTGGGGGTGTAAGTACAGCAATGTATTTAGCTGAGCAATACTAATTATCGAAGTTTTAATCTAATATCTACtatat > 1:245452/1‑172 (MQ=17) gTTTGGAATAGATAACCGCTGAAAGCATCTAAGCGGGAAACTAACTTCAAGATAAGTATTCTTTAAGATACCTTCGAGCCTAGGAGGTTGATAGGTTGGGGGTGTAAGTACAGCAATGTATTTAGCTGAGCAATACTAATTATCGAAGTTTTAATCTAATATCTACtatat > 2:179516/1‑171 (MQ=17) tGGAATAGATAACCGCTGAAAGCATCTAAGCGGGAAACTAACTTCAAGATAAGTATTCTTTAAGATACCTTCGAGCCTAGGAGGTTGATAGGTTGGGGGTGTAAGTACAGCAATGTATTTAGCTGAGCAATACTAATTATCGAAGTTTTAATCTAATATCTACTATATAGTTTCAAGTGTTCAGACTTGCGCATAAGAATATTATGTGATAAAATACATATGCTTGGTGAGTATAGCTATGGGGGTACAcc < 1:132866/251‑1 (MQ=18) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |