| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP028101 | = 1012900 | 96 (0.690) | coding (1397/1857 nt) | C7Y58_04950 | DUF2194 domain‑containing protein | |||||
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
CTTATCATCCTTGGAGAAGTGAAGAAGATATGGCGGCTGGAATGAATCAGTTATTGAAGTATGTAAAAAAAATGTTTGGGAAAAAGATAAAGTTATATGTATATGTTCCACCTAGTAATATTTTAAAAGAAGAAGGAAAAGCAGCTCTTGTAAAAAATTATCCTGACTTAAATACTATTTCATCTATTTTTTATGGAGATGAAAGAGGATCTTATGCTAGTGAAATAGGTAGAGATAAAACTATTCCAAAGTTATTTAATTTTCCAAGATTTTCCTCAGGTTTTTATTATGATAAAGATGATATGTGGAGTTTATTTAATGCAATAGCAATTTATGGATATTGGGCTCATTTTGTCCATCCTGATGATGTTATTTCAAATGATAGAGGTAAAGATAAAACTTGGAATGAATTAAAAAAAGAATTTGATAAGTTGATAGGAGAAGTTGAGGCAAATCATCCATATTTAGAACCAATAAGAGCTTCTGAATTGACACAAAG > CP028101/1012624‑1013122 | cttatcATCCTTGGAGAAGTGAAGAAGATATGGCGGCTGGAATGAATCAGTTATTGAAGTATGTAAAAAAAATGTTTTGGAAAAAGATAAAGTTATATGTATATGTTCCACCTAGTAATATTTTAAAAGAATAAGGAAAAGCAGCTCTTGTAAAAAATTATCCCGACTTAAATACTATTTCATCTATTTTTTATGGAGATGAAAGAGGATCTTATGCTAGTGGAATAGGTAGAGATAAAACTATTCCAAAg > 1:412996/1‑251 (MQ=255) 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(MQ=255) agagGATCTTATGCTAGTGAAATAGGTAGAGATAAAACTATTCCAAAGTTATTTAATTTTCCAAGATTTTCCTCAGGTTTTTATTATGATAAAGATGATATGTGGAGTTTATTTAATGCAATAGCAATTTATGGATATTGGGCTCATTTTGTCCATCCTGATGATGTTATTTCAAATGATAGAGGTAAAGATAAAACTTGGAATGAATTAAAAAAAGAATTTGATAAGTTGATAGGAGAAGTTGAGGCaaa > 1:141007/1‑251 (MQ=255) gATCTTATGCTAGTGAAATAGGTAGAGATAAAACTATTCCAAAGTTATTTAATTTTCCAAGATTTTCCTCagttatttaattttccaagattttcctcaggtttttattatgataaagatgatatgtggagtttatttaatgcaatagcaatttatggagattgggctgcttttgaccatcctgatgatgtaatttcaaatgataaaggtaaagataaaacttggaatgaattaaaaaaagaatttgataa < 1:542964‑M2/251‑182 (MQ=255) tCTTATGCTAGTGAAATAGGTAGAGATAAAACTATTCCAAAGTTATTTAATTTTCCAAGATTTTCCTCagttatttaattttccaagattttcctcaggtttttattatgataaagatgatatgtggagtttatttaatgaaatagcaatttatggatattgggctcattttgtccatcctgatgatgttatttcaagtgatagaggtaaagataaaacttggattgaattaaaaaaagaatttgataagt < 2:567478‑M2/251‑184 (MQ=255) 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tAGTGAAATAGGTAGAGATAAAACTATTCCAAAGTTATTTAATTTTCCAAGATTTTCCTCagttatttaattttccaagattttcctcaggtttttattatgataaagatgatatgtggagtttatttaatgcaatagcaatttatggatattgggctcattttgtccatcctgatgatgttatttcaaatgatagaggtaaagataaaacttggaatgaattaaaaaaagaatttgataagttgatagga < 2:145809‑M2/251‑192 (MQ=255) aGTGAAATAGGTAGAGATAAAACTATTCCAAAGTTATTTAATTTTCCAAGATTTTCCTCAGGTTTTTATTATGATAAAGATGATATGTGGAGTTTATTTAATGCAATAGCAATTTATGGATATTGGGCTCATTTTGTCCATCCTGATGATGTTATTTCAAATGATAGAGGTAAAGAt > 2:587144/1‑177 (MQ=255) aGTGAAACAGGTAGAGATAAAACTATTCCAAAGTTATTTAATTTTCCAAGATTTCCCTCAGGTTTTTATTATGATAAAGATGATATGTGGAGTTTATTTAATGCAATAGCAATTTATGGATATTGGGCTCATTTTGTCCATCCTGATGATGTTATTTCAAATGATAGAGGTAAAGAt < 1:587144/177‑1 (MQ=255) gAAATAGGTAGAGATAAAACTATTCCAAAGTTATTTAATTTTCCAAGATTTTCCTCAGGTTTTTATTATGATAAAGATGATATGTGGAGTTTATTTAATGCAATAGCAATTTATGGATATTGGGCTCATTTTGTCCATCCTGATGATGTTATTTCAAATGATAGAGGTAAAGATAAAACTTGGAATGAATTAAAAAAAGAATTTGATAAGTTGATAGGAGAAGTTGAGGCAAATCATCCATATTTAGAAc > 2:418555/1‑250 (MQ=255) 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CTTATCATCCTTGGAGAAGTGAAGAAGATATGGCGGCTGGAATGAATCAGTTATTGAAGTATGTAAAAAAAATGTTTGGGAAAAAGATAAAGTTATATGTATATGTTCCACCTAGTAATATTTTAAAAGAAGAAGGAAAAGCAGCTCTTGTAAAAAATTATCCTGACTTAAATACTATTTCATCTATTTTTTATGGAGATGAAAGAGGATCTTATGCTAGTGAAATAGGTAGAGATAAAACTATTCCAAAGTTATTTAATTTTCCAAGATTTTCCTCAGGTTTTTATTATGATAAAGATGATATGTGGAGTTTATTTAATGCAATAGCAATTTATGGATATTGGGCTCATTTTGTCCATCCTGATGATGTTATTTCAAATGATAGAGGTAAAGATAAAACTTGGAATGAATTAAAAAAAGAATTTGATAAGTTGATAGGAGAAGTTGAGGCAAATCATCCATATTTAGAACCAATAAGAGCTTCTGAATTGACACAAAG > CP028101/1012624‑1013122 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |