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ATATTATCCTGATCTTTGTCAAATAAGCTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGAGTTGAATGTGTAGTTAAAAAATCTTTAAGTACTAAAGAAAAGACTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGA > 1:536069/1‑251 ATCCTGATCTTTGTCAAATAAGCTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACAT > 1:89515/1‑251 ATCCTGATCTTTGTCAAATAAGCTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAA > 2:80274/1‑236 ATCCTGATCTTTGTCAAATAAGCTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAG < 1:335071/201‑1 CCTGATCTTTGTCAAATAAGCTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGTAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATAT < 1:507039/251‑1 CTGATCTTTGTCAAATAAGCTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGAT < 1:271096/223‑1 CTGATCTTTGTCAAATAAGCTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGAT > 2:271096/1‑223 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AATAAGCTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGA < 1:108848/251‑1 AATAAGCTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGA < 2:536069/251‑1 AATAAGCTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGA < 1:112467/251‑1 agCTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATAT > 2:687708/3‑251 agCTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATAT > 1:125557/3‑251 gCTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATG > 2:313193/2‑251 gCTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGA < 2:185305/245‑1 gCTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGA > 1:185305/2‑246 TATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATGTa < 2:371486/251‑2 CTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATGTTTGAAT < 1:186902/251‑1 GTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATGTTTGAATCA > 1:70301/1‑251 AGCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATGTTTGAATCAAATATTACTAAa > 2:433382/1‑250 GCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAAC < 1:283947/214‑1 GCGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAAC > 2:283947/1‑214 CGCAAACTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATGTTTGAATCAAATATTACTAAT < 2:70301/249‑1 CTTAGCAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATGTTTGAATCAAATATTACTAATGGAGTAAT < 2:125557/251‑1 CAGTAAGGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGACAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATGTTTGAATCAAATATTACTAATGGAGTAATAGAG < 1:654714/250‑1 CAGTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATGTTTGAATCAAATATTACTAATGGAGTAATAGAG < 1:343715/250‑1 GTAAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATGTTTGAATCAAATATTACTAATGGAGTAATAGAGGGT > 1:58907/1‑251 AAAGATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATGTTTGAATCAAATATTACTAATGGAGTAATAGAGGGTTT > 2:584438/1‑251 ATAAAGTGGATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTAAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGTGCTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATGTTTGAATCAAATATTACTAATGGAGTAATAGAGGGTTTAAAT < 2:556944/251‑1 |||||||||| GTATACTCCATATATTAGTTTAGTTAATTCTATTTTTCCTAATGCAAAAATAGTGTTAGATAAATTTCATATTGTTAATCTTGTTAATAGAGCATTCAATCAAACTAGAATATCTATTATGAATTCTATTCAAGATGATTCATTAAAAAGAAAATTTAAACTATTCTGGAAATCATTATTAAAATATTATCCTGATCTTTGTCAAATAAACTATTACTGTCAAAGTTTTAAGCGCAAACTTAGCAGTAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP028101/900966‑900717‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTATCTCTTAGAAAAAAGCCCTGAATTAGAAGCTAATTTTAATATATATCAAGATATTATTCAAGCAATTAGGCATAATAACTTTAAAAGATTTGAAAGTGTAGTTAAAAAATATTTAAGTACTAAAGAAAAGATTTCTAAGAAAATGATGATAGCACTAAAAACTCTTAAGAAACATATGAACTATATTGAGAATATGTTTGAATCAAATATTACTAATGGAGTAATAGAGGGTTTAAATAACAAAA < CP028101/900717‑900469 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |