| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP028101 | 1,374,796 | 0 | T | C | 31.8% | 259.7 / 72.5 | 195 | D188D (GAT→GAC) | C7Y58_06585 | segregation/condensation protein A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (77/56); new base C (0/62); total (77/118) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.91e-18 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
TGATATTTTTGAAGTTTATAAGAAATATTTTGACTCAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTAAAGAAATCTATACATACAATGATAATTACAATGATA > CP028101/1374649‑1374945 | tgatATTTTTGAAGTTTATAAGAAATATTTTGACTCAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCt < 1:1636893/150‑1 (MQ=255) gatATTTTTGAAGTTTATAAGAAATATTTTGACTCAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTg > 1:80445/1‑150 (MQ=255) tatTTTTGAAGTTTATAAGAAATATTTTGACTCAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGGTCTGtt < 1:1280025/150‑1 (MQ=255) tttttGAAGTTTATAAGAAATATTTTGACTCAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGtttt > 1:1362324/1‑150 (MQ=255) tttttGAAGTTTATAAGAAATATTTTGACTCAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGtttt > 1:2722758/1‑150 (MQ=255) ttttGAAGTTTATAAGAAATATTTTGACTCAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGttttt > 1:1322530/1‑150 (MQ=255) ttttGAAGTTTATAAGAAATATTTTGACTCAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTAttttt < 1:2103639/150‑1 (MQ=255) tttGAAGTTTATAAGAAATATTTTGACTCAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTa < 1:187633/150‑1 (MQ=255) ttGAAGTTTATAAGAAATATTTTGACTCAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAg < 1:686945/150‑1 (MQ=255) tGAAGTTTATGAGAGATATTTTGACTCAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTATTTTTAGa < 1:1198283/150‑1 (MQ=255) ggggTTTGTAAGGAATATTTTGACTCAGTTGGTATATTAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGaa > 1:2924069/4‑150 (MQ=255) tataAGAAATATTTTGACTCAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGaa < 1:441948/150‑1 (MQ=255) ataAGAAATATTTTGACTCAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGaaa > 1:2807740/1‑150 (MQ=255) taAGAAATATTTTGACTCAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGaaaa < 1:2145181/150‑1 (MQ=255) taAGAAATATTTTGACTCAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGaaaa < 1:2145178/150‑1 (MQ=255) aGAAATATTTTGACTCAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGAaaata < 1:2664307/150‑1 (MQ=255) aGAAATATTTTGACTCAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGAaaata < 1:659660/150‑1 (MQ=255) aGAAATATTTTGACTCAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGAaaata < 1:659664/150‑1 (MQ=255) aGAAATATTTTGACTCAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGAaaata < 1:3179855/150‑1 (MQ=255) gAAATATTTTGACTCAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAaaataa > 1:2553482/1‑150 (MQ=255) aaaTATTTTGACTCAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGAaaataaa < 1:1813292/150‑1 (MQ=255) aaTATTTTGACTCAGTTGATATATCGGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATGAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAATTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAaaataaat < 1:2414265/150‑1 (MQ=255) aaTATTTTGACTCAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAaaataaat > 1:2880316/1‑150 (MQ=255) cTCAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAat > 1:92000/1‑150 (MQ=255) cTCAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAat > 1:1695022/1‑150 (MQ=255) cTCAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAat > 1:664993/1‑150 (MQ=255) cAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAGTGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAatat > 1:2484161/1‑150 (MQ=255) atatatCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATAttt > 1:833683/1‑150 (MQ=255) tatCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAGAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCt > 1:1175029/1‑150 (MQ=255) aGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTCATATATATTTTCTTGGc > 1:3084297/1‑150 (MQ=255) aGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGc < 1:1614165/150‑1 (MQ=255) aGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGc < 1:3085333/150‑1 (MQ=255) gTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTAtt < 1:235323/150‑1 (MQ=255) tGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAg > 1:1967059/1‑150 (MQ=255) ggAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGa > 1:3418232/1‑150 (MQ=255) gAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGaa < 1:2847036/150‑1 (MQ=255) aaTTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAAt < 1:2833553/150‑1 (MQ=255) aaTTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGAGGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAAt < 1:3322976/150‑1 (MQ=255) aTTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAAtt < 1:1104752/150‑1 (MQ=255) ttAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATta < 1:1932960/150‑1 (MQ=255) tAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGAGGAAAGTTTATTTTAGAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATtat < 1:2045618/150‑1 (MQ=255) aaTTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATtatat > 1:3362942/1‑150 (MQ=255) aTTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATtatata < 1:630358/150‑1 (MQ=255) aTTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATtatata < 1:630353/150‑1 (MQ=255) ttAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATaaa < 1:1447691/150‑1 (MQ=255) tAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTACAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATAATTTCTTGGCTATTTCAGAATTATATAAAg > 1:2158367/1‑150 (MQ=255) tGAAACAATATGATATAAAAGAAATTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTATTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATg < 1:3132366/150‑1 (MQ=255) aaaCAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCt < 1:1249275/150‑1 (MQ=255) aCAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTaa < 1:506024/150‑1 (MQ=255) aCAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTaa > 1:1609796/1‑150 (MQ=255) aCAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTaa < 1:506031/150‑1 (MQ=255) atatGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCCGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGAt < 1:2992033/150‑1 (MQ=255) tatGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATa < 1:3411668/150‑1 (MQ=255) tatGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTATTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATa < 1:1732701/150‑1 (MQ=255) gatGATAGAAAAGGAGTTATGGACAATATATTGAGAAAAGTTTACTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATa < 1:2157319/149‑1 (MQ=255) atGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATaa < 1:3044996/150‑1 (MQ=255) atatAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAGAAATGGCCTGTAGACGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAata < 1:3391677/150‑1 (MQ=255) atatAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATACata > 1:2301844/1‑150 (MQ=255) tataAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAatat > 1:1695705/1‑150 (MQ=255) aaaaGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGa < 1:427719/150‑1 (MQ=255) ttATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGgag < 1:937393/150‑1 (MQ=255) ttATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTATTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGgag < 1:1597945/150‑1 (MQ=255) tATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGgaga < 1:252228/150‑1 (MQ=255) aTGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGgagag < 1:908607/150‑1 (MQ=255) aTGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGgagag < 1:1222662/150‑1 (MQ=255) gATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATa > 1:614003/1‑150 (MQ=255) gATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATa > 1:1522753/1‑150 (MQ=255) gATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATa < 1:2618604/150‑1 (MQ=255) aataTATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACa < 1:1038460/150‑1 (MQ=255) atatatTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACAGTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACaa < 1:619980/150‑1 (MQ=255) atatatTGATGAAAGTCTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACaa < 1:2328645/150‑1 (MQ=255) tatTAATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAAt > 1:3038540/1‑150 (MQ=255) ttGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGt > 1:135223/1‑150 (MQ=255) gatgaAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTa > 1:1574369/1‑150 (MQ=255) gatgaAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTa < 1:2547393/150‑1 (MQ=255) gatgaAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTa < 1:3071849/150‑1 (MQ=255) atgaAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTATTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTaa < 1:1043715/150‑1 (MQ=255) tgaAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTaaa < 1:1437462/150‑1 (MQ=255) gaAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTAAAg < 1:78574/150‑1 (MQ=255) gaAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTAAAg < 1:2924865/150‑1 (MQ=255) gaAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTAAAg < 1:78572/150‑1 (MQ=255) gaAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTAAAg < 1:1000244/150‑1 (MQ=255) gTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTAAAGAAAt > 1:1752612/1‑150 (MQ=255) gTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTAAAGAAAt > 1:1578904/1‑150 (MQ=255) gTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTAAAGAAAt < 1:3488134/150‑1 (MQ=255) gTTTATTCTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATACTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTAAAGAAAt > 1:2315220/1‑150 (MQ=255) tttATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTAAAGAAATc < 1:1547113/150‑1 (MQ=255) tttATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTAAAGAAATc < 1:1547115/150‑1 (MQ=255) ttttAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTAAAGAAATCtata > 1:2194774/1‑150 (MQ=255) tttAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTAAAGAAATCTatac > 1:2622201/1‑150 (MQ=255) ttAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTAAAGAAATCTataca > 1:3097897/1‑150 (MQ=255) aaaaaTGGCCTATAGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTAAAGAAATCTatacatac < 1:3256849/150‑1 (MQ=255) ggCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTAAAGAAATCTATACATACAATGAt < 1:1209672/150‑1 (MQ=255) ccTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTAAAGAAATCTATACATACAATGATaa > 1:422780/1‑150 (MQ=255) cTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTAAAGAAATCTATACATACAATGATAAt < 1:3104806/150‑1 (MQ=255) tataGATGACCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTAAAGAAATCTATACATACAATGATAAtt < 1:66893/150‑1 (MQ=255) tataGATGACCTATTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACAGTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTAAAGAAATCTATACATACAATGATAAtt < 1:2549573/150‑1 (MQ=255) gatgatCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTAAAGAAATCTATACATACAATGATAATTAcga > 1:2266888/1‑148 (MQ=255) atgatCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTAAAGAAATCTATACATACAATGATAATTACAAt < 1:3050408/150‑1 (MQ=255) tCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTAAAGAAATCTATACATACAATGATAATTACAATGATa < 1:2054997/150‑1 (MQ=255) | TGATATTTTTGAAGTTTATAAGAAATATTTTGACTCAGTTGATATATCAGAAGTGATGGAATTAAATTTAATGAAACAATATGATATAAAAGAAGTTATGGATAATATATTGATGAAAGTTTATTTTAAAAAATGGCCTATAGATGATCTGTTTTTAGAAGCTGAAAATAAATTACATTTAATATATATTTTCTTGGCTATTTTAGAATTATATAAAGATGCTAAGATAAATATTGATAATGGAGAGATAACAAAATGTTAAAGAAATCTATACATACAATGATAATTACAATGATA > CP028101/1374649‑1374945 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |