| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP028101 | 1,119,638 | 0 | G | A | 29.9% | 349.6 / 34.2 | 212 | G254E (GGA→GAA) | lysS | lysine‑‑tRNA ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (89/59); new base A (0/63); total (89/123) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.24e-19 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
AGGAGCTGCTGCAAAACCTTTTATAACTCATCATAATACTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGAAATTAATGGAACAACTGATATTGAATATGATGGAG > CP028101/1119489‑1119787 | gagCTGCTGCAAAACCTTTTATAACTCATCATAATACTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAAGaa < 1:377158/150‑1 (MQ=255) agCTGCTGCAAAACCTTTTATAACTCATCATAATACTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAat > 1:3338098/1‑150 (MQ=255) gctgctGCAAAACCTTTTATAACTCATCATAATACTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAata < 1:3410788/150‑1 (MQ=255) ctactgcAAAACCTTTTATAACTCATCATAATACTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGAAatat < 1:1018072/147‑1 (MQ=255) gctgcAAAACCTTTTATAACTCATCATAATACTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCt > 1:914004/1‑150 (MQ=255) gctgcAAAACCTTTTATAACTCATCATAATACTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCt > 1:3114664/1‑150 (MQ=255) gctgcAAAACCTTTTATAACTCATCATAATACTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCt > 1:2544430/1‑150 (MQ=255) tgcAAAACCTTTTATAACTCATCATAATACTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTAc < 1:3231258/150‑1 (MQ=255) tgcAAAACCTTTTATAACTCATCATAATACTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTAc > 1:952302/1‑150 (MQ=255) aCCTTTTATAACTCATCATAATACTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACa > 1:346801/1‑150 (MQ=255) ccTTTTATAACTCATCATAATACTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATGAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAAGAATATCTACAAGACAt < 1:2309545/150‑1 (MQ=255) tttATAACTCATCATAATACTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAAt < 1:3502779/150‑1 (MQ=255) ataACTCATCATAATACTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAACGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCt > 1:2469563/1‑150 (MQ=255) aCTCATCATAATACTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAAGAATATCTACAAGACATAATCCTGaa < 1:2029160/150‑1 (MQ=255) cTCATCATAATACTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAAt < 1:2871956/150‑1 (MQ=255) cTCATCATAATACTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAAGAATATCTACAAGACATAATCCTGAAt < 1:3066814/150‑1 (MQ=255) catcatAATACTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAAttt > 1:2656812/1‑150 (MQ=255) catcatAATACTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAAttt > 1:3408388/1‑150 (MQ=255) atcatAATACTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTa > 1:1304440/1‑150 (MQ=255) ataataCTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACaa > 1:56948/1‑150 (MQ=255) ataataCTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACaa > 1:56944/1‑150 (MQ=255) ataataCTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACaa > 1:758343/1‑150 (MQ=255) taCTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGAAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGt < 1:1686515/150‑1 (MQ=255) cTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGtcg > 1:1085472/1‑148 (MQ=255) cTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGAAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTg < 1:2983551/150‑1 (MQ=255) cTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAACAAACATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTg < 1:927188/150‑1 (MQ=255) cTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAAAAACATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTg < 1:2714660/150‑1 (MQ=255) tttAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGa > 1:2826434/1‑150 (MQ=255) tttAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGa > 1:703027/1‑150 (MQ=255) ttAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAAGAACATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGaa < 1:531812/150‑1 (MQ=255) taagtggtaatttatttTGAAGAATGGCTTTTAAATCAGATTGAAAGAAAGGAATAGTTGGGGGGTTTGAAAGAGTATATGACTTAAATAGAACTTTTAAAAATAAAGAAACATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTAAAt < 1:2576718/141‑1 (MQ=255) tAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAACAAACATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAAt < 1:779056/150‑1 (MQ=255) caaaTATGGCTTTATTTTTAAAGATAGCTCCTAAATTATATCTAAAGAAAGTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTGTAGGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACGATGGTTGAAt < 1:2576721/149‑1 (MQ=255) aaaTATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGAAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAAtt < 1:1694715/150‑1 (MQ=255) aaTATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAAGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATta < 1:1570627/150‑1 (MQ=255) atatTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATtat > 1:1403860/1‑150 (MQ=255) atatTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATtat > 1:2282795/1‑150 (MQ=255) tatTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATtata > 1:589777/1‑150 (MQ=255) atttTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAAAAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCa < 1:2789058/150‑1 (MQ=255) ttttAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATg > 1:2751853/1‑150 (MQ=255) tttAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGc > 1:3362907/1‑150 (MQ=255) tttAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGc > 1:623413/1‑150 (MQ=255) aaTAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGAAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGAttt < 1:1026373/150‑1 (MQ=255) aTAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAACAAATATCTACAAGACATAGTCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGAtttt < 1:1606507/150‑1 (MQ=255) gCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAACAAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAat < 1:1410349/150‑1 (MQ=255) gCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAAAAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAat < 1:1084584/150‑1 (MQ=255) cTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAAAAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAatg < 1:3041851/150‑1 (MQ=255) tCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAatga > 1:3281586/1‑150 (MQ=255) cTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGAAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAatgata < 1:2899745/150‑1 (MQ=255) atatTTAAAGAAGTTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGa < 1:2036321/150‑1 (MQ=255) tatTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAAGGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGAt < 1:2923994/150‑1 (MQ=255) atTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGAtt > 1:2132042/1‑150 (MQ=255) aaGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTAtgt > 1:984458/1‑150 (MQ=255) aGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGAAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTAtgtg < 1:798570/150‑1 (MQ=255) aaaTTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGaa < 1:2876880/150‑1 (MQ=255) aaTTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAg > 1:718642/1‑150 (MQ=255) aaTTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGAAACATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAg < 1:3142037/150‑1 (MQ=255) aTTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCTGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAgg < 1:215937/150‑1 (MQ=255) aTTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAACATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAgg < 1:2065640/150‑1 (MQ=255) aTTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGAAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAgg < 1:2344431/150‑1 (MQ=255) aTTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGGATATGATTTGAATAGAACTTTTAGAAATGAATAAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAgg < 1:2065642/150‑1 (MQ=255) tggtggTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGAAACATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTtc < 1:3270765/150‑1 (MQ=255) tggtggTTTTGAAAGAGTATATGACGTGAATAGAAATTTTAGAAATGAACAAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTtc < 1:3080659/150‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGAAAGAGTATATGATTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAAAAACATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTtca < 1:3255541/150‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTtca < 1:2061213/150‑1 (MQ=255) gtggtTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGAAACATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTtcat < 1:2888092/150‑1 (MQ=255) gtggtTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAAGAACATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTtcat < 1:1789856/150‑1 (MQ=255) tggtTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGGCATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTtcatc > 1:2492810/1‑150 (MQ=255) tggtTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAAGAACATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTtcatc < 1:3435769/150‑1 (MQ=255) gtTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAg > 1:2935123/1‑150 (MQ=255) gtTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGAAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAg < 1:978926/150‑1 (MQ=255) ttGAAAGAGTCTATGACTTGGATAGAAATTTTAGAAATGAAGGCATATCTGCAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTAt < 1:1896022/150‑1 (MQ=255) tGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATg > 1:3326703/1‑150 (MQ=255) aaGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAAAAACATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCa < 1:2494370/150‑1 (MQ=255) gagTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGAAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAg < 1:1208188/150‑1 (MQ=255) agTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAAAAACATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGa < 1:1598155/150‑1 (MQ=255) atatGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGAAAt < 1:501535/150‑1 (MQ=255) tatGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAAAAACATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGAAAtt < 1:2046321/150‑1 (MQ=255) tatGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATAAAAAAACATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGAAAtt < 1:2009538/150‑1 (MQ=255) gAATAGAAATTTTAGAAATGAAGAAACATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGAAATTAATGGaac < 1:1647351/150‑1 (MQ=255) aTAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGAAATTAATGGaacaa > 1:173163/1‑150 (MQ=255) aGAAATTTTAGAAATGAAGGAACATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGAAATTAATGGAACAACt < 1:1981758/150‑1 (MQ=255) aGAAATTTTAGAAATGAAGAAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGAAATTAATGGAACAACt < 1:1531219/150‑1 (MQ=255) gAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGAAATTAATGGAACAACTg > 1:1277127/1‑150 (MQ=255) aaaaTTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGAAATTAATGGAACAACTg > 1:3403750/2‑150 (MQ=255) aTTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGAAATTAATGGAACAACTGata > 1:367207/1‑150 (MQ=255) tttAGAAATGAAGAAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGAAATTAATGGAACAACTGATAtt < 1:1620941/150‑1 (MQ=255) aGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGAAATTAATGGAACAACTGATATTGaa < 1:1663563/150‑1 (MQ=255) gAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGAAATTAATGGAACAACTGATATTGAat > 1:1007420/1‑150 (MQ=255) gAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGAAATTAATGGAACAACTGATATTGAat > 1:1162247/1‑150 (MQ=255) gAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGAAATTAATGGAACAACTGATATTGAat > 1:1835642/1‑150 (MQ=255) gAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAACTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGAAATTAATGGAACAACTGATATTGAat > 1:1266057/1‑150 (MQ=255) gAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCCGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGAAATTAATGGAACAACTGATATTGAat > 1:1052948/1‑150 (MQ=255) gAAATGAAGAAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGAAATTAATGGAACAACTGATATTGAat < 1:376354/150‑1 (MQ=255) gAAATGAAGAAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGAAATTAATGGAACAACTGATATTGAat < 1:775010/150‑1 (MQ=255) gAAATGAACAAACATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGAAATTAATGGAACAACTGATATTGAat < 1:376350/150‑1 (MQ=255) aaTGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGAAATTAATGGAACAACTGATATTGAatat > 1:878723/1‑150 (MQ=255) gAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGAAATTAATGGAACAACTGATATTGAATatgat < 1:1501936/150‑1 (MQ=255) aGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGAAATTAATGGAACAACTGATATTGAATATGATgg > 1:1863416/1‑150 (MQ=255) ggAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGAAATTAATGGAACAACTGATATTGAATATGATGGa > 1:603330/1‑150 (MQ=255) | AGGAGCTGCTGCAAAACCTTTTATAACTCATCATAATACTTTAAATATTGATTTATTTTTAAGAATAGCTCCTGAATTATATTTAAAGAAATTAATAGTTGGTGGTTTTGAAAGAGTATATGACTTGAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGAATATCTACAAGACATAATCCTGAATTTACAATGGTTGAATTATATCAAGCTCATGCAGATTTTAATGATATGATGGATTTATGTGAAGGTATAATTTCATCAGTATGTCAAGAAATTAATGGAACAACTGATATTGAATATGATGGAG > CP028101/1119489‑1119787 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |