| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP028101 | 845,508 | 0 | C | T | 29.2% | 303.2 / 62.7 | 192 | A53V (GCA→GTA) | C7Y58_04180 | carbon starvation protein A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/98); new base T (55/1); total (93/99) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.27e-21 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
TTTATAGGTTCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTCTAATAGGAATGATG > CP028101/845360‑845656 | tttATAGGTTCAATTATAGCACTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCa < 1:2567334/150‑1 (MQ=255) taGGTTCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTAAAAGCATTTc > 1:3373496/1‑150 (MQ=255) aGGTTCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCt < 1:1532079/150‑1 (MQ=255) ggTTCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCtt < 1:3124869/150‑1 (MQ=255) gTTCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTAAAGGTATTTCTTa > 1:1649833/1‑150 (MQ=255) gTTCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCTAAAAGCATTTCTTa > 1:1402921/1‑150 (MQ=255) ttCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTAt < 1:1900430/150‑1 (MQ=255) ttCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTAt < 1:2663519/150‑1 (MQ=255) ttCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTAt < 1:2706059/150‑1 (MQ=255) tCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTAAGAGCATTTCTTAtt > 1:624502/1‑150 (MQ=255) agttATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAGATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCa < 1:3233780/148‑1 (MQ=255) aaTTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCa < 1:3233794/150‑1 (MQ=255) aaTTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCa < 1:3233788/150‑1 (MQ=255) aTTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCaa < 1:486621/150‑1 (MQ=255) aTTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCaa < 1:435424/150‑1 (MQ=255) gCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAGGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTAAGAGCATTTCTTATTCAATTTCtt > 1:2029580/1‑150 (MQ=255) cATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAGAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTa > 1:786416/1‑150 (MQ=255) ttGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAAc < 1:437822/150‑1 (MQ=255) cTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCt > 1:1565705/1‑150 (MQ=255) ttGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTg < 1:1908447/150‑1 (MQ=255) attttatttATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAGGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTg > 1:138100/1‑150 (MQ=255) tttatttaTGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGa < 1:535424/150‑1 (MQ=255) ttatttatGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGAc < 1:1747344/150‑1 (MQ=255) ctatttatGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGAc < 1:913473/149‑1 (MQ=255) tatttatGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGAcc < 1:1184510/150‑1 (MQ=255) atttatGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCTAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCa > 1:279422/1‑150 (MQ=255) tGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATAtt > 1:830316/1‑150 (MQ=255) tGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATAtt < 1:1225091/150‑1 (MQ=255) tGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATAtt < 1:888915/150‑1 (MQ=255) ggAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAAAGGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATAttt > 1:3453151/1‑150 (MQ=255) ggAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAGAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAATATAGCTGGAACTGGACCAATAttt > 1:2437922/1‑150 (MQ=255) aaaaTTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTAAAGGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTgg > 1:294964/1‑150 (MQ=255) aaaaTTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCTGAGAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTgg > 1:1703264/1‑150 (MQ=255) aatggggtgAAGGGGTTTGTGGTAGGGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAGAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAAGGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCGTAACATAGCTGGAACTGGACAAATATTTGGAg < 1:2138300/143‑1 (MQ=255) aaTTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAg < 1:3435488/150‑1 (MQ=255) aaTTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAg < 1:2138297/150‑1 (MQ=255) aTTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCTAAGAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGc > 1:2090138/1‑150 (MQ=255) aTTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGc > 1:2484916/1‑150 (MQ=255) tgttgAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAAAGGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGt > 1:1990965/1‑150 (MQ=255) ttgAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTg < 1:2129764/150‑1 (MQ=255) tgAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGc < 1:1107988/150‑1 (MQ=255) gAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCGGAGGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATGTTTGGAGCTGTTGCa > 1:2615024/1‑150 (MQ=255) gAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCa > 1:446778/1‑150 (MQ=255) aGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAAAGGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAgg > 1:3483035/1‑150 (MQ=255) gtTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTAAAGGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCg > 1:734790/1‑150 (MQ=255) gtTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCg < 1:1926028/150‑1 (MQ=255) ttttGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGtt > 1:1023282/1‑150 (MQ=255) ttttGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGtt > 1:97196/1‑150 (MQ=255) ttttGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAAGAGTGTTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGtt > 1:3369844/1‑150 (MQ=255) ggTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTCGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAGGAGTATTTCTTATTCAATTTCTTCACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATgg > 1:1619927/1‑150 (MQ=255) taGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCGAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTc > 1:2140417/1‑150 (MQ=255) gatctcTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTcc < 1:3072625/145‑1 (MQ=255) gatctcTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTcc < 1:2235691/145‑1 (MQ=255) cTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTGAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTg > 1:703737/1‑150 (MQ=255) cTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAAAGGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTg > 1:1431820/1‑150 (MQ=255) cTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTg > 1:1266892/1‑150 (MQ=255) cTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTg > 1:2865783/1‑150 (MQ=255) cTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTg > 1:278799/1‑150 (MQ=255) tCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCa > 1:656436/1‑150 (MQ=255) tCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCa < 1:80635/150‑1 (MQ=255) aaGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCatt < 1:147340/150‑1 (MQ=255) agagAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTGGGAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCattt > 1:1825339/1‑150 (MQ=255) gagaAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCattta < 1:2858929/150‑1 (MQ=255) gagaAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCattta < 1:2858933/150‑1 (MQ=255) aaCACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTAAGAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTg > 1:1914710/1‑150 (MQ=255) aaCACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGTATTTTTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTTCAGCTGCATTTATTTg > 1:3166650/1‑150 (MQ=255) aaCACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTg < 1:2298762/150‑1 (MQ=255) acacCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTgg < 1:1501480/150‑1 (MQ=255) cacCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGa < 1:2073308/150‑1 (MQ=255) cTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAg > 1:1230672/1‑150 (MQ=255) cAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAgtgt < 1:3093886/150‑1 (MQ=255) aaaaGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCGAAGGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGttt > 1:2741005/1‑150 (MQ=255) aGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTAAGGGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGt > 1:790415/1‑150 (MQ=255) tAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTa > 1:1023871/1‑150 (MQ=255) tAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTa < 1:1854035/150‑1 (MQ=255) gATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTGGGGGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTAttttt > 1:1075834/1‑150 (MQ=255) attgttttGACTATATGGGGATGGGTTGGCCGCAATCATTTCGTATTCAATTTCTTAACGTAGCTGGAATTGGACCAATAGTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTg < 1:3003634/144‑1 (MQ=255) aTGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTg > 1:89035/1‑150 (MQ=255) aTGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTg < 1:3400558/150‑1 (MQ=255) aTGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTg < 1:2759316/150‑1 (MQ=255) tgtTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAgg > 1:237985/1‑150 (MQ=255) gtTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAGGAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGgt > 1:2153912/1‑150 (MQ=255) gtTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGgt < 1:1771360/150‑1 (MQ=255) tGACTGTATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGgttc < 1:2312548/150‑1 (MQ=255) gACTATATGGAAATGAGTTGGTTAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGgttca > 1:2685923/1‑150 (MQ=255) gACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTTCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGgttca > 1:2510083/1‑150 (MQ=255) tataTGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGgttcagtt < 1:1134208/150‑1 (MQ=255) tGGAAATGAGTTGGCCAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATg > 1:1486017/1‑150 (MQ=255) tGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATg < 1:3244249/150‑1 (MQ=255) ggAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTCAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGa > 1:1881659/1‑150 (MQ=255) aaaTGAGTTGGTCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGAtt > 1:379097/1‑150 (MQ=255) aaTGAGTTGGCCAAAAGCATTTATTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGAttt < 1:2503055/150‑1 (MQ=255) aTGAGTTGGCCAAAAGCATCTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGAtttt < 1:2217564/150‑1 (MQ=255) tGAGTTGGCCAAAAACATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTc < 1:16196/150‑1 (MQ=255) gAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTCt < 1:604185/150‑1 (MQ=255) ggttaaaaGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTCTAATAg > 1:2702960/5‑150 (MQ=255) ccAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTCTAATAGGa > 1:2095092/1‑150 (MQ=255) aaaaGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTCTAATAGGAat < 1:2726270/150‑1 (MQ=255) acaGCACTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTCTAATAGGAatg < 1:2571306/148‑1 (MQ=255) aaaGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTCTAATAGGAatg < 1:1807816/150‑1 (MQ=255) | TTTATAGGTTCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTCTAATAGGAATGATG > CP028101/845360‑845656 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |