| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP028101 | 845,501 | 0 | C | T | 28.4% | 329.1 / 45.2 | 190 | P51S (CCA→TCA) | C7Y58_04180 | carbon starvation protein A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (40/96); new base T (54/0); total (94/96) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.04e-22 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
TGTATAGTTTTATAGGTTCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTCTAATAGGA > CP028101/845352‑845650 | tGTATAGTTTTATAGGTTCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGc < 1:1023368/150‑1 (MQ=255) gTATAGTTTTATAGGTTCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGct > 1:3535916/1‑149 (MQ=255) tataGTTTTATAGGTTCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGccc > 1:2963799/1‑149 (MQ=255) tataGTTTTATAGGTTCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCa < 1:837274/150‑1 (MQ=255) gTTTTATGGGTTCGATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAGAAGATTAGCTGAGGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAg < 1:2194033/150‑1 (MQ=255) gTTTTATAGGTTCAATTATCGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTCGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCCGATGGTGTTGACTACATGGAAATGAGTCGGTCAAAAg > 1:1178793/1‑150 (MQ=255) gTTTTATAGGTTCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAAAAg > 1:3239731/1‑150 (MQ=255) gTTTTATAGGTTCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAg < 1:2058792/150‑1 (MQ=255) taGGTTCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGccgagagtatttc > 1:3373495/1‑139 (MQ=255) taGGTTCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAGAAGCATTTc > 1:1304767/1‑150 (MQ=255) aGGTTCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCt < 1:1532079/150‑1 (MQ=255) ggTTCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCtt < 1:3124869/150‑1 (MQ=255) gTTCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTAAAGGTATTTCTTa > 1:1649833/1‑150 (MQ=255) gTTCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAAAAGTATTTCTTa > 1:1402919/1‑150 (MQ=255) ttCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTAt < 1:2706056/150‑1 (MQ=255) ttCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTAt < 1:1900429/150‑1 (MQ=255) agttATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAGATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCa < 1:3233780/148‑1 (MQ=255) aaTTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCa < 1:3233794/150‑1 (MQ=255) aaTTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCa < 1:3233788/150‑1 (MQ=255) aTTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCaa < 1:486621/150‑1 (MQ=255) aTTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCaa < 1:435424/150‑1 (MQ=255) taGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTc < 1:3410510/150‑1 (MQ=255) cATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAGAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTa > 1:786416/1‑150 (MQ=255) ttGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAAc < 1:2303953/150‑1 (MQ=255) ttGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAAc < 1:437822/150‑1 (MQ=255) ggTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACAt < 1:3383591/150‑1 (MQ=255) ggTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACAt < 1:1061254/150‑1 (MQ=255) cTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCt > 1:1565705/1‑150 (MQ=255) ttGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTg < 1:1908453/150‑1 (MQ=255) ttGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTg < 1:1908446/150‑1 (MQ=255) atatTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAAc > 1:1458333/1‑150 (MQ=255) attttatttATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTg < 1:1915708/150‑1 (MQ=255) tttatttaTGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGa < 1:535424/150‑1 (MQ=255) ttatttatGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGAc < 1:1747344/150‑1 (MQ=255) ctatttatGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGAc < 1:913473/149‑1 (MQ=255) tatttatGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGAcc < 1:1184510/150‑1 (MQ=255) atttatGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCTAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCa > 1:279422/1‑150 (MQ=255) tatGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAata > 1:692082/1‑150 (MQ=255) tGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATAtt < 1:888915/150‑1 (MQ=255) tGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATAtt < 1:1225091/150‑1 (MQ=255) ggAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCTAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATAttt > 1:3453153/1‑150 (MQ=255) aaTTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAg < 1:2138297/150‑1 (MQ=255) aaTTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAg < 1:3435490/150‑1 (MQ=255) aTTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGc > 1:812563/1‑150 (MQ=255) aTTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCTAAGAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGc > 1:2090138/1‑150 (MQ=255) tgttgAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAAAGGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGt > 1:1990965/1‑150 (MQ=255) gttgAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGtt < 1:703937/150‑1 (MQ=255) ttgAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTg < 1:2129764/150‑1 (MQ=255) gAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCa > 1:446778/1‑150 (MQ=255) aGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAAAGGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAgg > 1:3483035/1‑150 (MQ=255) aGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCCTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGCCCAATATTTGGAGCTGTTGCAgg > 1:2458235/1‑150 (MQ=255) tgtTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAACTGATGGTGTTGACTATATAGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGc < 1:2178790/150‑1 (MQ=255) ttttGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGtt > 1:1023282/1‑150 (MQ=255) ttttGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGtt > 1:97196/1‑150 (MQ=255) ttttGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAGAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGtt > 1:1116208/1‑150 (MQ=255) ttttGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAGAGTGTTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGtt > 1:2431700/1‑150 (MQ=255) ggTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTCGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAGGAGTATTTCTTATTCAATTTCTTCACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATgg > 1:1619927/1‑150 (MQ=255) gTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATggg > 1:633999/1‑150 (MQ=255) ataGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTTTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTATTGCAGGAGCGTTATgatgt > 1:2578554/1‑146 (MQ=255) taGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTGAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCATTATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTc > 1:2140415/1‑150 (MQ=255) taGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAGGAGTGTTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTc > 1:2140418/1‑150 (MQ=255) gatctcTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTcc < 1:3072625/145‑1 (MQ=255) aGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTcc < 1:2709462/150‑1 (MQ=255) cTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTg > 1:2865783/1‑150 (MQ=255) cTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTg > 1:278799/1‑150 (MQ=255) tCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGTTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCGAAGGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGATCCAGCTGCa > 1:2287667/1‑150 (MQ=255) aaGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATCGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCatt > 1:2524489/1‑150 (MQ=255) agagAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTGGGAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCattt > 1:1825339/1‑150 (MQ=255) gagaAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCattta < 1:2858933/150‑1 (MQ=255) gagaAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCattta < 1:2858929/150‑1 (MQ=255) aaCACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGTATTTTTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTTCAGCTGCATTTATTTg > 1:3166650/1‑150 (MQ=255) acacCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTgg < 1:1501480/150‑1 (MQ=255) cacCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGa < 1:2073308/150‑1 (MQ=255) cTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAg > 1:1230672/1‑150 (MQ=255) cAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTAAAGGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAgtgt > 1:196306/1‑150 (MQ=255) cAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAgtgt < 1:3093886/150‑1 (MQ=255) aaaaGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCGAAGGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGttt > 1:2741005/1‑150 (MQ=255) aGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTAAGGGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGt > 1:790415/1‑150 (MQ=255) tAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTa < 1:1083931/150‑1 (MQ=255) tAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTa < 1:1854035/150‑1 (MQ=255) attgttttGACTATATGGGGATGGGTTGGCCGCAATCATTTCGTATTCAATTTCTTAACGTAGCTGGAATTGGACCAATAGTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTg < 1:3003634/144‑1 (MQ=255) aTGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTg > 1:89035/1‑150 (MQ=255) aTGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTg < 1:2759316/150‑1 (MQ=255) tgtTGACTATATGGAAATGAGTTGGCTAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAgg > 1:237981/1‑150 (MQ=255) gtTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGgt < 1:1771360/150‑1 (MQ=255) cTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGgttcagt < 1:264694/150‑1 (MQ=255) atatGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGgttcagttc < 1:3313980/150‑1 (MQ=255) tatGGAAATGAGTTGGTTAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGgttcagttca > 1:1418630/1‑150 (MQ=255) atGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCAt < 1:760549/150‑1 (MQ=255) tGGAAATGAGTTGGCCAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATg > 1:1486017/1‑150 (MQ=255) tGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAACTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTTCAGGTTCAGTTCATg < 1:2507468/150‑1 (MQ=255) ggAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGa < 1:2021200/150‑1 (MQ=255) aaaTGAGTTGGTCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGAtt > 1:379097/1‑150 (MQ=255) aaTGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGAttt < 1:1728738/150‑1 (MQ=255) aaTGAGTTGGCCAAAAGCATTTATTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGAACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGAttt < 1:2503054/150‑1 (MQ=255) aTGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGAtttt < 1:2217565/150‑1 (MQ=255) tGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTc < 1:2676304/150‑1 (MQ=255) tGAGTTGGCCAAAAACATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTc < 1:16196/150‑1 (MQ=255) gAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTCt < 1:604185/150‑1 (MQ=255) ccAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTCTAATAGGa > 1:2095092/1‑150 (MQ=255) | TGTATAGTTTTATAGGTTCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTCTAATAGGA > CP028101/845352‑845650 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |