| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP028101 | 618,209 | 0 | C | G | 70.5% | 196.9 / inf | 265 | noncoding (2881/2928 nt) | C7Y58_03125 | 23S ribosomal RNA |
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.90e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 269 total aligned reads displayed.
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tGTATTTAGCTGAGCAATACTAATTATCGAAGTTTTAATCTAATATCTACTATATAGTTTCAAGTGTTCAGACTTGCGCATAAGAATATTATGTGATAAAATACATATGCTTGGTGAGTATAGCTATGGGGGTACACCTAGTTACATTcc < 1:2664135/150‑1 (MQ=17) tGTATTTAGCTGAGCAATACTAATTATCGAAGTTTTAATCTAATATCTACTATATAGTTTCAAGTGTTCAGACTTGCGCATAAGAATATTATGTGATAAAATACATATGCTTGGTGAGTATAGCTATGGGGGTACACCTAGTTACATTcc < 1:905751/150‑1 (MQ=17) tGTATTTAGCTGAGCAATACTAATTATCGAAGTTTTAATCTAATATCTACTATATAGTTTCAAGTGTTCAGACTTGCGCATAAGAATATTATGTGATAAAATACATATGCTTGGTGAGTATAGCTATGGGGGTACACCTAGTTACATTcc < 1:2668896/150‑1 (MQ=17) aTTTAGCTGAGCAATACTAATTATCGAAGTTTTAATCTAATATCTACTATATAGTTTCAAGTGTTCAGACTTGCGCATAAGAATATTATGTGATAAAATACATATGCTTGGTGAGTATAGCTATGGGGGTACACCTAGTTACATTCCGaa > 1:2139496/1‑150 (MQ=17) aTTTAGCTGAGCAATACTAATTATCGAAGTTTTAATCTAATATCTACTATATAGTTTCAAGTGTTCAGACTTGCGCATAAGAATATTATGTGATAAAATACATATGCTTGGTGAGTATAGCTATGGGGGTACACCTAGTTACATTCCGaa > 1:290141/1‑150 (MQ=17) 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aGCTGAGCAATACTAATTATCGAAGTTTTAATCTAATATCTACTATATAGTTTCAAGTGTTCAGACTTGCGCATAAGAATATTATGTGATAAAATACATATGCTTGGTGAGTATAGCTATGGGGGTACACCTAGTTACATTCCGAACCTa > 1:1371826/1‑150 (MQ=17) cTGAGCAATACTAATTATCGAAGTTTTAATCTAATATCTACTATATAGTTTCAAGTGTTCAGACTTGCGCATAAGAATATTATGTGATAAAATACATATGCTTGGTGAGTATAGCTATGGGGGTACACCTAGTTACATTCCGAACCTAGa < 1:1022421/150‑1 (MQ=17) | TGGCACAGCTGGGTAGTCACGTTTGGAATAGATAACCGCTGAAAGCATCTAAGCGGGAAACTAACTTCAAGATAAGTATTCTTTAAGATACCTTCGAGCCTAGGAGGTTGATAGGTTGGGGGTGTAAGTACAGCAATGTATTTAGCTGACCAATACTAATTATCGAAGTTTTAATCTAATATCTACTATATAGTTTCAAGTGTTCAGACTTGCGCATAAGAATATTATGTGATAAAATACATATGCTTGGTGAGTATAGCTATGGGGGTACACCTAGTTACATTCCGAACCTAGA > CP028101/618060‑618354 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |