| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP028101 | 345,348 | 0 | A | G | 33.1% | 366.0 / 139.6 | 308 | intergenic (‑2/+33) | C7Y58_01810/C7Y58_01815 | ethanolamine utilization microcompartment protein EutM/ethanolamine utilization protein EutM |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (69/137); new base G (102/0); total (171/137) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.86e-35 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 310 total aligned reads displayed.
CTCTTACCATAACAGTTACTAATCCTCCACCTACAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTAAAGATTCTTCTTGTA > CP028101/345199‑345493 | ccATAACAGTTACTAATCCTCCACCTACAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCGTTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATGTTCa > 1:2463989/1‑150 (MQ=255) ccATAACAGTTACTAATCCTCCACCTACAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCa < 1:3058637/150‑1 (MQ=255) tAACAGTTACTAATCCTCCACCTACAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCAtct < 1:334025/150‑1 (MQ=255) gTTACTAATCCTCCACCTACAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGATATAGTGTTCATCTCTCCt > 1:1774955/1‑150 (MQ=255) tAATCCTCCACCTACAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACGTAGTGTTCATCTCTCCTTttta > 1:328842/1‑150 (MQ=255) aCAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAAttttt < 1:189156/150‑1 (MQ=255) aaGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAAttttttt < 1:545059/150‑1 (MQ=255) tttCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGATATGGTGTTTATATCTCCTTTTTAATTTAAAATttttttattttt > 1:1761674/1‑150 (MQ=255) cccTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACGTAGTGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTtttttattttttat > 1:557058/1‑150 (MQ=255) cccTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAGTTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTtttttattttttat > 1:2482427/1‑150 (MQ=255) cTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTtttattttttattt < 1:2852172/150‑1 (MQ=255) cAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCCACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAGTTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTattttttatttttt > 1:1524658/1‑150 (MQ=255) attgtTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGt < 1:3316978/148‑1 (MQ=255) gtgtTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGATGTAGGTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGtt > 1:2886416/1‑150 (MQ=255) gtgtTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGATATAGTGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGtt > 1:344415/1‑150 (MQ=255) gtTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGATGTAGGCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGtttt > 1:1735284/1‑150 (MQ=255) tACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGtttttt < 1:357978/150‑1 (MQ=255) aTTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTtttttat > 1:1405998/1‑150 (MQ=255) tttGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTCAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTtttttatt > 1:3395770/1‑150 (MQ=255) tgctgcCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTtttttatttt < 1:2187643/150‑1 (MQ=255) gctgcCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACGTAATGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTtttttattttt > 1:410914/1‑150 (MQ=255) gctgcCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTtttttattttt < 1:715345/150‑1 (MQ=255) cTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACGTAATTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTaa > 1:1437797/1‑150 (MQ=255) cTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTaa > 1:2219838/1‑150 (MQ=255) ccATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACtttt < 1:690002/150‑1 (MQ=255) cATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTa < 1:2065585/150‑1 (MQ=255) aTAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTGATGCATTTAATGTTGGCATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTaa < 1:2256636/150‑1 (MQ=255) aTCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATGATGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGAttt > 1:442708/1‑150 (MQ=255) tCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTc < 1:3257368/150‑1 (MQ=255) tCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTc < 1:868309/150‑1 (MQ=255) ctgctgCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCa < 1:798396/150‑1 (MQ=255) tgctgcTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGATATGATTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGAttttat > 1:2993067/1‑147 (MQ=255) tgctTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGAGATAGTGTTTATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGa > 1:1016837/1‑150 (MQ=255) ctTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGAtt < 1:3358813/150‑1 (MQ=255) ttCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGAttt < 1:260402/150‑1 (MQ=255) aCTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATttcttc < 1:1252168/150‑1 (MQ=255) ctgctgCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCa < 1:1600752/150‑1 (MQ=255) tgctACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAAttt > 1:813711/1‑150 (MQ=255) tgctACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAAttt > 1:2297339/1‑150 (MQ=255) gctACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAGTTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATttc > 1:2807655/1‑150 (MQ=255) gctACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATttc < 1:1715706/150‑1 (MQ=255) ctactaATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATttct < 1:2936259/150‑1 (MQ=255) ctaATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAGTATTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTTTTCGATttcttct > 1:1987938/1‑150 (MQ=255) ctaATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATttcttct < 1:2629677/150‑1 (MQ=255) taATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTCTTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATttcttctt > 1:1519852/1‑150 (MQ=255) actcccttAGTTTCTATCCTTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATttcttcttc < 1:2559744/144‑1 (MQ=255) aaTCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATttcttcttc < 1:2074313/150‑1 (MQ=255) aaTCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATttcttcttc < 1:2694550/150‑1 (MQ=255) aaTCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATttcttcttc < 1:1589167/150‑1 (MQ=255) aTCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTtcttcttct < 1:1420245/150‑1 (MQ=255) cTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATGGTTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCtata > 1:2200096/1‑150 (MQ=255) cTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACCTTTCATATCTCATTGATTTCTTCACTttctctttttccc > 1:2569884/1‑141 (MQ=255) cTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCtata > 1:947827/1‑150 (MQ=255) tttAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAGTTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTatat > 1:2816987/1‑150 (MQ=255) tttAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTatat > 1:107003/1‑150 (MQ=255) ttattttCTATCGTTCCGAATGCGTTTAATGTTGACATAATCTTCGTCTCTCCTTTTTAATGTAAACTTTTTTGATTTTTTATTTTTTGTTTTTTGATTTTGACGAACTTTTAAGATTTTATTGATTTCGTCAGTTTTTTCTTCTATAtt < 1:1289145/146‑1 (MQ=255) tAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACGTAGTTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGGTTTCTTCAATTTCTTCTTCTATAttt > 1:675697/1‑150 (MQ=255) aGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATAtttt < 1:9073/150‑1 (MQ=255) tttCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAGTGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATAtttttt > 1:202078/1‑150 (MQ=255) tttCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATAtttttt > 1:226470/1‑150 (MQ=255) tttCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATAtttttt < 1:1646484/150‑1 (MQ=255) tttCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATAtttttt < 1:320371/150‑1 (MQ=255) ttCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACGTAGTGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTa > 1:3464191/1‑150 (MQ=255) ttCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATGATGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTa > 1:1448960/1‑150 (MQ=255) ttCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTTTTCAATTTCTTCTTCTATAttttttc > 1:3349708/1‑149 (MQ=255) ttCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTa < 1:976590/150‑1 (MQ=255) ttCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTAACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTa < 1:2155073/150‑1 (MQ=255) tCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTaa < 1:1624929/150‑1 (MQ=255) cTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAAt < 1:2560561/150‑1 (MQ=255) cTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAAt < 1:2121635/150‑1 (MQ=255) tATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGATGTAATGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAAtt > 1:106309/1‑150 (MQ=255) tATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGATATAGTCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAAtt > 1:315411/1‑150 (MQ=255) aTCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTc < 1:3359674/150‑1 (MQ=255) cATTCCTAATGCATTTAATGTTGACGTAGTTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAg > 1:1800452/1‑150 (MQ=255) cATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAg > 1:1562063/1‑150 (MQ=255) cATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAg < 1:2049421/150‑1 (MQ=255) aTTCCTAATGCATTTAATGTTGATATAATGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGt > 1:1173116/1‑150 (MQ=255) aTTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAGTGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTTTTCTATATTTTTTAATTCAGt > 1:3111017/1‑150 (MQ=255) aTTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGt > 1:2971300/1‑150 (MQ=255) ccTAATGCATTTAATGTTGACATAATGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACt > 1:1900715/1‑150 (MQ=255) tAATGCATTTAATGTTGACATAGTTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCCACTCCTTTTTCTCTATTTTTTCATTCAGTAcctt > 1:2099504/1‑147 (MQ=255) aTGCATTTAATGTTGATATAATTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCt > 1:1745340/1‑150 (MQ=255) aTGCATTTAATGTTGACATGGTTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCt > 1:1639670/1‑150 (MQ=255) tGCATTTAATGTTGACATAGTTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTa > 1:755165/1‑150 (MQ=255) tGCATTTAATGTTGACATAGTGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTa > 1:1517361/1‑150 (MQ=255) cATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTaaa < 1:241689/150‑1 (MQ=255) cATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTaaa < 1:1447990/150‑1 (MQ=255) aTTTAATGTTGACATAATTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTAAAg > 1:2315130/1‑150 (MQ=255) tttAATGTTGACATAGTTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTAAAGa > 1:1199534/1‑150 (MQ=255) aaTGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTAAAGAttc < 1:2409292/150‑1 (MQ=255) tGTTGACATAGTGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTTTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTAAAGAttctt > 1:1033263/1‑150 (MQ=255) gTTGACATAATTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTAAAGAttcttc > 1:1331105/1‑150 (MQ=255) gTTGACATAATGTCCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTAAAGAttcctc > 1:1760473/1‑147 (MQ=255) ttGACATAATTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTAAAGATtcttct > 1:1104806/1‑150 (MQ=255) gACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCACTTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTAAAGATTCTTCTTg > 1:497336/1‑150 (MQ=255) gACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTAAAGATTCTTCTTg < 1:594199/150‑1 (MQ=255) gACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTAAAGATTCTTCTTg < 1:1278613/150‑1 (MQ=255) cATAATTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTAAAGATTCTTCTTGTa > 1:2750576/1‑150 (MQ=255) cATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTTTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTAAAGATTCTTCTTGTa < 1:2962189/150‑1 (MQ=255) cATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTAAAGATTCTTCTTGTa < 1:1870833/150‑1 (MQ=255) | CTCTTACCATAACAGTTACTAATCCTCCACCTACAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTAAAGATTCTTCTTGTA > CP028101/345199‑345493 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |