| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP028101 | = 1727048 | 222 (0.960) | 4 (0.020) | 3/282 | 16.5 | 1.9% | coding (183/1101 nt) | yqeH | ribosome biogenesis GTPase YqeH |
| ? | CP028101 | = 1727052 | 212 (0.970) | coding (187/1101 nt) | yqeH | ribosome biogenesis GTPase YqeH | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
TACAAAACACTGATAAAAATTTACAAGGATATACTCCTAAACCTATTAATACTAAGGAAGATATGTATTGTCAAAGATGTTTCCAATTAAAGCATTATGGAAAATATTCTGTTAATAAAATGACAAGAGAGGATTATAAAAAAGAAGTTGGAAAACTTCTTGATGATGTTAAACTTGTTATTGCAGTATTTGACATTATAGACTTTGAAGGTTCGTTTGATGTTGAAATTTTAGATATTTTAAGAGAAAAAGATTCAATAGTTATAGTCAATAAATTAGATTTAATTCCTGATGAAAA > CP028101/1726900‑1727197 | cAAAACACTGATAAAAATTTACAAGGATATACTCCTAAACCTATTAATACTAAGGAAGATATGTATTGTCAAAGATGTTTCCAATTAAAGCATTATGGAAAATATTCTGTTAATAAAATGACAAGAGAGAATTATAAAAAAGAAGTTGGa > 1:2254099/1‑150 (MQ=255) aaaaCACTGATAAAAATTTACAAGGATATACTCCTAAACCTATTAATACTAAGGAAGATATGTATTGTCAAAGATGTTTCCAATTAAAGCATTATGGAAAATATTCTGTTAATAAAATGACAAGAGAGGATTATAAAAAAGGAGTTGGaa > 1:1145196/1‑150 (MQ=255) aaaaCACTGATAAAAATTTACAAGGATATACTCCTAAACCTATTAATACTAAGGAAGATATGTATTGTCAAAGATGTTTCCAATTAAAGCATTATGGAAAATATTCTGTTAATAAAATGACAAGAGAGGATTATAAAAAAGAAGTTGGaa > 1:320756/1‑150 (MQ=255) 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gATAAAAATTTACAAGGATATACTCCTAAACCTATTAATACTAAGGAAGATATGTATTGTCAAAGATGTTTCCAATTAAAGCATTATGGAAAATATTCTGTTAATAAAATGACAAGAGAGGATTATAAAAAAGAAGTTGGAAAActtctt < 1:301270/150‑1 (MQ=255) aTAAAAATTTACAAGGATATACTCCTAAACCTATTAATACTAAGGAAGATATGTATTGTCAAAGATGTTTCCAATTAAAGCATTATGGAAAATATTCTGTTAATAAAATGACAAGAGAGGATTATAAAAAAGAAGTTGGAAAACTTCTtg > 1:954003/1‑150 (MQ=255) tAAAAATTTACAAGGATATACTCCTAAACCTATTAATACTAAGGAAGATATGTATTGTCAAAGATGTTTCCAATTAAAGCATTATGGAAAATATTCTGTTAATAAAATGACAAGAGAGGATTATAAAAAAGAAGTTGGAAAACTTCTtga > 1:570297/1‑150 (MQ=255) aaaaaTTTACAAGGATATACTCCTAAACCTATTAATACTAAGGAAGATATGTATTGTCAAAGATGTTTCCAATTAAAGCATTATGGAAAATATTCTGTTAATAAAATGACAAGAGAGGATTATAAAAAAGAAGTTGGAAAACTTCTtgat < 1:688071/150‑1 (MQ=255) aaaaTTTACAAGGATATACTCCTAAACCTATTAATACTAAGGAAGATATGTATTGTCAAAGATGTTTCCAATTAAAGCATTATGGAAAATATTCTGTTAATAAAATGACAAGAGAGGATTATAAAAAAGAAGTTGGAAAACTTCTtgatg < 1:2969309/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |