| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP028101 | = 336796 | NA (NA) | 279 (1.240) +TTTT |
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| ? | CP028101 | = 534770 | 0 (0.000) | noncoding (26/1558 nt) | C7Y58_02725 | 16S ribosomal RNA | |||||
Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
TAGCTGTGAGGCAAGTTCTTTACGCGTTACTCACCCGTCCGCCACCCAAATCGAAGTTAAAAAACCCAAATTCAAGTAGACTTGCATGTGTTAAGCATTCTGTCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTTCGTTCAATCTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP028101/336648‑336796‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATATTAACATTATTCCTAGTTTTTGTCAACAATATTTTTTTATTTTT < CP028101/534770‑534623 |||| TAGCTGTGAGGCAAGTTCTTTACGCGTTACTCACCCGTCCGCCACCCAAATCGAAGTTAAAAAACCCAAATTCAAGTAGACTTGCATGTGTTAAGCATTCTGTCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTTCGTTCAATCTTTTTT < 1:980137/150‑1TAGCTGTGAGGCAAATTCTTTACGCGTTACTCACCCGTCCGCCACCCAAATCGAAGTTAAAAAACCCAAATTCAAGTAGACTTGCATGTGTTAAGCATTCTGTCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAGACTCTTCGTTCAATCTTTTTT < 1:546272/150‑1 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> 1:1825958/1‑150 TCTTCGTTCAATCTTTTTTTT‑ATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATATTAACAGTATTCCTAGTTTTTGTCA > 1:2057194/1‑150 GTTCAATCTTTTTTTT‑ATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATCTTAACATTATTCCTAGTTTTTGTCAACAAT > 1:2426994/1‑150 GTTCAATCTTTTTTTT‑ATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATATTAACATTATTCCTAGTTTTTGTCAACAAT > 1:1621375/1‑150 TCAATCTTTTTTTT‑ATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATATTAACATTATTCCTAGTTTCTGCCAACAATAT > 1:2261062/1‑150 atcTTTTTTTTATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTTCTTGTCACATTGACATCAATTATATTAACATTATTCCTAGTTTTTGTCAACAATATTTT > 1:2204087/4‑150 cTTTTTTTTATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATATTAACATTATTCCTAGTTTTTGTCAACAATATTTTTT > 1:2672660/2‑150 cTTTTTTTTATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATATTAACATTATTCCTAGTTTTTGTCAACAATATTTTTT > 1:1401257/2‑150 cTTTTTTTTATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATATTAACATTATTCCTAGTTTTTGTCAACAATATTTTTT > 1:2316481/2‑150 TTTTTTTTATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATATTAACATTATTCCTAGTTTTTGTCAACAATATTTTTTT < 1:2305387/150‑1 TTTTTTTTATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATATTAACATTATTCCTAGTTTTTGTCAACAATATTTTTTT < 1:927937/150‑1 TTATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATATTAACATTATTCCTAGTTTTTGTCAACAATATTTTTTTATTTTT > 1:2718403/1‑150 |||| TAGCTGTGAGGCAAGTTCTTTACGCGTTACTCACCCGTCCGCCACCCAAATCGAAGTTAAAAAACCCAAATTCAAGTAGACTTGCATGTGTTAAGCATTCTGTCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTTCGTTCAATCTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP028101/336648‑336796‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATATTAACATTATTCCTAGTTTTTGTCAACAATATTTTTTTATTTTT < CP028101/534770‑534623 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |