Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	CP028101	875,381	A→G	K85E (AAA→GAA)	C7Y58_04335 →	autotransporter domain‑containing protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	CP028101	875,381	0	A	G	100.0%	85.6 / NA	39	K85E (AAA→GAA)	C7Y58_04335	autotransporter domain‑containing protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (22/17);  total (22/17)

GCAGAAAACTCAAAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGGAGATAA  >  CP028101/875369‑875526             |                                                                                                                                                  gCAGAAAACTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATaaaggaaaa          >  2:3093375/1‑150 (MQ=14) gCAGAAAACTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATaaaggaaaa          >  2:2823649/1‑150 (MQ=14) gCAGAAAACTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATaaaggaaaa          >  2:852671/1‑150 (MQ=14) gCAGAAAACTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATaaaggaaaa          <  1:1173207/150‑1 (MQ=14) gCAGAAAACTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATaaaggaaaa          >  2:1400867/1‑150 (MQ=14)  cAGAAAACTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATaaaggaaaag         <  2:2076264/150‑1 (MQ=17)  cAGAAAACTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATaaaggaaaag         >  1:298186/1‑150 (MQ=17)  cAGAAAACTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATaaaggaaaag         <  2:1154746/150‑1 (MQ=17)   aGAAAACTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATaaaggaaaagg        <  2:2257779/150‑1 (MQ=17)   aGAAAACTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATGAAGACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATaaaggaaaagg        <  2:3570441/150‑1 (MQ=255)    gAAAACTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATaaaggaaaagga       >  2:547638/1‑150 (MQ=17)    gAAAACTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATaaaggaaaagga       <  2:573163/150‑1 (MQ=17)    gAAAACTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATaaaggaaaagga       <  1:3359385/150‑1 (MQ=17)    gAAAACTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATaaaggaaaagga       >  2:547637/1‑150 (MQ=17)    gAAAACTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATaaaggaaaagga       >  1:945238/1‑150 (MQ=17)    gAAAACTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATaaaggaaaagga       >  2:1649114/1‑150 (MQ=17)      aaaCTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGgaga     >  1:2578832/1‑150 (MQ=17)      aaaCTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGgaga     <  1:128214/150‑1 (MQ=17)       aaCTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGGAGAt    <  2:973622/150‑1 (MQ=17)       aaCTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGGAGAt    <  1:1737989/150‑1 (MQ=17)       aaCTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGGAGAt    <  2:965679/150‑1 (MQ=17)       aaCTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGGAGAt    <  2:965685/150‑1 (MQ=17)        aCTCAGAAATTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGGAGATa   <  1:3026943/150‑1 (MQ=12)        aCTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGGAGATa   <  1:3026939/150‑1 (MQ=17)        aCTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGGAGATa   <  2:1362744/150‑1 (MQ=17)        aCTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGGAGATa   <  1:3026933/150‑1 (MQ=17)        aCTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGGAGATa   <  1:2263542/150‑1 (MQ=17)         cTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGGAGATaa  >  2:671213/1‑150 (MQ=17)         cTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGGAGATaa  >  2:671216/1‑150 (MQ=17)         cTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGGAGATaa  >  1:800733/1‑150 (MQ=17)         cTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGGAGATaa  >  1:1000471/1‑150 (MQ=17)         cTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGGAGATaa  >  1:410472/1‑150 (MQ=17)         cTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGGAGATaa  >  1:410469/1‑150 (MQ=17)         cTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGGAGATaa  >  1:3230880/1‑150 (MQ=17)         cTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGGAGATaa  >  1:1149430/1‑150 (MQ=17)         cTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGGAGATaa  >  1:1149429/1‑150 (MQ=17)         cTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGGAGATaa  >  1:1000473/1‑150 (MQ=17)         cTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGGAGATaa  >  1:1000472/1‑150 (MQ=17)         cTCAGAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATACGTCCAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGGAGATaa  >  1:2564319/1‑150 (MQ=255)             |                                                                                                                                                  GCAGAAAACTCAAAAAGTTTAGCAGGCTTAAGATTAGAATTAATACAATTAATGGAACAAGGGGATCAAGTAGTAAAATCACCTTGGATGTCATGGCAATTTGGAATAAACTATATGTACAGTAAATGGAATGGTACATATAAAGGAAAAGGAGATAA  >  CP028101/875369‑875526

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑