| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP028101 | 1,951,385 | 0 | A | G | 30.9% | 671.9 / 210.1 | 424 | D68D (GAT→GAC) ‡ | C7Y58_09440 | 30S ribosomal protein S13 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (70/223); new base G (131/0); total (201/223) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 0.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 427 total aligned reads displayed.
TTCTTATAGGTTTTTTAGGACCTTTTACAGTTCTTGCATTTGTTTTTGAGCTTTGTCCTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATATTTTTTGAGAAGTTGGTTTTCCAATTCCATAAATATATGTTAG > CP028101/1951237‑1951534 | tCTTATAGGTTTTTTAGGACCTTTTACAGTTCTTGCATTTGTTTTTGAGCTTTGTCCTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGAtc < 1:572265/150‑1 (MQ=255) tCTTATAGGTTTTTTAGGACCTTTTACAGTTCTTGCATTTGTTTTTGAGCTTTGTCCTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGAtc < 1:3191811/150‑1 (MQ=255) taGGTTTTTTAGGACCTTTTACAGTTCTTGCATTTGTTTTTGAGCTTTGTCCTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCtt > 2:1521199/1‑150 (MQ=255) ggTTTTTTAGGACCTTTTAAAGTTCTTGCATTTGTTTTTGAGCTTTGTCCTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGAGTTCCTTCa > 1:3066887/1‑150 (MQ=255) tttttAGGACCTTTTACAGTTCTTGCATTTGTTTTTGAGCTTTGTCCTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATTTCCTTCAACt > 1:2578034/1‑150 (MQ=255) ggACCTTTTACAGTTCTTGCATTTGTTTTTGAGCTTTGTCCTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCGTCAACTTTGata < 1:900379/150‑1 (MQ=255) ggACCTTTTACAGTTCTTGCATTTGTTTTTGAGCTTTGTCCTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTATGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGata < 1:1832070/150‑1 (MQ=255) cAGTTCTTGCATTTGTTTTTGAGCTTTGTCCTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGa < 1:3410426/150‑1 (MQ=255) cTTGCATTTGTTTTTGAGCTTTGTCCTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCACCTCTGATATCTTTTATAATTtct > 2:2271566/1‑150 (MQ=255) gCATTTGTTTTTGAGCTTTGTCCTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTg < 2:1342083/150‑1 (MQ=255) cATTTGTTTTTGAGCTTTGTCCTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGa > 2:3081891/1‑150 (MQ=255) aTTTGTTTTTGAGCTTTGTCCTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGGTTTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGAt > 2:1190702/1‑150 (MQ=255) aTTTGTTTTTGAGCTTTGTCCTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGGTCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGAt > 2:2874505/1‑150 (MQ=255) tttGTTTTTGAGCTTTGTCCTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGAtt < 2:2440665/150‑1 (MQ=255) gTTTTTGAGCTTTGTCCTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGGGCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATttta > 2:3442693/1‑150 (MQ=255) gTTTTTGAGCTTTGTCCTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATttta < 2:1105373/150‑1 (MQ=255) ttttGAGCTTTGTCCTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGGTTTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATtttatt > 1:2747518/1‑150 (MQ=255) ttttGAGCTTTGTCCTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGGTTTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATtttatt > 1:754501/1‑150 (MQ=255) ttttGAGCTTTGTCCTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATGTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATtttatt > 2:313278/1‑150 (MQ=255) tttGAGCTTTGTCCTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATtttattt < 1:1607778/150‑1 (MQ=255) tttGAGCTTTGTCCTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATtttattt < 1:2140128/150‑1 (MQ=255) gAGCTTTGTCCTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTtatttatt < 2:703734/150‑1 (MQ=255) gCTTTGTCCTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGGTCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATttc > 1:2032383/1‑150 (MQ=255) cTTTGTCCTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATttct < 1:1233095/150‑1 (MQ=255) ccTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATGTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTtcttcttct > 1:2097491/1‑150 (MQ=255) ctTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTTTGACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTCCTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGtt < 2:2468085/150‑1 (MQ=255) ctTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGtt < 1:599117/150‑1 (MQ=255) ttACAGGCAGATTCATTTTATTTCTTAATCCTCTGTAGCGTTTAATATCCATACGTCTTTTTACATATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCACCTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTa < 2:2417546/150‑1 (MQ=255) ttACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTa < 1:2229350/150‑1 (MQ=255) ttACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTa < 1:1529258/150‑1 (MQ=255) tACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATTTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTaa > 2:3291959/1‑150 (MQ=255) aCAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTaaa < 2:817819/150‑1 (MQ=255) aCAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTaaa < 2:2932076/150‑1 (MQ=255) cAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGGTTTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAAt > 2:1838411/1‑150 (MQ=255) cAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGGTGTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAAt > 2:3160342/1‑150 (MQ=255) cAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAAt < 1:824878/150‑1 (MQ=255) ggAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGGTTTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCt > 2:3024823/1‑150 (MQ=255) ggAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCt < 1:2611603/150‑1 (MQ=255) aaGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAATTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCttt < 1:2003642/150‑1 (MQ=255) aaGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCttt < 2:161409/150‑1 (MQ=255) aGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTa < 1:2676682/150‑1 (MQ=255) aTTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAAc < 1:1079970/150‑1 (MQ=255) tCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAActc < 2:647363/150‑1 (MQ=255) cATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGGTCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAActct > 1:842398/1‑150 (MQ=255) ttATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGGGGTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAgtg > 1:438225/1‑150 (MQ=255) cTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGGTTTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCaaaa > 2:1386138/1‑150 (MQ=255) cTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCaaaa < 1:1312386/150‑1 (MQ=255) ttAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAAt < 1:3139701/150‑1 (MQ=255) tAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATTTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAAtt > 2:3205642/1‑150 (MQ=255) tAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAAtt < 1:1740989/150‑1 (MQ=255) tAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAAtt < 2:529404/150‑1 (MQ=255) aTCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGGTTTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTa > 1:3383956/1‑150 (MQ=255) aTCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGGTTTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTa > 1:2709515/1‑150 (MQ=255) aTCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTa > 2:483776/1‑150 (MQ=255) aTCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTa < 2:512846/150‑1 (MQ=255) aTCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTa > 2:893927/1‑150 (MQ=255) tCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTAt < 2:1964701/150‑1 (MQ=255) ctGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATTTCCTTCAACTTTGATATCTTCTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTCAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCa > 2:621130/1‑150 (MQ=255) tGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAg < 1:2260766/150‑1 (MQ=255) tGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATATTACTTCTTTTCTAAGGTTTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTCACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCaa > 1:2477586/1‑149 (MQ=255) aaCATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGctt < 2:1777466/150‑1 (MQ=255) aCATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGGTTTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGcttc > 2:2091999/1‑150 (MQ=255) aTTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGGTGTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGcttcct > 1:230917/1‑150 (MQ=255) ttAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGcttccttc < 1:1180897/150‑1 (MQ=255) ttAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGcttccttc < 2:1697196/150‑1 (MQ=255) tAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATTTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCa > 2:2065624/1‑150 (MQ=255) aaTATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGGTTTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCaa > 1:349715/1‑150 (MQ=255) aaTATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCaa < 2:2985575/150‑1 (MQ=255) aaTATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCaa < 2:1435505/150‑1 (MQ=255) atatCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAat < 1:1248118/150‑1 (MQ=255) atatCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAat < 2:2706308/150‑1 (MQ=255) atatCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAat < 1:2061254/150‑1 (MQ=255) atatCCATAAGTCTTTTGACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATAGCTTTTATTGTTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTTTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAat < 1:3570164/150‑1 (MQ=255) tatCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGGTTTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAata > 2:1289710/1‑150 (MQ=255) tCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGGTGTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTCCAATAtt > 1:1803276/1‑150 (MQ=255) tCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATAtt > 1:1267824/1‑150 (MQ=255) tAAGTCTTGTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATAtttttt < 1:2812830/150‑1 (MQ=255) aaGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATATTTTTTg < 2:3344126/150‑1 (MQ=255) tCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATATTTTTTgaga < 1:3291959/150‑1 (MQ=255) aCAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTTTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCGAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATATTTTTTGAGAAGTTGGt < 2:2041708/150‑1 (MQ=255) cAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGGTTTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATATTTTTTGAGAAGTTGGtt > 2:352300/1‑150 (MQ=255) aGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGGTTTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATATTTTTTGAGAAGTTGGttt > 2:389070/1‑150 (MQ=255) aGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATATTTTTTGAGAAGTTGGttt < 2:1607901/150‑1 (MQ=255) tAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATATTTTTTGAGAAGTTGGTTTTcc < 1:2923214/150‑1 (MQ=255) tAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATATTTTTTGAGAAGTTGGTTTTcc < 2:869072/150‑1 (MQ=255) tCTTACTTCTTTTCTAAGGTTTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATATTTTTTGAGAAGTTGGTTTTCCAAt > 1:1670447/1‑150 (MQ=255) tCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATATTTTTTGAGAAGTTGGTTTTCCAAt < 1:708958/150‑1 (MQ=255) ttACTTCTTTTCTAAGGTTTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATATTTTTTGAGAAGTTGGTTTTCCAATTc > 2:1906941/1‑150 (MQ=255) ttACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATATTTTTTGAGAAGTTGGTTTTCCAATTc < 2:1731776/150‑1 (MQ=255) ttACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATATTTTTTGAGAAGTTGGTTTTCCAATTc < 2:2316292/150‑1 (MQ=255) aCTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATATTTTTTGAGAAGTTGGTTTTCCAATTCCa < 1:1384549/150‑1 (MQ=255) ttcttTTCTAAGGTTTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATATTTTTTGAGAAGTTGGTTTTCCAATTCCATa > 1:1490041/1‑150 (MQ=255) ttcttTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTCCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATATTTTTTGAGAAGTTGGTTTTCCAATTCCATa < 2:3265690/150‑1 (MQ=255) tcttTTCTAAGGTTTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATATTTTTTGAGAAGTTGGTTTTCCAATTCCATaa > 1:1579804/1‑150 (MQ=255) tcttTTCTAAGGTCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATATTTTTTGAGAAGTTGGTTTTCCAATTCCATaa > 2:2571669/1‑150 (MQ=255) ttttCTAAGGTTTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATATTTTTTGAGAAGTTGGTTTTCCAATTCCATAAat > 2:2744659/1‑150 (MQ=255) ttttCTAAGGTCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATATTTTTTGAGAAGTTGGTTTTCCAATTCCATAAat > 2:360299/1‑150 (MQ=255) ttCTAAGGTTTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATATTTTTTGAGAAGTTGGTTTTCCAATTCCATAAatat > 1:629608/1‑150 (MQ=255) aGATTTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATATTTTTTGAGAAGTTGGTTTTCCAATTCCATAAATATATGtt > 2:2203898/1‑150 (MQ=255) aTCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATATTTTTTGAGAAGTTGGTTTTCCAATTCCATAAATATATGTTag < 1:2443055/150‑1 (MQ=255) | TTCTTATAGGTTTTTTAGGACCTTTTACAGTTCTTGCATTTGTTTTTGAGCTTTGTCCTCTTACAGGAAGATTCATTTTATGTCTTAATCCTCTGTAACATTTAATATCCATAAGTCTTTTTACAGATAATCTTACTTCTTTTCTAAGATCTCCTTCAACTTTGATATCTTTTATGATTTCTCTGATTTTATTTATTTCTTCTTCTGTTAAATCTTTAACTCTAGTGTCAAAATTTATTCCAGCTTCCTTCAATATTTTTTGAGAAGTTGGTTTTCCAATTCCATAAATATATGTTAG > CP028101/1951237‑1951534 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |