| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP028101 | 1,727,846 | 0 | G | A | 27.9% | 664.9 / 58.6 | 390 | E327E (GAG→GAA) | yqeH | ribosome biogenesis GTPase YqeH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (187/77); new base A (0/102); total (187/203) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.52e-41 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 423 total aligned reads displayed.
AAAGATGTACAATTTCATGAAACTACAATAGAAAAATCTAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTAGAAGATAGAATGAAAAATATAAATAAAACAACCAATC > CP028101/1727697‑1727995 | aaaGATGTACAATTTCATGAAACTACAATAGAAAAATCTAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACaggagaggag < 1:866946/150‑1 (MQ=255) aaGATGTACAATTTCATGAAACTACAATAGAAAAATCTAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGc > 2:2712062/1‑150 (MQ=255) aGATGTACAATTTCATGAAACTACAATAGAAAAATCTAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCt > 2:3199624/1‑150 (MQ=255) gtataatgtCATGAAACTACAATAGAAAAATCTAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAACTAGTa < 2:2463728/142‑1 (MQ=255) tACAATTTCATGAAACTACAATAGAAAAATCTAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTAt > 1:392465/1‑150 (MQ=255) aCAATTTCATGAAACTACAATAGAAAAATCTAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTAtt < 2:909190/150‑1 (MQ=255) aTTTCATGAAACTACAATAGAAAAATCTAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTaa > 1:1234100/1‑150 (MQ=255) aTTTCATGAAACTACAATAGAAAAATCTAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTaa > 1:1243693/1‑150 (MQ=255) aTTTCATGAAACTACAATAGAAAAATCTAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTaa > 2:3467281/1‑150 (MQ=255) aTTTCATGAAACTACAATAGAAAAATCTAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTaa > 2:2957419/1‑150 (MQ=255) ttCATGAAACTACAATAGAAAAATCTAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAg > 1:2017658/1‑150 (MQ=255) tCATGAAACTACAATAGAAAAATCTAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGACCTAGTATTTAAAgg < 2:415681/150‑1 (MQ=255) cATGAAACTACAATAGAAAAATCTAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGt > 1:1600619/1‑150 (MQ=255) tGAAACTACAATAGAAAAATCTAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGttt < 2:1854786/150‑1 (MQ=255) gAAACTACAATAGAAAAATCTAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTa > 2:602434/1‑150 (MQ=255) cAATAGAAAAATCTAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTggg < 1:2755866/150‑1 (MQ=255) cAATAGAAAAATCTAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAACTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTggg < 2:3382128/150‑1 (MQ=255) aaTAGAAAAATCTAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAACTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGt < 2:2200603/150‑1 (MQ=255) aGAAAAATCTAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGACCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTANc < 2:2317518/150‑1 (MQ=255) gAAAAATCTAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCa > 1:2382204/1‑150 (MQ=255) aaaaaTCTAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAACTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAg < 2:2249191/150‑1 (MQ=255) aaaaTCTAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGt > 1:782980/1‑150 (MQ=255) tCTAAGGAATTAGAATGAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCCAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTaaa < 1:2095036/150‑1 (MQ=255) tAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAag > 1:926126/1‑150 (MQ=255) tAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAag > 2:2545521/1‑150 (MQ=255) tAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAag > 1:1152062/1‑150 (MQ=255) tAAGGAATTAGAATTAGGAAATGGATTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGATTATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGATAGGAACTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGGTAAAag < 1:1290761/150‑1 (MQ=255) ggAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAACTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAgg < 2:2153353/150‑1 (MQ=255) gaattagaattaGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGt > 1:1895482/1‑150 (MQ=255) aattagaattagGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTc > 1:458127/1‑150 (MQ=255) ttagaattagGAAATTTCTTTACAATCCCTTGTGCCTGTTGTAGAGAAGAATATACCAAACATAAAAAAATACATACAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGTTAGTATTCCCAGGTTTATCTTGGGTGTCAGTTAAAGGAGGTccc > 2:3565674/1‑150 (MQ=255) ttagaattagGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAACTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTccc < 1:1217172/150‑1 (MQ=255) gaattagGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGATGAACTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTa < 1:2222656/150‑1 (MQ=255) aattagGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACATGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTaa < 2:2436996/150‑1 (MQ=255) attagGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTaaa > 2:273089/1‑150 (MQ=255) ttagGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAACTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAat < 1:192573/150‑1 (MQ=255) ggAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATAtt > 1:2418371/1‑150 (MQ=255) aaaTTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCa < 2:13206/150‑1 (MQ=255) aaaTTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCa > 1:175255/1‑150 (MQ=255) aaaTTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCa < 2:640692/150‑1 (MQ=255) aaaTTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAACTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCa < 1:3235039/150‑1 (MQ=255) aaaTTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAACTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCa < 1:664849/150‑1 (MQ=255) aTTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAACTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAg < 2:950540/150‑1 (MQ=255) ttCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTc > 1:346926/1‑150 (MQ=255) tCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCATTAAATATTCAAGTCa > 2:2862016/1‑150 (MQ=255) tCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAACTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCa < 1:600239/150‑1 (MQ=255) tCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAACTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCa < 1:2805702/150‑1 (MQ=255) tACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAACTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACttt < 2:3081626/150‑1 (MQ=255) aCCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCaga > 2:2371095/1‑150 (MQ=255) gtgACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGaaa < 2:1652637/150‑1 (MQ=255) tgACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGACCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAAt < 1:2575648/150‑1 (MQ=255) gACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGACCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAAtt < 1:1427719/150‑1 (MQ=255) gACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAACTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAAtt < 2:1758205/150‑1 (MQ=255) tgttgtAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGaa > 2:2635496/1‑150 (MQ=255) gttgtAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGaaa > 2:290305/1‑150 (MQ=255) gttgtAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGACCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGaaa < 1:3157952/150‑1 (MQ=255) gttggAAAGAAGAATAGAACAAACATAAAAAAAGAAAGAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAACTAGTATTGAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTGAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGaaa < 2:3041149/150‑1 (MQ=255) ttgtAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAat > 1:1414983/1‑150 (MQ=255) gtAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAatat > 2:781222/1‑150 (MQ=255) aaaGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAACATCt > 1:3030904/1‑150 (MQ=255) aagaaTATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAACTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTa < 1:3449902/150‑1 (MQ=255) tataACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGaaaa < 1:1388288/150‑1 (MQ=255) ataACAAACATAAAAAAATAAATAAAAATTTAACAATTAATACAGGAGAGGAACTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAg < 1:10906/150‑1 (MQ=255) taACAAACATAAAAAAATAAATAAGACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGc > 2:2060676/1‑150 (MQ=255) caaacaTAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCtt > 2:1718066/1‑150 (MQ=255) caaacaTAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCtt > 1:1041077/1‑150 (MQ=255) aacaTAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTta < 2:1224710/150‑1 (MQ=255) acaTAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTtat > 2:5108/1‑150 (MQ=255) acaTAAAAAAATAAAGAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGATGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTtat < 1:3552482/150‑1 (MQ=255) caTAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGACCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTtata < 1:1298568/150‑1 (MQ=255) tAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATaaa > 1:3418108/1‑150 (MQ=255) aaaaaaTAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAACTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATc < 2:126236/150‑1 (MQ=255) aaaaaTAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATcc < 2:5716/150‑1 (MQ=255) aaataaatAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTa < 1:523228/150‑1 (MQ=255) aataaataAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAACTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTag < 1:557190/150‑1 (MQ=255) taaataaaACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAACTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTagaa < 2:1404915/150‑1 (MQ=255) taaataaaACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAACTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTagaa < 1:215740/150‑1 (MQ=255) taaataaaACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAACTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTagaa < 2:1039030/150‑1 (MQ=255) aaataaaACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTagaag > 1:1872383/1‑150 (MQ=255) taaaACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAAAAAAGCCTTTATAAATCCTagaagaca > 1:2625168/1‑148 (MQ=255) aaaaCTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTAGAAGATAg < 2:201326/150‑1 (MQ=255) aaaaCTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTAGAAGATAg < 1:2515672/150‑1 (MQ=255) aaaCTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTAGAAGATAGa < 2:753960/150‑1 (MQ=255) aCTTTAACAATTAATACAGTAGAGGAACTAATATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATTAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATCCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTAGAAGATAGAAt < 2:3148516/150‑1 (MQ=255) ttAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTAGAAGATAGAATGaa > 2:1930436/1‑150 (MQ=255) aaCAATTAATACAGGAGAGGAACTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTAGAAGATAGAATGaaaa < 1:309296/150‑1 (MQ=255) aaCAATTAATACAGGAGAGGAACTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTAGAAGATAGAATGaaaa < 1:1656740/150‑1 (MQ=255) aCAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTAGAAGATAGAATGaaaaa < 2:3437961/150‑1 (MQ=255) aTTAATACAGGAGAGGACCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTAGAAGATAGAATGAAAAatat < 1:2897158/150‑1 (MQ=255) aTTAATACAGGAGAGGAACTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTAGAAGATAGAATGAAAAatat < 1:348852/150‑1 (MQ=255) aTTAATACAGGAGAGGAACTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTAGAAGATAGAATGAAAAatat < 1:1136646/150‑1 (MQ=255) ttAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTAGAAGATAGAATGAAAAAtata < 2:1599631/150‑1 (MQ=255) aaTACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTAGAAGATAGAATGAAAAATataaa > 2:1962863/1‑150 (MQ=255) tACAGGAGAGGACCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTAGAAGATAGAATGAAAAATataaana < 1:3355341/150‑1 (MQ=255) ggagaggagCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCGGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTAGAAGATAGAATGAAAAATATAAATAAaac > 2:3011564/1‑150 (MQ=255) ggagaggagCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTAGAAGATAGAATGAAAAATATAAATAAaac < 2:1077999/150‑1 (MQ=255) ggagaggagCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTAGAAGATAGAATGAAAAATATAAATAAaac > 2:1543469/1‑150 (MQ=255) gCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTAGAAGATAGAATGAAAAATATAAATAAAACAACCAATc < 1:2349278/150‑1 (MQ=255) gCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTAGAAGATAGAATGAAAAATATAAATAAAACAACCAATc > 2:3329596/1‑150 (MQ=255) gCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTAGAAGATAGAATGAAAAATATAAATAAAACAACCAATc > 2:1106386/1‑150 (MQ=255) | AAAGATGTACAATTTCATGAAACTACAATAGAAAAATCTAAGGAATTAGAATTAGGAAATTTCTTTACAATACCTTGTGACTGTTGTAAAGAAGAATATAACAAACATAAAAAAATAAATAAAACTTTAACAATTAATACAGGAGAGGAGCTAGTATTTAAAGGTTTAGCTTGGGTATCAGTTAAAAGAGGTCCCTTAAATATTCAAGTCACTTTACCAGAAGAAATTGAAATATCTGTTAGAAAAGCCTTTATAAATCCTAGAAGATAGAATGAAAAATATAAATAAAACAACCAATC > CP028101/1727697‑1727995 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |