| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 382 total aligned reads displayed.
CTTTTTTTGAATAAATCTGCAAAATAATCATCATAAGCATTTCCGTCAGGATTTTCTTTTACAAACTTTTCATCAAATTCACAATATAAGTCATGTAATTTTTTATCACAGATACAAGCAAGTCCAGCATCAACATTAAAGCCAAAAAAATCTCCTTCATTAATATCTTTTAAGTCTTCTATACCTTTCATAGCCTCTTCAAAATAACTGATTTCATTATCATTAAATTTCAATCTAACTGCTGCATATCTATCACAATCTCCATCACTGGCTTTTACAACACAAATTTCTGTTC > CP028101/1393223‑1393517 | tttttttGAATAAATCTGCAAAATAATCATCATAAGCATTTCCGTCAGGATTTTCTTTTACAAACTTTTCATCAAATTCACAATATAAGTCATGTAATTTTTTATCACAGATACAAGCAAGTCCAGCATCAACATTAAAGCCAAAAAAAt > 1:770041/1‑150 (MQ=255) tttttGAATAAATCTGCAAAATAGTCATCATAAGCATTTCCGTCAGGATTTTCTTTTACAAACTTTTCATCAAATTCACAATATAAGTCATGTAATTTTTTATCACAGATACAAGCAAGTCCAGCATCAACATTAAAGCCAAAAAAAtct < 2:2433693/150‑1 (MQ=255) tttgtGAATAAATCTGCAAAATAATCATCATAAGCATTTCCGTCAGGATTTTCTTTTACAAACTTTTCATCAAATTCACAATATAAGTCATGTAATTTTTTATCACAGATACAAGCAAGTCCAGCATCAACATTAAAGCCAAAAAAAtct < 2:2433706/146‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |