| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | CP028101 | 1,153,299 | 0 | A | G | 38.4% | 536.6 / inf | 474 | F126L (TTT→CTT) | C7Y58_05555 | autotransporter subunit beta |
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 488 total aligned reads displayed.
TCTTTTAGATTCAGAGTCAGGATATACTTCATGAGCAATAGGAACTAAATCAACTCCATTATGTGTTCTTTGAGCTTTTACACTTCCTTTTTCCCAATAATTTGATTTAACACCATTCATTCTATTTTGTTCATCAACTACTCTTAAAAATCCTTCATAAGCTGTTTTTTCTATTGGTTGTATAATTTCTTTAGTTTCTTGAATTATTCTATAATTATTTTTAGGTCCTATTCCATCTCCAATTTTTTTAATTTCTTTATCTATTTTTGGAAGTATTTCTGGAATATTAAGACGACTT > CP028101/1153150‑1153447 | ctTTTAGATTCAGAGTCAGGATATACTTCATGAGCAATAGGAACTAAATCAACTCCATTATTTGTTCTTTGAGCTTTTACACTTCCTTTTTCCCAATAATTTGATTTAACACCATTCATTCTATTTTGTTCATCAACTACTCTTAAAAAt < 2:2239868/150‑1 (MQ=255) ttttAGATTCAGAGTCAGGATATACTTCATGAGCAATAGGAACTAAATCAACTCCATTATGTGTTCTTTGAGCTTTTACACTTCCTTTTTCCCAATAATTTGATTTAACACCATTCATTCTATTTTGTTCATCAACTACTCTTAAAAATc < 2:759215/150‑1 (MQ=255) gATTCAGAGTCAGGATATACTTCATGAGCAATAGGAACTAAATCAACTCCATTATGTGTTCTTTGAGCTTTTACACTTCCTTTTTCCCAATAATTTGATTTAACACCATTCATTCTATTTTGTTCATCAACTACTCTTAAAAATCCTTCa < 1:787923/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |