| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP028101 | 845,508 | 0 | C | T | 31.4% | 724.3 / 136.6 | 445 | A53V (GCA→GTA) | C7Y58_04180 | carbon starvation protein A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (84/220); new base T (139/0); total (225/220) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 0.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 445 total aligned reads displayed.
TTTATAGGTTCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTCTAATAGGAATGATG > CP028101/845360‑845656 | ataGGTTCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCAttt < 2:1377870/150‑1 (MQ=255) gTTCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCTAAAAGCATTTCTTa > 2:1993591/1‑150 (MQ=255) ttCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTAt < 1:2281053/150‑1 (MQ=255) tCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTAtt < 1:2001130/150‑1 (MQ=255) cAATTATAGCATTGGTACTTGGATCTTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGCTACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCTAAAAGCATTTCTTATTc > 2:573463/1‑150 (MQ=255) aGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCTAAGAGTATTTCTTATTCAATTTCt > 1:3294530/1‑150 (MQ=255) aGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCTAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCt > 2:1760670/1‑150 (MQ=255) gCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCGAAAGCATTTCTTATTCAATTTCtt > 2:3080065/1‑150 (MQ=255) gCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCtt > 1:810656/1‑150 (MQ=255) cATTGGTCCTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAGGCATTTCTTATTCAATTTCTTa > 1:1506140/1‑150 (MQ=255) cATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTGAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTa > 2:830641/1‑150 (MQ=255) cATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAACATTTCTTATTCAATTTCTTa < 1:3538936/150‑1 (MQ=255) aTTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTaa < 2:2832038/150‑1 (MQ=255) ttGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAAc < 1:3225692/150‑1 (MQ=255) gTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATa < 2:1288041/150‑1 (MQ=255) tACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAg > 2:1231049/1‑150 (MQ=255) aCTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGc < 1:1005670/150‑1 (MQ=255) cTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCt > 1:2035700/1‑150 (MQ=255) ttGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTg < 1:620112/150‑1 (MQ=255) gATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAGAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGaa > 2:2514575/1‑150 (MQ=255) atatTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAAc < 2:947294/150‑1 (MQ=255) tattttatttATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACt > 2:358467/1‑150 (MQ=255) ttttatttATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTgg < 2:1950166/150‑1 (MQ=255) ttatttatGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGAc < 1:464211/150‑1 (MQ=255) ttatttatGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGAc < 1:786774/150‑1 (MQ=255) tatttatGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGAcc < 2:71770/150‑1 (MQ=255) atttatGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCa < 2:492680/150‑1 (MQ=255) ttatGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAGAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAat > 1:1774851/1‑150 (MQ=255) tatGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAata > 1:2789522/1‑150 (MQ=255) atGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAatat < 2:3435588/150‑1 (MQ=255) tGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATAtt > 1:1589595/1‑150 (MQ=255) gAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTg > 1:2159091/1‑150 (MQ=255) gAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTACAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTg > 2:161984/1‑150 (MQ=255) aaTTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAg < 1:2832453/150‑1 (MQ=255) aaTTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAg < 2:1458727/150‑1 (MQ=255) aTTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGc < 1:1972944/150‑1 (MQ=255) gttgAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAGAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGtt > 1:666969/1‑150 (MQ=255) gttgAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAGAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGtt > 1:194397/1‑150 (MQ=255) tgAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCTAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGc > 2:2778479/1‑150 (MQ=255) aaGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCTAAGGGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAg > 2:2372358/1‑150 (MQ=255) aaGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAg > 1:1553950/1‑150 (MQ=255) gtTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAAGGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCg < 2:2126767/150‑1 (MQ=255) ttttGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCGAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGtt > 1:1687362/1‑150 (MQ=255) ggTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCACAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCTAAAAGCATTTCTTATCCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATgg > 2:2291055/1‑150 (MQ=255) ggTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAGGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATgg > 2:3191658/1‑150 (MQ=255) cTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAgttg > 2:2602800/1‑147 (MQ=255) cTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTg > 2:3111323/1‑150 (MQ=255) tCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCTGAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCa > 1:1372687/1‑150 (MQ=255) cAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAGAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCat > 2:1806600/1‑150 (MQ=255) cAAGAGAAACACCTACAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCat < 2:2422248/150‑1 (MQ=255) aaGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCatt < 1:3198243/150‑1 (MQ=255) agagAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCattt < 2:622115/150‑1 (MQ=255) agagAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCattt > 1:79004/1‑150 (MQ=255) aaaCACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCatttattt < 2:314510/150‑1 (MQ=255) aaaCACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCatttattt < 1:26745/150‑1 (MQ=255) aaCACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTg > 1:530722/1‑150 (MQ=255) aaCACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTg > 1:708259/1‑150 (MQ=255) aaCACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTg < 1:1814191/150‑1 (MQ=255) aaCACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTg < 1:290146/150‑1 (MQ=255) cacCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGa < 1:3382837/150‑1 (MQ=255) cacCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGa < 2:2084077/150‑1 (MQ=255) acCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGAt < 2:2867971/150‑1 (MQ=255) ccTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGCAATGAGTTGGCCAAAGGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAAATGGACCAATATTTGGAGATGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGTAGTTACTTGGATa > 2:1668797/1‑150 (MQ=255) cTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCGAAGGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAg > 2:1580780/1‑150 (MQ=255) tGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAgt > 1:2545913/1‑150 (MQ=255) gCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCTAAGAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGTGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAgtg > 2:1907296/1‑150 (MQ=255) cAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAGGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAgtgt > 1:385476/1‑150 (MQ=255) aaaaaGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTCAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGtt > 1:1729325/1‑150 (MQ=255) aaaaaGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGtt > 2:1636504/1‑150 (MQ=255) aaaaGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTAAGAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTTCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGttt > 2:2899897/1‑150 (MQ=255) aaGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAGGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTgg > 2:339257/1‑150 (MQ=255) aaGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTgg < 1:2560881/150‑1 (MQ=255) aaGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTgg < 2:1053184/150‑1 (MQ=255) aGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGt > 2:25720/1‑150 (MQ=255) aGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGt < 1:1151442/150‑1 (MQ=255) aGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAACATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATGTGGATAGTGTTTGGt < 2:3252358/150‑1 (MQ=255) aTTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTAGGAGTGTTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTg > 2:2046647/1‑150 (MQ=255) ttAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGTTAAAGGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGt > 1:404062/1‑150 (MQ=255) ttAGCTGATGGTGTTGAATATATGGAAATGAGTTGGTCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGt > 1:990264/1‑150 (MQ=255) gCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTTAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTAtt < 2:3369501/150‑1 (MQ=255) ggTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCa < 2:879877/150‑1 (MQ=255) gtTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGgt < 1:1271858/150‑1 (MQ=255) tGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGgttc < 1:2417456/150‑1 (MQ=255) atGGAAATGAGTTGGCCAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCAt > 1:1219065/1‑150 (MQ=255) atGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCAt < 2:2680356/150‑1 (MQ=255) ggaaagtggTTGGCAAAAAGCGGTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAAGATTTCGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGa < 1:3068679/142‑1 (MQ=255) ggAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGa < 2:1362038/150‑1 (MQ=255) gAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGAt < 1:3126215/150‑1 (MQ=255) tgaattGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTc < 1:2369267/146‑1 (MQ=255) tggtcAAAAGTATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTCTAATa > 1:1627298/5‑150 (MQ=255) tGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTCTAATa < 1:1105480/150‑1 (MQ=255) tGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTCTAATa < 2:328263/150‑1 (MQ=255) ggCCAAAAACATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTCTAATAg < 1:942687/150‑1 (MQ=255) ccAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTCTAATAGGa > 1:1896540/1‑150 (MQ=255) aaaaGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTCTAATAGGAat < 1:3337198/150‑1 (MQ=255) aaaaGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTCTAATAGGAat < 1:2706305/150‑1 (MQ=255) aGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTCTAATAGGAatgat < 1:3471202/150‑1 (MQ=255) gCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTCTAATAGGAatgatg < 1:2938908/150‑1 (MQ=255) gCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTCTAATAGGAatgatg < 2:173926/150‑1 (MQ=255) gCATTTCTTATTCAATTCCTTAACGTAGATGGAGATGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTCTAATAGGAatgatg < 1:2612819/150‑1 (MQ=255) | TTTATAGGTTCAATTATAGCATTGGTACTTGGATATTTTATTTATGGAAAATTTGTTGAAGGTGTTTTTGGTATAGATACTTCAAGAGAAACACCTGCAAAAAGATTAGCTGATGGTGTTGACTATATGGAAATGAGTTGGCCAAAAGCATTTCTTATTCAATTTCTTAACATAGCTGGAACTGGACCAATATTTGGAGCTGTTGCAGGAGCGTTATGGGGTCCAGCTGCATTTATTTGGATAGTGTTTGGTTGTATTTTTGCAGGTTCAGTTCATGATTTTCTAATAGGAATGATG > CP028101/845360‑845656 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |