| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP028101 | 628,912 | 0 | G | C | 23.9% | 956.1 / 138.4 | 460 | E89D (GAG→GAC) | C7Y58_03170 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (244/65); new base C (0/97); total (244/216) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 0.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 469 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |