| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP028101 | 345,348 | 0 | A | G | 29.7% | 684.1 / 177.2 | 496 | intergenic (‑2/+33) | C7Y58_01810/C7Y58_01815 | ethanolamine utilization microcompartment protein EutM/ethanolamine utilization protein EutM |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (143/205); new base G (146/1); total (290/206) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.68e-42 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 499 total aligned reads displayed.
CTCTTACCATAACAGTTACTAATCCTCCACCTACAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTAAAGATTCTTCTTGTATC > CP028101/345199‑345495 | ctctTACCATAACAGTTACTAATCCTCCACCTACAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATaa > 2:1647804/1‑150 (MQ=255) ttACCATAACAGTTACTAATCCTCCACCTACAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCt < 1:2679085/150‑1 (MQ=255) tACCATAACAGTTACTAATCCTCCACCTACAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCtt > 1:885339/1‑150 (MQ=255) cATAACAGTTACTAATCCTCCACCTACAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAAtgttaat > 2:3238712/1‑144 (MQ=255) aCAGTTACTAATCCTCCACCTACAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATGTTCAtctct > 1:2691115/1‑150 (MQ=255) aGTTACTAATCCTCCACCTACAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATTTTCATCTCTcc > 1:1341135/1‑150 (MQ=255) gTTACTAATCCTCCACCTACAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATGTTCATCTCTCCt > 1:1396921/1‑150 (MQ=255) gTTACTAATCCTCCACCTACAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGAAATAATCTTCATCTCTCCt > 1:2221004/1‑150 (MQ=255) ttACTAATCCTCCACCTACAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAGTGTTCATCTCTCCtt > 2:1017707/1‑150 (MQ=255) tACTAATCCTCCACCTACAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAGTTTTCATCTCTCCttt > 1:2091225/1‑150 (MQ=255) tACTAATCCTCCACCTACAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATATTCATCTCTCCttt > 1:3333989/1‑150 (MQ=255) aCTAATCCTCCACCTACAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCCAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCtttt > 1:2595539/1‑150 (MQ=255) cTAATCCTCCACCTACAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCttttt < 1:475572/150‑1 (MQ=255) aaTCCTCCACCTACAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATTTTCATCTCTCCTTtttaa > 1:1838068/1‑150 (MQ=255) ccACCTACAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTaaa < 2:2843933/150‑1 (MQ=255) ccTACAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATTTCCATCTCTCCTTtttaatttaacctt > 1:3509891/1‑146 (MQ=255) aCAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGATATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAAttttt > 1:254217/1‑150 (MQ=255) aCAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAAttttt < 2:2465499/150‑1 (MQ=255) cAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAAtttttt > 1:1685544/1‑150 (MQ=255) tCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATttttttattt > 1:3115623/1‑150 (MQ=255) cTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAGTGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATttttttatttt > 1:2125802/1‑150 (MQ=255) tttCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAGTGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATttttttattttt > 2:1474572/1‑150 (MQ=255) tttCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATttttttattttt < 1:502909/150‑1 (MQ=255) ccTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGAGATAGTTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTtttttattttttatc > 2:2067174/1‑149 (MQ=255) aCAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTtattttttattttt < 2:1570324/150‑1 (MQ=255) aGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCCGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATCTAATGTTGACGTAATTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGt > 2:1491188/1‑150 (MQ=255) gtgtTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGtt < 1:1647804/150‑1 (MQ=255) gtTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACGTAATGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGtttt > 1:1152703/1‑150 (MQ=255) gtTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGtttt < 1:3340340/150‑1 (MQ=255) tACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGATATAGTGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGtttttt > 2:850185/1‑150 (MQ=255) tACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAGTGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGtttttt > 2:78273/1‑150 (MQ=255) aCATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGttttttt < 1:2006030/150‑1 (MQ=255) cATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAGTTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTttttta > 2:515151/1‑150 (MQ=255) cATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCCTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTttttta < 1:2326377/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTtttttattt < 1:2454007/150‑1 (MQ=255) tgctgcCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTtttttatttt > 1:1742032/1‑150 (MQ=255) gctgcCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGATATAATGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTtttttattttt > 2:2280036/1‑150 (MQ=255) gctgcCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTtttttcttttt > 1:3582050/1‑150 (MQ=255) tgcCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATGATGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTAc > 1:2787467/1‑150 (MQ=255) ccTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAGTTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTa > 2:835123/1‑150 (MQ=255) cTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACGTAGTATTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACtca > 1:2872316/1‑148 (MQ=255) ccATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACGTAGTGGTCGTCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACtttt > 2:1104434/1‑150 (MQ=255) gCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTTCTAATGCATTTAATGTTGACGTAAGCTTCATCTCTCCTTTTTCCTTTACAACTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTCCTaccctttcagga > 2:2611823/1‑139 (MQ=255) gCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAGTGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGAt > 2:1418898/1‑150 (MQ=255) ctgctgCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACGTAGTGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCa > 2:1042699/1‑150 (MQ=255) tgctgcTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAGTGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCAt > 1:838701/1‑150 (MQ=255) gctgctTCTACTGCTGCTACTACTCCTTTAATTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCAtt < 1:2367193/150‑1 (MQ=255) gctgctTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAGTGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCAtt > 1:490139/1‑150 (MQ=255) gctgctTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTTAtt > 2:2333170/1‑150 (MQ=255) gctgctTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCAtt < 2:2897781/150‑1 (MQ=255) gctgctTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCAtt < 1:954456/150‑1 (MQ=255) gctgctTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAAGGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCAtt > 1:1485021/1‑150 (MQ=255) tgctTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACGTAGTGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGa > 2:2095921/1‑150 (MQ=255) tgctTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACGTAATGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGa > 1:695401/1‑150 (MQ=255) gctTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAGTGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGAt > 1:601327/1‑150 (MQ=255) ctTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGAtt < 2:1755992/150‑1 (MQ=255) ttCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATGGTTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGGttt > 2:3140087/1‑150 (MQ=255) cTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAGTGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATttct > 2:3461197/1‑150 (MQ=255) tACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAGTGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATttctt > 2:569115/1‑150 (MQ=255) tACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATttctt > 2:3159156/1‑150 (MQ=255) tgctgcTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGATATAATTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTCTTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTCACTTTTAAGATTTCATTGGTTTTTTCaa > 2:1794620/1‑150 (MQ=255) tgctgcTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCaa > 2:349864/1‑150 (MQ=255) gctgctACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAAt < 1:1531813/150‑1 (MQ=255) ctactaATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATttct < 2:1716397/150‑1 (MQ=255) tactaATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATttctt < 1:3002302/150‑1 (MQ=255) ctaATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATttcttct < 1:418921/150‑1 (MQ=255) ctaATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATttcttct < 1:737805/150‑1 (MQ=255) aTCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAAGATTCATCTCCCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTGTTCGATttcttattcc > 1:2399632/1‑149 (MQ=255) tCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCta < 2:332924/150‑1 (MQ=255) ccTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAGTGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCtat > 1:2474825/1‑150 (MQ=255) cTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAGTTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCtata > 2:1178779/1‑150 (MQ=255) tttAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACGTAGTGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTatat > 1:3192139/1‑150 (MQ=255) ttAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAGTGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATAtt > 1:672230/1‑150 (MQ=255) aGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATAtttt < 2:254217/150‑1 (MQ=255) gTTTCCATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAGTGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATAttttt > 2:1236970/1‑150 (MQ=255) tttCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATAtttttt < 1:24120/150‑1 (MQ=255) tCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTaa < 2:701598/150‑1 (MQ=255) cTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAAt < 1:53632/150‑1 (MQ=255) tATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAAtt < 2:1515660/150‑1 (MQ=255) tATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAAtt < 2:3543625/150‑1 (MQ=255) aTCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTc < 1:3464125/150‑1 (MQ=255) aTCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTc < 2:376197/150‑1 (MQ=255) aTCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTc < 2:3192835/150‑1 (MQ=255) aTCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTc < 1:439265/150‑1 (MQ=255) tCATTCCTAATACATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCa < 2:1011675/150‑1 (MQ=255) cATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAg > 2:2502793/1‑150 (MQ=255) cATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAg < 2:1909284/150‑1 (MQ=255) cATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAg < 2:2811450/150‑1 (MQ=255) ccTAATGCATTTAATGTTGACATAATGTTTATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACt > 1:1033966/1‑150 (MQ=255) cTAATGCATTTAATGTTGACATAGTTTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACtt > 1:1241287/1‑150 (MQ=255) cTAATGCATTTAATGTTGACATAGTGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACtt > 2:636279/1‑150 (MQ=255) aTGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCt < 2:2151950/150‑1 (MQ=255) cATTTAATGTTGACATGGTGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACCAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTCTTTAATTCAGCACTTTCTaaa > 2:1959150/1‑150 (MQ=255) aaTGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTAAAGAttc < 2:1282341/150‑1 (MQ=255) aTGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTAAAGAttct < 1:1951671/150‑1 (MQ=255) gTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTAAAGAttcttc < 2:2398915/150‑1 (MQ=255) tGACATAATGTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTAAAGATTcttctt > 1:1448973/1‑150 (MQ=255) gACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTAAAGATTCTTCTTg < 1:1332807/150‑1 (MQ=255) cATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTTTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTAAAGATTCTTCTTGTa < 1:3237813/150‑1 (MQ=255) cATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTAAAGATTCTTCTTGTa < 1:12961/150‑1 (MQ=255) | CTCTTACCATAACAGTTACTAATCCTCCACCTACAAGTTCTTTCCCTACAAGTGTTACATTTGCTGCCTTTACCATAGCATCTGCTGCTTCTACTGCTGCTACTAATCCTTTAGTTTCTATCATTCCTAATGCATTTAATGTTGACATAATCTTCATCTCTCCTTTTTAATTTAAAATTTTTTTATTTTTTATTTTTTGTTTTTTTATTTTTACTAACTTTTAAGATTTCATTGATTTCTTCAATTTCTTCTTCTATATTTTTTAATTCAGTACTTTCTAAAGATTCTTCTTGTATC > CP028101/345199‑345495 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |