| Predicted mutation | ||||||
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| JC | CP028101 | 2,060,555 | (AAGATGGTGAAAA)1→2 | coding (185/1413 nt) | C7Y58_09990 → | alanine:cation symporter family protein |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP028101 | = 2060554 | 37 (0.080) | coding (184/1413 nt) | C7Y58_09990 | alanine:cation symporter family protein | |||||
Only 100 of 1055 total aligned reads displayed.
CACAGTTTTATGGTCTTATGTTCTTATTGCACTTTTACTACTATCAGGGTTATTTTATACTTTGAGGACAGGTTTTGCACAAGGAAGATTATTAGGTGATATGGTTGCATTAATTACTGGCAAACTTTCTTCACTTAAAGATGGTGAAAAGAAAATTGCTGGACAAGTAACTGGTTTCCAAGCGTTCTGTATAGCTGTTGCTTCTCACGTTGGAACAGGTAACCTTGCAGGAGTTGCAATAGCAGTTGTAGTTGGTGGCCCAGGAGCATTGTTTTGGATGTGGATAATTGCTCTTTTA > CP028101/2060406‑2060703 | tcttatgttcttattgcacttttactactatcagggttattttatactttgaggacaggttttgcacaaggaagattattaggtgatatggttgcattaattactggcaaactttcttcacttaaagatggtgaaaaaagatggtgaaaa > 2:1425469‑M1/137‑150 (MQ=255) cttatgttcttattgcacttttactactatcagggttattttatactttgaggacaggttttgcacaaggaagattattaggtgatatggttgcattaattactggcaaactttcttcacttaaagatggtgaaaAAAGATGGTgaaaag > 1:3320828‑M1/136‑150 (MQ=255) tatgttcttattgcacttttactactatcagggttattttatactttgaggacaggttttgcacaaggaagattattaggtgatatggttgcattaattactggcaaactttcttcacttaaagatggtgaaaAAAGATGGTgaaaagaa < 2:935582‑M1/17‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |