| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | Xen36_3 | 250,723 | 0 | G | A | 45.5% | 88.2 / inf | 363 | intergenic (+693/–) | recR/– | Recombination protein RecR/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (81/117); new base A (67/98); total (148/215) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.60e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 367 total aligned reads displayed.
AGCGTTCAGAATGGATAGTAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCC‑AAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTATTTATGAGCTAATCAAACA > Xen36_3/250577‑250871 | cctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTa < 1:3465320‑M2/17‑1 (MQ=255) gAATGGATAGTAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCGAAAAGTTGTTGACTTAAAt < 1:249164/150‑1 (MQ=255) ccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTa < 1:498028‑M2/17‑1 (MQ=255) catgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTtaa > 1:331285‑M2/126‑150 (MQ=255) tAGTAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAATGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTtaata < 1:1478368/150‑1 (MQ=255) ccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATaaa > 1:606968‑M2/122‑150 (MQ=255) cgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATaaaa > 1:2149744‑M2/121‑150 (MQ=255) aaaGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAAt < 1:2894696/150‑1 (MQ=255) gtgtAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGtat > 1:2532678/1‑150 (MQ=255) acagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGtat < 1:3040999‑M2/35‑1 (MQ=255) acagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGtat > 1:705890‑M2/116‑150 (MQ=255) acagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATCGACTTAAATGTTAATAAAATGtat < 1:1072323‑M2/35‑1 (MQ=255) aaTTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaatt > 1:484275/1‑150 (MQ=255) aaTTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAcaatt > 1:2985119/1‑150 (MQ=255) aagcttcttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaatagaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTc < 1:715890‑M2/44‑1 (MQ=255) aagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaatagaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTc < 1:2777830‑M2/44‑1 (MQ=255) cTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTg > 1:3393526/1‑150 (MQ=255) cTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTg > 1:3585819/1‑150 (MQ=255) ttgttAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCg < 1:412667/150‑1 (MQ=255) ttAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTa < 1:803701/150‑1 (MQ=255) tAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTaa > 1:2742055/1‑150 (MQ=255) tAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTaa > 1:566849/1‑150 (MQ=255) cgtcgatggtagtcgaacttacgtcccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAg > 1:2197846‑M2/96‑150 (MQ=255) aaGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAg < 1:1035064/150‑1 (MQ=255) cgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGATAAGaaa > 1:3005637‑M2/93‑150 (MQ=255) tttGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAAt > 1:1844645/1‑150 (MQ=255) tggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaattaaattttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAagaaaatg > 1:1305100‑M2/90‑148 (MQ=255) tGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGa > 1:662744/1‑150 (MQ=255) tcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACAtt < 1:3323725‑M2/67‑1 (MQ=255) ccTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTg > 1:85814/1‑150 (MQ=255) gTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGaaa < 1:2762116/150‑1 (MQ=255) ataGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAGCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAGAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAAc < 1:2582489/150‑1 (MQ=255) ataGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAGCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAGAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAAc < 1:54238/150‑1 (MQ=255) taGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACt < 1:2242086/150‑1 (MQ=255) acgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTg < 1:2315875‑M2/75‑1 (MQ=255) cgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGa > 1:951570‑M2/75‑150 (MQ=255) aGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAGAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTg < 1:1193077/150‑1 (MQ=255) gttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGaa > 1:1414089‑M2/74‑150 (MQ=255) gTATTTATTTGTCGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGa > 1:1498335/1‑150 (MQ=255) ttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAAt < 1:3767889‑M2/78‑1 (MQ=255) ttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAAt < 1:3209692‑M2/78‑1 (MQ=255) tatttattTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGaa > 1:693533/1‑150 (MQ=255) atttatttGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAACAATGAACATTGAAAACTGAAt < 1:1170412/150‑1 (MQ=255) atttatttGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAACAATGAACATTGAAAACTGAAt < 1:3050184/150‑1 (MQ=255) atttatttGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAAt < 1:639102/150‑1 (MQ=255) atttatttGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAAt > 1:3115582/1‑150 (MQ=255) atttatttGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAAt < 1:2801989/150‑1 (MQ=255) atttatttGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAAt < 1:787805/150‑1 (MQ=255) tttatttGTTGATGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATg < 1:2294757/150‑1 (MQ=255) cgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAATGAc > 1:937682‑M2/70‑150 (MQ=255) tatttGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGAc > 1:3239567/1‑150 (MQ=255) tgttgAGGCAAACAAAACCACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAata > 1:1447220/1‑150 (MQ=255) ggCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCaa > 1:3556470/1‑150 (MQ=255) gCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAAAATGTCAAc < 1:1259979/150‑1 (MQ=255) aaacaaaacaACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGt > 1:174970/1‑150 (MQ=255) aaacaaaacaACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGt > 1:2622411/1‑150 (MQ=255) aacaaaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGtt > 1:3434305/1‑150 (MQ=255) gccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAAt < 1:3276518‑M2/98‑1 (MQ=255) cagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCC‑aaa > 1:291461‑M2/47‑150 (MQ=255) agttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCC‑aaaa < 1:3233521‑M2/105‑1 (MQ=255) agttttctaatcaaattttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCC‑aaaa < 1:1363199‑M2/105‑1 (MQ=255) gttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTcc > 1:1936859‑M2/45‑145 (MQ=255) tcaactTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGCTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTcc > 1:2501512/1‑145 (MQ=255) tttttaatcaaattttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTcc‑aaaaaac > 1:1539632‑M2/43‑148 (MQ=255) caactTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCC‑AAAAAc < 1:1781750/150‑1 (MQ=255) aactTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCC‑AAAAACg < 1:508226/150‑1 (MQ=255) aactTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCC‑AAAAACg < 1:2683577/150‑1 (MQ=255) aactTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCC‑AAAAACg < 1:2724325/150‑1 (MQ=255) ctTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATATCAACGTTAATTCC‑AAAAACGTa < 1:112500/150‑1 (MQ=255) aatcaaattttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATCGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTcc‑aaaaaac < 1:3683937‑M2/108‑3 (MQ=255) aaaTAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCC‑AAAAACGTAACtata < 1:443996/150‑1 (MQ=255) attttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAg < 1:1673058‑M2/119‑1 (MQ=255) attttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAg > 1:1647627‑M2/32‑150 (MQ=255) ttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAGATGTTAATAAAATGTATAATTAATTTTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTa < 1:1891191‑M2/122‑1 (MQ=255) ttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTa < 1:2664220‑M2/122‑1 (MQ=255) ttggttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTa < 1:284599‑M2/122‑1 (MQ=255) cTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCC‑AAAAACGTAACTATAAGTTAc > 1:98387/1‑150 (MQ=255) tGAATTACTAACGAAAATTAATCTCAAAAAGTTGTTGACGTAAATGTTAATAAAATGTATGGTTAATTCGTGGCGGTAAGAAAAATGAGCAGGGAAAATTGAGTGGCAAGAGGTCGACGTTAATTCC‑AGAAACGTAACTATAAGTTACaa < 1:1429309/150‑1 (MQ=255) gttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACaa > 1:3634874‑M2/26‑150 (MQ=255) gttaaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACaa < 1:2111018‑M2/125‑1 (MQ=255) taaaaaataaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAAc < 1:1854484‑M2/127‑1 (MQ=255) aaaaaacaaaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACa < 1:2007657‑M2/128‑1 (MQ=255) aaataaaaggacaatatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACatta < 1:1516479‑M2/131‑1 (MQ=255) tAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTCGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCC‑AAAA‑CGTAACTATAAGTTACAAACATTAttt < 1:49218/150‑1 (MQ=255) cGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCC‑AAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAg > 1:733755/1‑150 (MQ=255) aaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAg < 1:2768419‑M2/136‑1 (MQ=255) aaaggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAg < 1:3488100‑M2/136‑1 (MQ=255) ggacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTAt > 1:1224104‑M2/12‑150 (MQ=255) gacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTAtt < 1:3102211‑M2/140‑1 (MQ=255) gacaagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTAtt < 1:1918871‑M2/140‑1 (MQ=255) caagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTATTTa < 1:872616‑M2/142‑1 (MQ=255) caagatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTAAATGACAATATGTCAACGTCAATTCCAAAAAACGCAACTATAAGTTACAAACATTCTTTAGTATTTa > 1:2022052‑M2/9‑150 (MQ=255) aattTCAAAGAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAGGTCC‑AAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTATTTATg < 1:1636649/150‑1 (MQ=255) gatgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGCATTTATGa < 1:205371‑M2/145‑1 (MQ=255) attTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCC‑AAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTATTTATGa > 1:1714200/1‑150 (MQ=255) tgaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAG‑AAAATGAACATTGAAAACTGAATAACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTATTTATGAGc < 1:1623050‑M2/147‑1 (MQ=255) tCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGTAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCC‑AAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTATTTATGAGCt > 1:1000172/1‑150 (MQ=255) aaaaaGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCC‑AAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTATTTATGAGCTaa > 1:1983425/1‑150 (MQ=255) aaaaGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCC‑AAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTATTTATGAGCTAAt > 1:2464763/1‑150 (MQ=255) tgttgACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCC‑AAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTATTTATGAGCTAATCAAAca < 1:369007/150‑1 (MQ=255) | AGCGTTCAGAATGGATAGTAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCC‑AAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTATTTATGAGCTAATCAAACA > Xen36_3/250577‑250871 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |