| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | Xen36_13 | 27,142 | 0 | G | C | 39.5% | 272.4 / 172.5 | 220 | G69R (GGC→CGC) | lipR | Putative acetyl‑hydrolase LipR |
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| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 0.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
ATATTAGAATTAAAGAAAAACGCAGTGTGAAAAGTTATATGTTAGAACAAGGTATACGATTATCTAGAGCTAAGCGTCGTTTTATGTATAAAGAAGAAGCGATGAAAGCATTAGAAAAAATGGCGCCACAGACAGCAGGTGAATATGAGGGCACCAATTATCAGTTTAAGATGCCAGTAACAGTGGATAAGCACTTCGGTTCAACCGTTTATACCGTTAACGATAAACAAGATAAGCATCAACGCGTTGTATTATACGCACATGGAGGCGCATGGTTCCAAGACCCACTCAAAATTCAT > Xen36_13/26993‑27291 | atatTAGAATTAAAGAAAAACGCAGTGTGAAAAGTTATATGTTAGAACAAGGTATACGATTATCTAGAGCTAAGCGTCGTTTTATGTATGAAGAAGAAGCGATGAAAGCATTAGAAAAAATGGCGCCACAGACAGCAGGTGAATATGAgg < 1:2290600/150‑1 (MQ=255) tatTAGAATTAAAGAAAAACGCAGTGTGAAAAGTTATATGTTAGAACAAGGTATACGATTATCTAGAGCTAAGCGTCCTTTTATGTATAAAGAAGAAGCGATGAAAGCATTAGAAAAAATGGCGCCACAGACAGCAGGTGAATATGAggg > 1:3359002/1‑150 (MQ=255) aGAATTAAAGAAAAACGCAGTGTGAAAAGTTATATGTTAGAACAAGGTATACGATTATCTAGAGCTAAGCGTCGTTTTATGTATAAAGAAGAAGCGATGAAAGCATTAGAAAAAATGGCGCCACAGACAGCAGGTGAATATGAGGGCAcc > 1:980973/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |