| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | Xen36_11 | 30 | 0 | T | C | 39.8% | 71.8 / 65.4 | 84 | intergenic (–/‑602) | –/Xen36_02213 | –/S‑formylglutathione hydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/21); new base C (17/16); total (46/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.53e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.21e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGA > Xen36_11/1‑176 | acagtgagtcaggttCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTg < 1:2043075/137‑1 (MQ=255)acagtgagtcagATTCAGATAGCGATGCGGACTCAGACAGTGAGTCGGAGTTAGACAGCGATGCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGAATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTg < 1:3636320/139‑1 (MQ=14) gtgagtcagATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGt < 1:1108688/142‑1 (MQ=255) gtgagtcagATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGt > 1:323770/9‑150 (MQ=255) gcgagtcagATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGt < 1:1639325/142‑1 (MQ=255) tgagtcagATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGCCTCAGACAGt > 1:1214016/8‑145 (MQ=255) gagtcagatgcAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCa < 1:2477050/140‑1 (MQ=255) gagtcagATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCa > 1:2155404/7‑150 (MQ=255) gagtcagATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCa < 1:2279954/144‑1 (MQ=255) gagtcagATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGACTCa > 1:105667/7‑150 (MQ=255) agtcagATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGGCAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAg > 1:1588830/6‑150 (MQ=255) agtcagATTCAGATAGCGATTCGGACGCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAg < 1:3361205/145‑1 (MQ=255) gtcagATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACGGTGAGTCAGa > 1:1803423/5‑150 (MQ=255) gtcagATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGa > 1:675667/5‑150 (MQ=255) gtcagATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGa < 1:462128/146‑1 (MQ=255) gtcagATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGa > 1:804497/5‑150 (MQ=255) tcagactCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGAt < 1:2158376/144‑1 (MQ=255) tcagATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGAt < 1:1804140/147‑1 (MQ=255) tcaaatttagacaGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGAt < 1:2158373/138‑1 (MQ=14) cagATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTTAGATAGCGATTCGGACTCAGATAGTGAGTCAgctt > 1:3738975/3‑147 (MQ=255) aTTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGACTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAg < 1:1616622/150‑1 (MQ=255) aTTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGACTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAg < 1:1616620/150‑1 (MQ=255) tCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGAc < 1:2265993/150‑1 (MQ=255) cAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACa > 1:607795/1‑150 (MQ=255) aGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAg < 1:356164/150‑1 (MQ=255) gacagtgagtcagattCAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGGTTCAGATAGc < 1:636685/135‑1 (MQ=11) gacagtgagtcagattCAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGc > 1:1630062/16‑150 (MQ=11) gATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCCGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGCTTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTTAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGTGATTCGGATTCAGACAGTg > 1:454168/1‑133 (MQ=14) gATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGc < 1:2276750/150‑1 (MQ=255) gATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGCTTCAGACTCAGACAGTGACTCAGCTTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGCCAGTGAGTCAGATTCAgcaggc > 1:1846387/1‑145 (MQ=17) gATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGc > 1:982855/1‑150 (MQ=255) gATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGc < 1:3351698/150‑1 (MQ=255) gATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGc < 1:3224604/150‑1 (MQ=255) gATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGc > 1:1275131/1‑150 (MQ=255) agtgagtcagattCAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGAt > 1:2128706/13‑150 (MQ=11) aGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGAt > 1:1235891/1‑150 (MQ=255) gCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGAtt > 1:2331834/1‑150 (MQ=255) gCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGAtt > 1:3415607/1‑150 (MQ=255) gCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAACGATTCGGCCTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGAtt > 1:3649952/1‑150 (MQ=255) gagtcagattCAGACAGCGAGTTAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGTGACTCAGATTCAGATAGCGAttag > 1:506328/10‑148 (MQ=11) gagtcagattCAGACAGCGAGTTAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGTGACTCAGATTCAGATAGCGAttag > 1:2942911/10‑148 (MQ=11) gagtcagattCAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCg < 1:47787/141‑1 (MQ=11) gagtcagattCAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCg < 1:1522435/141‑1 (MQ=11) gagtcagattCAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCg < 1:3009166/141‑1 (MQ=11) gATTCTGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCg > 1:395446/1‑150 (MQ=255) gATTCTGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCg > 1:2958993/1‑150 (MQ=255) agtcagattCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTTAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCgg < 1:2277903/142‑1 (MQ=11) ttCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGc > 1:2223254/1‑142 (MQ=255) ttCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGa > 1:2543168/1‑150 (MQ=255) ttCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGa < 1:1848851/150‑1 (MQ=255) gtcagattCAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGa > 1:2864661/8‑150 (MQ=11) gtcagattCAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGa > 1:2864660/8‑150 (MQ=11) gtcagattCAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGa > 1:1005487/8‑150 (MQ=11) tcagattCAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTc > 1:979655/7‑116 (MQ=11) tcagattCAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCCGATTCAGATAGCGATTCGGAt > 1:979654/7‑150 (MQ=11) tcagattCAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGAtccagat > 1:771694/7‑144 (MQ=11) cagattCAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGAtt < 1:2237241/145‑1 (MQ=11) cagattCAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGAATCAGATTCAGATAGCGATTCGGAtt > 1:2220981/6‑150 (MQ=11) cagattCAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGAtt > 1:3323785/6‑150 (MQ=11) ggACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGCTTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTc < 1:2408666/150‑1 (MQ=255) ggACTCAGACAGGGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTc < 1:634537/150‑1 (MQ=255) agattCAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTc < 1:1026146/146‑1 (MQ=11) gattCAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCa > 1:1251411/4‑150 (MQ=14) gattCAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCa > 1:523185/4‑150 (MQ=14) gACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCa > 1:264591/1‑150 (MQ=255) gACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCa > 1:2563967/1‑150 (MQ=255) gACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCa > 1:2191249/1‑150 (MQ=255) attCAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACTGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAg < 1:290810/148‑1 (MQ=14) attCAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAg > 1:619149/3‑150 (MQ=14) attCAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAg < 1:811407/148‑1 (MQ=14) attCAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAg > 1:1474601/3‑150 (MQ=14) attCAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAg < 1:2076599/148‑1 (MQ=14) aCTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAg < 1:32853/150‑1 (MQ=255) aCTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAg < 1:2576843/150‑1 (MQ=255) tCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGAc > 1:1243999/1‑150 (MQ=255) cAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACa > 1:1817326/1‑150 (MQ=255) cAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACa < 1:1653127/150‑1 (MQ=14) cAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACa > 1:3623174/1‑150 (MQ=14) cAGACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACa < 1:908547/150‑1 (MQ=14) gACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGc > 1:3286600/1‑150 (MQ=255) gACAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGc < 1:2474600/150‑1 (MQ=14) aCAGCGAGTCAGATTCATACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCg < 1:1186240/150‑1 (MQ=14) aCAGCGAGTCAGATTCATACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGACAGCg < 1:3388729/150‑1 (MQ=14) cAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGCCAGCGATTCGGATTCAGATAGCGa > 1:1565629/1‑150 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGATTCGGATTCAGACAGCGA > Xen36_11/1‑176 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |