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Only 100 of 1213 total aligned reads displayed.
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ttcttGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTttgttgttg < 1:83128/150‑1 (MQ=255) ttcttGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTttgttgttg > 1:267163/1‑150 (MQ=25) ttcttGCCTCTCATTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTttgttgttg < 1:960440/150‑1 (MQ=255) cttGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGAc < 1:2140059/150‑1 (MQ=18) ttGCCTCTCATTATTAGCTTCGCTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGAcc < 1:181185/150‑1 (MQ=12) gtctctCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTGTTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCAt < 1:466305/148‑1 (MQ=25) gCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCAt > 1:3250653/1‑150 (MQ=14) gCCTCTCATTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCAt < 1:1127301/150‑1 (MQ=38) ctctCATTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTg > 1:3167418/1‑150 (MQ=25) ctctCATTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTg < 1:408798/150‑1 (MQ=25) ctctCATTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTg < 1:3130704/150‑1 (MQ=25) ctctCATTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCAGTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTg < 1:2097444/150‑1 (MQ=255) tctcATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGt < 1:107636/150‑1 (MQ=35) attattAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAAc < 1:1052395/150‑1 (MQ=35) ttatcaGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAAct > 1:2846497/1‑150 (MQ=25) tattaGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATNGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAActt < 1:3571080/150‑1 (MQ=25) | TTCTGGTTTTATTTTATTAAGAATCCCTCGAGCATTCTCTTTAGAATAAACATCTTCTAAAAGTCTCTTCACTGTTGATTCTCTATTTGTTGATTCATTTATTTTTTTTAACAACTCTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTT > Xen36_30/916‑1214 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |