| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen36_34 | 1 = | 0 (0.000) | 92 (0.750) +CCATTTATTTTTACACGAT |
60/260 | 1.4 | 63.6% | noncoding (74/74 nt) | Xen36_02619 | tRNA‑Ala(tgc) |
| ? | Xen36_6 | = 134 | 121 (0.690) | intergenic (–/+640) | –/perR | –/Peroxide‑responsive repressor PerR | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGAGACTAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTAAGCCCCCATAAAATGGAATTTAAGAAGTAATCGGGAAGACAGGATTCGAACCTGCGACCCCTTGGTCCCAAACCAAGT > Xen36_34/1‑144 | gccaggatcagactctccataaaaattatgatggttgattagctcataaatacgaaataatgtttgtaacttatagttacgttttttggaattaacgttgacatattgtcattcagttttcaatgttcatcgtgtaaaaataaatggtgg > 1:2196942‑M1/148‑150 (MQ=255)gccaggatcaaactctccataaaaattatgatgtttgattagctcataaatactaaataatgtttgtaacttatagttacgttttttggaattaacgttgacatattgtcattcagttttcaatgttcatcgtgtaaaaataaatggtgg < 1:2091603‑M1/3‑1 (MQ=255)gccaggatcaaactctccataaaaattatgatgtttgattagctcataaatactaaataatgtttgtaacttatagttacgttttttggaattaacgttgacatattgtcattcagttttcaatgttcatcgtgtaaaaataaatggtgg < 1:1904263‑M1/3‑1 (MQ=255)gccaggatcaaactctccataaaaattatgatgtttgattagctcataaatactaaataatgtttgtaacttatagttacgttttttggaattaacgttgacatattgtcattcagttttcaatgttcatcgtgtaaaaataaatggtgg 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tcatcgtgtaaaaataaatggTGGAGACTAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTAAGCCCCCATAAAATGGAATTTAAGAAGTAATCGGGAAGACAGGATTCGAACCTGCGACCCCtt < 1:1731899‑M1/129‑1 (MQ=255) atcgtgtaaaaataaatggTGGAGACTAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTAAGCCCCCATAAAATGGAATTTAAGAAGTAATCGGGAAGACAGGATTCGAACCTGCGACCCCTTgg > 1:1869386‑M1/20‑150 (MQ=255) gtgtaaaaataaatggTGGAGACTAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTAAGCCCCCATAAAATGGAATTTAAGAAGTAATCGGGa > 1:744366‑M1/17‑118 (MQ=255) gtgtaaaaataaatggTGGAGACTAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTAAGCCCCCATAAAATGGAATTTAAGAAGTAATCGGGAAGACAGGATTCGAACCTGCGCCCCCTTGGTcc < 1:3671655‑M1/134‑1 (MQ=255) gtgtaaaaataaatggTGGAGACTAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTAAGCCCCCATAAAATGGAATTTAAGAAGTAATCGGGAAGACAGGATTCGAACCTGCGACCCCTTGGTcc > 1:2129492‑M1/17‑150 (MQ=255) gtgtaaaaataaatggTGGAGACTAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTAAGCCCCCATAAAATGGAATTTAAGAAGTAATCGGGAAGACAGGATTCGAACCTGCGACCCCTTGGTcc > 1:3083062‑M1/17‑150 (MQ=255) gtgtaaaaataaatggTGGAGACTAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTAAGCCCCCATAAAATGGAATTTAAGAAGTAATCGGGAAGACAGGATTCGAACCTGCGACCCCTTGGTcc > 1:1819102‑M1/17‑150 (MQ=255) tgtaaaaataaatggTGGAGACTAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTAAGCCCCCATAAAATGGAATTTAAGAAGTAATCGGGAAGACAGGATTCGAACCTGCGACCCCTTGGTccc < 1:299486‑M1/135‑1 (MQ=255) gtaaaaataaatggTGGGGACTAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTAAGCCCCCATAAAATGGAATTTAAGAAGTAATCGGGAAGACAGGATTCGAACCTGCGACCCCTTGGTCCCa < 1:1347162‑M1/136‑1 (MQ=255) gtaaaaataaatggTGGAGACTAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTAAGCCCCCATAAAATGGAATTTAAGAAGTAATCGGGAAGACAGGATTCGAACCTGCGACCCCTTGGTCCCa > 1:2269600‑M1/15‑150 (MQ=255) aaaaataaatggTGGAGACTAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTAAGCCCCCATAAAATGGAATTTAAGAAGTAATCGGGAAGACAGGATTCGAACCTGCGACCCCTTGGTCCCaaa < 1:3489846‑M1/138‑1 (MQ=255) aaaaataaatggTGGAGACTAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTAAGCCCCCATAAAATGGAATTTAAGAAGTAATCGGGAAGACAGGATTCGAACCTGCGACCCCTTGGTCCCaaa < 1:2234516‑M1/138‑1 (MQ=255) aataaatggTGGAGACTAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTAAGCCCCCATAAAATGGAATTTAAGACGTAATCGGGAAGAAAGGATTCGAACCTGCGACCCCTTGGTCCCAAACCa < 1:2027683‑M1/141‑1 (MQ=255) aataaatggTGGAGACTAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTAAGCCCCCATAAAATGGAATTTAAGAAGTAATCGGGAAGACAGGATTCGAACCTGTAACCCCTTGGTCCCAAACCa < 1:2027675‑M1/141‑1 (MQ=255) aataaatggTGGAGACTAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTAAGCACCCATAAAATGGAATTTAAGAAGTAATCGGGAAGACAGGATTCGAACCTGCGACCCCTTGGTCCCAAACCa < 1:2027679‑M1/141‑1 (MQ=255) aaatggTGGAGACTAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTAAGCCCCCATAAAATGGAATTTAAGAAGTAATCGGGAAGAAAGGATTCGAACCTGCGACCCCTTGGTCCCAAACCAAGt < 1:307346‑M1/144‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGAGACTAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTAAGCCCCCATAAAATGGAATTTAAGAAGTAATCGGGAAGACAGGATTCGAACCTGCGACCCCTTGGTCCCAAACCAAGT > Xen36_34/1‑144 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |