| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen36_1 | 169208 = | 110 (0.730) | 38 (0.290) +CAGAAGCTGGTGGAAAGC |
29/262 | 4.4 | 32.8% | intergenic (+225/+221) | mleS/Xen36_00161 | Malolactic enzyme/Epimerase family protein |
| ? | Xen36_1 | 256545 = | 67 (0.440) | intergenic (+212/+237) | gluD/glpQ_1 | NAD‑specific glutamate dehydrogenase/Glycerophosphodiester phosphodiesterase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
CCAATATTCATAAGTGACTTTAAAGTTATATCTATATGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGGACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAGCGCATTTTCATTCAGTCAACTACTGCCAATATAATATTATA > Xen36_1/169060‑169357 | gcacattattgtaagctgactttccgccagcttctatgttggggccccgccaacttgcacattattgtaagctgactttccgtcagcttctatgttggggccccgCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATg > 1:1604819‑M1/106‑150 (MQ=255) atatTCATAAGTGACTTTAAAGTTATATCTATATGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGGACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTg < 1:1067757/150‑1 (MQ=255) atatTCATAAGTGACTTTAAAGTTATATCTATATGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGGACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTg < 1:2886066/150‑1 (MQ=255) tatTCATAAGTGACTTTAAAGTTATATCTATATGTAACATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGGACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTgg < 1:1889352/150‑1 (MQ=255) atTCATAAGTGACTTTAAAGTTATATCTATATGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGGACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTggg < 1:3032050/150‑1 (MQ=255) atTCATAAGTGACTTTAAAGTTATATCTATACGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGAACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTggg < 1:701511/150‑1 (MQ=255) atgtgtactaaaaaaataggaatacatgagtaaaactcatgcataagaaatactaactactatagaaaaagtatttctttatcgttgtcccaccccaacttgcacattattgtaagctgactttccgcCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCg < 1:3711558‑M2/22‑1 (MQ=255) aCTTTAAAGTTATATCTATACGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGGACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTTAGCTTCTATGTTggg > 1:589640/1‑139 (MQ=255) taaaaaaataggaatacatgagtaaaactcatgcataagaaatactaattactatagaaaaagtatttctttatcgttgtcccaccccaacttgcacattattgtaagctgactttccgcCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTg > 1:2038189‑M2/121‑150 (MQ=255) taaaaaaataggaatacatgagtaaaactcatgcataagaaatactaattactatagaaaaagtatttctttatcgttgtcccaccccaacttgcacattattgtaagctgactttccgcCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTg > 1:1340694‑M2/121‑150 (MQ=255) taaaaaaataggaatacatgagtaaaactcatgcataagaaatactaattactatagaaaaagtatttctttatcgttgtcccaccccaacttgcacattattgtaagctgactttccgcCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTg > 1:2954110‑M2/121‑150 (MQ=255) tAAAGTTATATCTATATGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGGACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGc < 1:748710/150‑1 (MQ=255) tAAAGTTATATCTATATGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGGACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGc < 1:2673208/150‑1 (MQ=255) 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1:1044149‑M2/35‑100 (MQ=255) aaCTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCaacttgcattgtctgtagaaattgggaatccaatttct > 1:2955396‑M1/1‑112 (MQ=255) aCTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAgc < 1:3599664/150‑1 (MQ=255) cTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCaacttgcattgtctgtagaaattgggaatccaatttctct > 1:1622122‑M1/1‑110 (MQ=255) cTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAgcg < 1:2148071/150‑1 (MQ=255) tGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGTGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCACCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCaacttgcattgtctatagaaattgggaatccaatttctcttt > 1:2410940‑M1/1‑108 (MQ=255) gCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAGCGCAt > 1:1239375/1‑150 (MQ=255) caTTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAGCGCAtttt < 1:1920487/150‑1 (MQ=255) attattGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAGCGCATTttc < 1:1952875/150‑1 (MQ=255) gTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCaacttgcattgtctgtagaaattgggaatccaatttctctttgttggggccca > 1:716249‑M1/1‑97 (MQ=255) aaGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAgcg < 1:762230/135‑1 (MQ=255) gCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCaacttgcattgtctgtagaaattgggaatccaatttctctttgttggggcccacacc > 1:671091‑M1/1‑93 (MQ=255) gCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTGCCGTCAGTTTCTATGTTTGGGCCCCGCTaacttgcattgtctgtagaaattgggaagccaatttctctttgttggggcccacacc < 1:391009‑M1/150‑58 (MQ=255) gACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACCTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAGCGCATTTTCATTCAGTCAacta > 1:225680/1‑150 (MQ=255) cTTTCCGTCAGCTTCTCTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTCTTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGAGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAAAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAGCGCATTTTCATTCAGTCAactact > 1:1453518/1‑150 (MQ=37) tttCCTTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGTGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAGCGCATTTTCATTCAGTCAACTACTg < 1:3383137/150‑1 (MQ=255) tCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAGCGCATTTTCATTCAGTCAACTACTGcc < 1:2730300/150‑1 (MQ=255) ccGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCaacttgcattgtctgtagaaattgggaatccaatttctctttgttggggcccacaccccaactcgc > 1:1158189‑M1/1‑84 (MQ=255) cGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTCGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAGCGCATTTTCATTCAGTCAACTACTGCCaa > 1:602775/1‑150 (MQ=255) gTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAGCGCATTTTCATTCAGTCAACTACTGCCaat > 1:2133154/1‑150 (MQ=255) cAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAGCGCATTTTCATTCAGTCAACTACTGCCaatat > 1:286965/1‑150 (MQ=255) gCTTCTATGCTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCaacttgcacattattgtaagctgacattccgtcagcttctatgttggggccccgccaacttgcacattattg > 1:3315226‑M2/1‑78 (MQ=255) cTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCaacttgcattgtctgtagaaattgggaatccaatttctctttgtttgggcccacaccccaactcgcattgcct > 1:2055537‑M1/1‑77 (MQ=255) cTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAGCGCATTTTCATTCAGTCAACTACTGCCaatataat < 1:83718/150‑1 (MQ=255) tCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCaacttgcacattattgtaagctgactttccgtcagcttctatgttggggccccgccaacttgcacattattgtaa > 1:600234‑M2/1‑75 (MQ=255) tGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAGCGCATTTTCATTCAGTCAACTACTGCCAATATAATATtata < 1:3401065/150‑1 (MQ=255) tGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACCAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAGCGCATTTTCATTCAGTCAACTACTGCCAATATAATATtata < 1:56954/150‑1 (MQ=255) | CCAATATTCATAAGTGACTTTAAAGTTATATCTATATGTAATATCAGCAAATAGAAGGGAGTGGGACAAAAATGATATTTTTACAATTTTTTTTGTTGTCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAGCGCATTTTCATTCAGTCAACTACTGCCAATATAATATTATA > Xen36_1/169060‑169357 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |