| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen36_1 | = 86 | 65 (0.430) | 67 (0.410) +A |
42/296 | 3.2 | 40.3% | intergenic (–/‑20) | –/nth_1 | –/Endonuclease III |
| ? | Xen36_14 | 47623 = | 135 (0.740) | intergenic (+108/–) | argS/– | Arginine‑‑tRNA ligase/– | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCTAAAGCTCAAGGGGAGTTAA‑GGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAAGGAGGATGTAAATGTTAGGAACTGATGAATTGTATAAATTGTTATATAGGCATATGGGACCTCAAAATTGGTGGCCTGCTGATAATGACATTGAAATGATGTTAGGTGCAATTTTAGTTCAAAATACTAGATGGCGAAAT > Xen36_1/1‑234 | ctcaagggggttaaaggaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTTAA‑GGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAgggg < 1:3544349‑M1/86‑1 (MQ=255) tcaagggggttaaaggaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTTAA‑GGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGc > 1:3719431‑M1/64‑150 (MQ=255) caaggggagttaaagaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagccactaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTTAA‑GGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCAACAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAaggggg < 1:1969026‑M1/88‑2 (MQ=255) gggttaaaggaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTTAA‑GGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTaaa < 1:177878‑M1/93‑1 (MQ=255) ggagtaaaggaatacagtttgcttgcttgcccagcaactgtaaaagagcccctaatcTCTGAAGCTCAGGGGGAGTTAA‑GGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTTAAGGGGCTCTaaa > 1:3608643‑M1/58‑150 (MQ=255) ggttaaaggaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTTAA‑GGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAACCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTaaaa < 1:2132435‑M1/94‑1 (MQ=255) gttaaaggaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTTAA‑GGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAag < 1:850154‑M1/95‑1 (MQ=255) gttaaaggaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTTAA‑GGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAAGGGCTATAAAag < 1:1224926‑M1/95‑1 (MQ=255) ttgaaggactgcagttggcttgcttgcgcagcaacggcaaaagagcccctaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTTAA‑GGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAagg > 1:1749848‑M1/55‑150 (MQ=255) taaaggaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTTAA‑GGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAagga < 1:512192‑M1/97‑1 (MQ=255) taaaggaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTTAA‑GGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAagga < 1:456816‑M1/97‑1 (MQ=255) aaaggaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTTAA‑GGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAaggag > 1:482184‑M1/53‑150 (MQ=255) aaaggaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTTAA‑GGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAaggag > 1:1696136‑M1/53‑150 (MQ=255) aaaggaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTTAA‑GGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAaggag > 1:3052158‑M1/53‑150 (MQ=255) aggaatacatttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTTAA‑GGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAAggagga > 1:1023366‑M1/51‑150 (MQ=255) aggaatacagttggcttgctggcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcGCGAAAGCTCAAGGGGAGTTAG‑GGGATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAAggagga > 1:1023363‑M1/51‑150 (MQ=255) aggaagacagttggcttgcttgcgcagcaacggcaaaagagcccctaatcGCGAAAGCTCAAGGGGAGTTAA‑GGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAAggagga > 1:1023365‑M1/51‑150 (MQ=255) gaatacagttggcttgcttgcgcagcaactgcaaaagagcccctaatcGCTAAAGCTCAAGGGGAGTTAA‑GGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAAGGAGGATg > 1:735851‑M1/49‑150 (MQ=255) 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aaGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAAGGAGGATGTAAATGTTAGGAACTGATGAATTGTATAAATTGTTATATAGGCATATGGGACCTCAAAATTGGTGGCCTGCTGATAATGACATTGAAATGATGTTAGGTGCAAt > 1:629040/1‑150 (MQ=255) aaGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAAGGAGGATGTAAATGTTAGGAAATGATGAATTGTATAAATTGTTATATAGGCATATGGGACCTCAAAATTGGTGGCCTGCTGATAATGACATTGAAATGATGTTAGGTGCAAt > 1:629036/1‑150 (MQ=255) agCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAAGGAGGATGTAAATGTTAGGAACTGATGAATTGTATAAATTGTTATATAGGCATATGGGACCTCAAAATTGGTGGCCTGCTGATAATGACATTGAAATGATGTTAGGTGCAAtttt < 1:155493/150‑1 (MQ=255) agCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAAGGAGGATGTAAATGTTAGGAACTGATGAATTGTATAAATTGTTATATAGGCATATGGGACCTCAAAATTGGTGGCCTGCTGATAATGACATTGAAATGATGTTAGGTGCAAtttt < 1:155492/150‑1 (MQ=255) cccTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAAGGAGGATGTAAATGTTAGGAACTGATGAATTGTATAAATTGTTATATAGGCATATGGGACCTCAAAATTGGTGGCCTGCTGATAATGACATTGAAATGATGTTAGGTGCAAtttt > 1:1839662/1‑147 (MQ=255) aTCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAAG‑AGGATGTAAATGTTAGGAACTGATGAATTGTATAAATTGTTATATAGGCATATGGGACCTCAAAATTGGTGGCCTGCTGATAATGACATTGAAATGATGTTAGGTGCAATTTTAGTTCaaaa > 1:3708530/1‑150 (MQ=255) cGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAAGGAGGATGTAAATGTTAGGAACTGATGAATTGTATAAATTGTTATATAGGCATATGGGACCTCAAAATTGGTGGCCTGGTGATAATGACATTGAAATGATGTTAGGTGCAATTTTAGTTCAAAAt > 1:2256305/1‑150 (MQ=255) gCNAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAAGGAGGATGTAAATGTTAGGAACTGATGAATTGTATAAATTGTTATATAGGCATATGGGACCTCAAAATTGGTGGCCTGCTGATAATGACATTGAAATGATGTTAGGTGCAATTTTAGTTCAAAATa > 1:273038/1‑150 (MQ=255) tAAATCTCAAGGGGCTCTAAAAGGAGGATGTAAATGTTAGGAACTGATGAATTGTATAAATTGTTATATAGGCATATGGGACCTCAAAATTGGTGGCCTGCTGATAATGGCATTGAAATGATGTTAGGTGCAATTTTAGTTCAAAATACt > 1:253724/1‑150 (MQ=255) tAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAAGGAGGATGTAAATGTTAGGAACTGATGAATTGTATAAATTGTTATATAGGCATATGGGACCTCAAAATTGGTGGCCTGCTGATAATGACATTGAAATGATGTTAGGTGCAATTTTAGTTCAAAATACt > 1:598108/1‑150 (MQ=255) aaGCTCAAGGGGCTCTAAAAGGAGGATGTAAATGTTAGGAACTGATGAATTGTATAAATTGTTATATAGGCATATGGGACCTCAAAATTGGTGGCCTGCTGATAATGACATTGAAATGATGTTAGGTGCGATTTTAGTTCAAAATACTAg < 1:2525058/150‑1 (MQ=255) aGCTCAAGGGGCTCTAAAAGGAGGATGTAAATGTTAGGAACTGATGAATTGTATAAATTGTTATATAGGCATATGGGACCTCAAAATTGGTGGCCTGCTGATAATGACATTGAAATGATGTTAGGTGCACtttt > 1:2010274/1‑134 (MQ=255) gCTCAAGGGGCTCTAAAAGGAGGATGTAAATGTTAGGAACTGATGAATTGTATAAATTGTTATATAGGCATATGGGACCTCAAAATTGGTGGCCTGCTGATAATGACATTGAAATGATGTTAGGTGCAATTTTAGTTCAAAATACTAGAt > 1:290813/1‑150 (MQ=255) gCTCAAGGGGCTCTAAAAGGAGGATGTAAATGTTAGGAACTGATGAATTGTATAAATTGTTATATAGGCATATGGGACCTCAAAATTGGTGGCCTGCTGATAATGACATTGAAATGATGTTAGGTGCAATTTTAGTTCAAAATACTAGAt > 1:1646361/1‑150 (MQ=255) cTCAAGGGGCTCTAAAAGGAGGATGTAAATGTTAGGAACTGATGAATTGTATAAATTGTTATATAGGCATATGGGACCTCAAAATTGGTGGCCTGCTGATAATGACATTGAAATGATGTTAGGTGCAATTTTAGTTCAAAATACTAGATg > 1:3256403/1‑150 (MQ=255) cTCAAGGGGCTCTAAAAGGAGGATGTAAACGTTAGGAACTGATGAATTGTATAAATTGTTATATAGGCATATGGGACCTCAAAATTGGTGGCCTGCTGATAATGACATTGAAATGATGTTAGGTGCAATTTTAGTTCAAAATACTAGATg > 1:544894/1‑150 (MQ=255) cTCAAGGGGCTCTAAAAGGAGAATGTAAATGTTAGGAACTGATGAATTGTATAAATTGTTATATAGGCATATGGGACCTCGAAATTGGTGGCCTGCTGATAATGACATTGAAATGATGTTAGGTGCAATTTTAGTTCAAAATACTAGaag > 1:2598612/1‑148 (MQ=255) cTCAAGGGGCTCTAAAAGGAGAATGTAAATGTTAGGAACTGATGAATTGTATAAATTGTTATATAGGCATATGGGACCTCGAAATTGGTGGCCTGCTGATAATGACATTGAAATGATGTTAGGTGCAATTTTAGTTCAAAATACTAGaag > 1:2598613/1‑148 (MQ=255) cTCAAGGGGCTCTAAAAGGAGAATGTAAATGTTAGGAACTGATGAATTGTATAAATTGTTATATAGGCATATGGGACCTCGAAATTGGTGGCCTGCTGATAATGACATTGAAATGATGTTAGGTGCAATTTTAGTTCAAAATACTAGaag > 1:120736/1‑148 (MQ=255) cAAGGGGCTCTAAATGGAGGATGTAAATGTTAGGAACTGATGAATTGTATAAATTGTTATATAGGCATATGGGGCCTCAAAATTGGTGGCCTGCTGATAATGACATTGAAATGATGTTAGGTGCAATTTTAGTTCAAAATACTAGATGGc > 1:3703070/1‑150 (MQ=255) aaGGGGCTCTAAAAGGAGGATGTAAATGTTAGGAACTGATGAATTGTATAAATTGTTATATAGGCATATGGGACCTCAAAATTGGTGGCCTGCTGATAATGACATTGAAATGATGTTAGGTGCAATTTTAGTTCAAAATACTAGATTGCg < 1:1119360/150‑1 (MQ=255) ggCTCTAAAAGGAGGATGTAAATGTTAGGAACTGATGAATTGTATAAATTGTTATATAGGCATATGGGACCTCAAAATTGGTGGCCTGCTGATAATGACATTGAAATGATGTTAGGTGCAATTTTAGTTCAAAATACTAGATGGCGAAAt > 1:57181/1‑150 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCTAAAGCTCAAGGGGAGTTAA‑GGAATACAGTTGGCTTGCTTGCGCA‑CAACTGCAAAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGCTCTAAAAGGAGGATGTAAATGTTAGGAACTGATGAATTGTATAAATTGTTATATAGGCATATGGGACCTCAAAATTGGTGGCCTGCTGATAATGACATTGAAATGATGTTAGGTGCAATTTTAGTTCAAAATACTAGATGGCGAAAT > Xen36_1/1‑234 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |