| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen36_23 | 1 = | 0 (0.000) | 282 (0.530) | 108/284 | 4.4 | 48.9% | intergenic (–/+1574) | –/Xen36_02602 | –/hypothetical protein |
| ? | Xen36_23 | = 216 | 590 (1.110) | intergenic (–/+1359) | –/Xen36_02602 | –/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
AATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen36_23/149‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atgagagGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTGATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTA < Xen36_23/216‑75 CAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAA > 1:3750715/1‑150 ACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAGGAAGT < 1:1143191/150‑1 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1:2985722/150‑1 AATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTGATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAG < 1:82763/150‑1 AATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTGATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAG < 1:3436888/150‑1 AATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTGATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAG > 1:2994270/1‑150 AATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTGATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAG < 1:1969555/150‑1 ATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTGATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGT > 1:1659454/1‑150 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1:2185923/1‑144 AAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTGATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAACGTTAAACGAAGCTA > 1:207403/1‑150 GAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACCAAAGTTAAACGAAGCTGATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAAT < 1:2694604/150‑1 GAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACCAAAGTTAAACGAAGCTGATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAAT < 1:418292/150‑1 GAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTGATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAAT > 1:1122305/1‑150 AGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTGATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAA > 1:442014/1‑150 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TAATAATGAGAGGCAAGGAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTGATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAA < 1:1509769/150‑1 TAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTGATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAA < 1:616151/150‑1 TAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTGATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAA < 1:3059565/150‑1 AATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTGATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACACCAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAG > 1:806887/1‑150 AATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTGATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGACAACAACAAAAG < 1:195881/150‑1 ATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTGATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGT < 1:1054262/150‑1 AATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTGATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTA < 1:1321503/150‑1 AATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTGATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTA < 1:3283747/150‑1 AATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCAGATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTA > 1:1806897/1‑150 AATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen36_23/149‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atgagagGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTGATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTA < Xen36_23/216‑75 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |