| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen36_16 | 1 = | 0 (0.000) | 77 (0.530) +CCAATATA |
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| ? | Xen36_16 | = 35410 | 62 (0.410) | noncoding (74/74 nt) | Xen36_02516 | tRNA‑Glu(ttc) | |||||
TTGAACCCCCAACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen36_16/148‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCCGATAGCTCTACCACTGAGCTACTGTGGA < Xen36_16/35410‑35262 |||||||| TTGAACCCCCAACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCTATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCCGAGCTAATTCTCC < 1:2729984/150‑1TTGAACCCCCAACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCTATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCCGAGCTAATTCTCC < 1:527523/150‑1 gttaattaataatcaAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCAATATAATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGT < 1:2065116/135‑1 ttaattaataatcaAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCAATATAATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTC > 1:1867172/15‑150 taattaataatcaAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCAATATAATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCT > 1:659153/14‑150 aattaataatcaAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCAATATAATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTT > 1:558432/13‑150 ttaataatcaAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCAGTATAATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAA > 1:932742/11‑150 taataatcaAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCAATATAATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAAC < 1:2180066/141‑1 aataatcaAAATGGTGGAGAATGACGGGTTTGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCAATATAATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACC < 1:3668548/142‑1 aatcaAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGTTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCAATATAATGACTCCTACGTGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCT > 1:3521408/6‑150 aatcaAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCAATATAATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCT > 1:2111192/6‑150 aatcaAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCAATATAATGACTCATACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCT > 1:3521405/6‑150 atcaAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCAATATAATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTT > 1:91180/5‑150 tcaAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCAATATAATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTG > 1:2060685/4‑150 tcaAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCAATATAATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTG > 1:1817905/4‑150 tcaAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCAATATAATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTG < 1:1343094/147‑1 caAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCTGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCAATATAATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGA > 1:1262989/3‑150 AAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCAATATAATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTT < 1:349485/146‑1 AATGGTTGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCAATATAATTACCCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCA < 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GCTAATTCTCCAATATAATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCCGATA > 1:293065/1‑142 TAATTCTCCAATATAATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCCGATAGCTCTACCAC < 1:3209391/150‑1 ATTCTCCAATATAATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCCGATAGCTCTACCACTG > 1:3373245/1‑150 TTCTCCAATATAATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCCGATAGCTCTATCACTGA < 1:502137/150‑1 TCTCCAATATAATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGCTAACAGCCGATAGCTCTACCACGGAG < 1:1247703/150‑1 CCAATATAATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGACTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCCGATAGCTCTACCACTGAGCTA > 1:2306654/1‑150 CCAATATAATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAAGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCCGATAGCTCTACCACTGAGCTA > 1:1225278/1‑150 TAATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCCGATAGCTCTACCACTGAGCTACTGTGG > 1:2558023/1‑150 TAATGACCCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAAACGCTTGACCCAGGCGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCCGATAGCTCTACCACTGCGCTACTGTGG > 1:3398109/1‑150 AATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCCGATAGCTCTACCACTGAGCTACTGTGGc > 1:1286030/1‑149 AATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCCGATAGCTCTACCACTGAGCTACTGTGGA > 1:336981/1‑150 AATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCCGATAGCTCTACCACTGAGCTACTGTGGA < 1:1613406/150‑1 AATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCCGATAGCTCTACCACTGAGCTACTGTGGA > 1:3647312/1‑150 AATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCCGATAGCTCTACCACTGAGCTACTGTGGA > 1:1286029/1‑150 AATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCCGATAGCTCTACCACTGAGCTACTGTGGA < 1:3029596/150‑1 |||||||| TTGAACCCCCAACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen36_16/148‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCCGATAGCTCTACCACTGAGCTACTGTGGA < Xen36_16/35410‑35262 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |