| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_168 | 1 = | 0 (0.000) | 70 (0.090) | 47/246 | 1.4 | 100% | intergenic (–/+59) | –/Xen14_04774 | –/IS200/IS605 family transposase IS200C |
| ? | Xen14_80 | 26 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+67) | –/arcA | –/Aerobic respiration control protein ArcA | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTTAGGGCGCGGCTGGTAAGAGAGCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGAAGCGATAACCTTCACCGTGAATGGTGGCGATGATTTCCGGCGTATCCGGCGTAGATTC > Xen14_80/1‑173 | ttccctatccgggcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGAc < 1:832382‑M2/53‑1 (MQ=255) tccctatccgggcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACg > 1:3580255‑M2/97‑150 (MQ=255) ccctatccgggcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACgg > 1:506099‑M2/96‑150 (MQ=255) cctatccgggcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACggt > 1:2580097‑M2/95‑150 (MQ=255) cctatccgggcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACggt > 1:732194‑M2/95‑150 (MQ=255) tatccgggcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACggtgg < 1:4075225‑M2/58‑1 (MQ=255) gggcagcccgtttacgggccgtaagtaacgacgttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctgggaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAg < 1:4199166‑M2/63‑1 (MQ=255) gcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtgagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTACGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGcc < 1:2654742‑M2/65‑1 (MQ=255) gcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtgagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTACGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGcc < 1:2654741‑M2/65‑1 (MQ=255) gcagcccgtttacgggccataagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGcc < 1:2658815‑M2/65‑1 (MQ=255) agcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGa > 1:3253862‑M2/84‑150 (MQ=255) gcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGAt > 1:723639‑M2/83‑150 (MQ=255) gcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGAt > 1:2343885‑M2/83‑150 (MQ=255) gcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGAt > 1:2059178‑M2/83‑150 (MQ=255) gcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGAt > 1:912450‑M2/83‑150 (MQ=255) gcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGAt > 1:2667255‑M2/83‑150 (MQ=255) cccgtttacgggccgtaagtcacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGAtt > 1:100425‑M2/82‑150 (MQ=255) cccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGAtt > 1:100426‑M2/82‑150 (MQ=255) cccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGAtt < 1:3738844‑M2/69‑1 (MQ=255) 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acgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTc < 1:3867‑M2/76‑1 (MQ=255) ggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAg < 1:2568545‑M2/79‑1 (MQ=255) ccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGAt < 1:3206758‑M2/81‑1 (MQ=255) ccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGAt < 1:2908221‑M2/81‑1 (MQ=255) cgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGAtt < 1:3050216‑M2/69‑1 (MQ=255) cgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTcc > 1:2589829‑M2/69‑145 (MQ=255) cgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAg > 1:3160887‑M2/69‑147 (MQ=255) cgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATc < 1:2709606‑M2/82‑1 (MQ=255) gtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCa < 1:2123002‑M2/83‑1 (MQ=255) taagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCTCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCAc < 1:364147‑M2/84‑1 (MQ=255) 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cTGGTAAGAGAGCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGAAGCGATAACCTTCACCGTGAATGGTGGCGATGATTtccggcgtatccg > 1:3965425/1‑150 (MQ=255) tGGTAAGAGAGCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGAAGCGATAACCTTCACCGTGAATGGTGGCGATGATTtccggcgtatccgg > 1:660307/1‑150 (MQ=255) ggTAAGAGAGCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGAAGCGATAACCTTCACCGTGAATGGTGGCGATGATTtccggcgtatccggc < 1:3947301/150‑1 (MQ=255) gTAAGAGAGCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGAAGCGATAACCTTCACCGTGAATGGTGGCGATGATTtccggcgtatccggcg < 1:1294848/150‑1 (MQ=255) agagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGAAGCGATAACCTTCACCGTGAATGGTGGCGATGATTTCCGGCGTATCCGGCGTAg > 1:2408372/1‑150 (MQ=255) 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agCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGAAGCGATAACCTTCACCGTGAATGGTGGCGATGATTTCCGGCGTATCCGGCGTAGATTc < 1:1097008/150‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTTAGGGCGCGGCTGGTAAGAGAGCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGAAGCGATAACCTTCACCGTGAATGGTGGCGATGATTTCCGGCGTATCCGGCGTAGATTC > Xen14_80/1‑173 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |