| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_163 | = 753 | 0 (0.000) | 95 (0.510) | 61/294 | 0.4 | 61.9% | intergenic (‑125/–) | ompX_3/– | Outer membrane protein X/– |
| ? | Xen14_170 | = 168 | 117 (0.930) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
CAATCCGTGGTAAATGTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGATTTCATTCGCTACGAACGCCCTGTTCCCGGTGATCGGGTTCAGATGGATACCTGTTAAATTGGCCCCGGCTTATATCAGTACACATCT > Xen14_170/20‑314 | caATCCGTGGTAAATGTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAc < 1:1873063/150‑1 (MQ=255) aTCCGTGGTAAATGTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCa > 1:630060/1‑150 (MQ=255) cGTGGTAAATGTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGACGAGGCGCTTAcgactg > 1:262995‑M2/1‑144 (MQ=255) cGTGGTAAATGTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAg < 1:3153458/150‑1 (MQ=255) ggTAAATGTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTcc < 1:2909229/150‑1 (MQ=255) ggTAAATGTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTcc > 1:1502373/1‑150 (MQ=255) gTACATGTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACATACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacg < 1:3754068‑M2/150‑11 (MQ=255) tAAATGTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGAGGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacgg > 1:3762308‑M2/1‑139 (MQ=255) tAAATGTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacgg > 1:1057740‑M2/1‑139 (MQ=255) aaTGTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTg < 1:2022998/150‑1 (MQ=255) aTGTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtga < 1:392598‑M2/150‑15 (MQ=255) tGTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgat < 1:1571087‑M2/150‑16 (MQ=255) ttcttcAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattg > 1:1328527‑M2/1‑133 (MQ=255) cttcAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtg < 1:778525‑M2/150‑20 (MQ=255) cttcAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtg < 1:299392‑M2/150‑20 (MQ=255) tcAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgac > 1:1192948‑M2/1‑129 (MQ=255) tcAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgac > 1:3981324‑M2/1‑129 (MQ=255) tcAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgaccgtacggtgattgtgac > 1:1028393‑M2/1‑129 (MQ=255) tcAAAGCGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgac > 1:1447627‑M2/1‑129 (MQ=255) aaaGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAg > 1:1361282/1‑150 (MQ=255) aGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATAGTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATTAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCAAGAATCAGGt < 1:842463/150‑1 (MQ=255) gAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgacc < 1:3674339‑M2/144‑23 (MQ=255) aaGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgaccaaaaaag < 1:4153628‑M2/150‑30 (MQ=255) aaGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgaccaaaaaag < 1:1417799‑M2/150‑30 (MQ=255) ggcGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAAcc < 1:3273423/148‑1 (MQ=255) cGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCtg > 1:2613962/1‑150 (MQ=255) aaaGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAACGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCtgttg < 1:913655/150‑1 (MQ=255) gCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTa > 1:4033734/1‑150 (MQ=255) cTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTaa > 1:1982709/1‑150 (MQ=255) ttCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgaccaaaaaagcggcttccggca > 1:3809641‑M2/1‑109 (MQ=255) ttCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTaaa > 1:1373300/1‑150 (MQ=255) tCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgaccaaaaaagcggcttccggcat < 1:4082505‑M2/150‑43 (MQ=255) tCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAAt > 1:704131/1‑150 (MQ=255) cGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAAtt > 1:1149833/1‑150 (MQ=255) tGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgaccaaaaaagcggcttccggcatcagt < 1:3467970‑M2/150‑47 (MQ=255) tGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgaccaaaaaagcggcttccggcatcagt < 1:3086737‑M2/150‑47 (MQ=255) aTCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgaccaaaaaagcggcttccggcatcagtat > 1:647310‑M2/1‑102 (MQ=255) tCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgaccaaaaaagcggcttccggcatcagtatt < 1:2534926‑M2/150‑50 (MQ=255) 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cATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgaccaaaaaagcggcttccggcatcagtattcgttgaaatatttata < 1:2414702‑M2/150‑66 (MQ=255) cATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtaaggtgattgtgaccaaaaaagcggcttccggcatcagtattcgttgaaatatttata < 1:4060408‑M2/150‑66 (MQ=255) cATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCNTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGATTTCAtt > 1:3886146/1‑150 (MQ=255) cATACGATAGTGTCCATTAAAA‑TGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgaccaaaaaagcggcttccggcatcagtattcgttgaaatatttataa < 1:2422239‑M2/150‑67 (MQ=255) aTACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTACACCTGTTGTTAAGTTTCGGCGTGAAGCTGATTTCATTc > 1:1501709/1‑150 (MQ=255) 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gatgGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgaccaaaaaagcggcttccggcatcagtattcgttgaaatatttataaccccaataaatggcgtcaggaat < 1:4111271‑M2/150‑90 (MQ=255) ggACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGATTTCATTCGCTACGAACGCCCTGTTCCCGGTGAt < 1:2694387/150‑1 (MQ=255) gACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgaccaaaagagcggcttccggcatcagtattcgttgaaatatttataaccccaataaatggcgtcaggaatgacg > 1:3932318‑M2/1‑57 (MQ=255) gACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgaccaaaaaagcggcttccggcatcagtattcgttgaaatatttataaccccaataaatggcgtcaggaatgacg > 1:573728‑M2/1‑57 (MQ=255) attattTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGATTTCATTCGCTACGAGCGCCCTGTTCCCGGTGATCggg < 1:3623502/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |