| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_138 | = 75 | NA (NA) | 85 (0.930) +GAAAGGGGGGATTTCCGGTCGCAGTGTAAAAGGAAAACGTATCCATACCCGGGCCATTCACA |
56/172 | 0.0 | 100% | coding (1153/1197 nt) | scrY_2 | Sucrose porin |
| ? | Xen14_45 | = 40401 | 0 (0.000) | intergenic (‑73/–) | Xen14_03654/– | hypothetical protein/– | |||||
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
GAACGACACCCCGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_45/40252‑40401 | gAACGACACCCCGGCAGCGCATCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGc > 1:3982963/1‑150 (MQ=255) aaCGACACCCCGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCt < 1:3592716‑M2/150‑2 (MQ=255) ccgACGCCCCGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATACGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtg < 1:1256711‑M2/149‑3 (MQ=255) aCGACACCCCGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATATCGGTATCAATGCtg > 1:807964‑M2/1‑148 (MQ=255) aCGACACCCCGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGAAAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGAGATTGAGCTCAATGTCGGTATCAACGCtg < 1:3782024‑M2/150‑3 (MQ=255) acacCCCGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtga > 1:2681628‑M2/1‑145 (MQ=255) cacCCCGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaa < 1:756202‑M2/150‑7 (MQ=255) cacCCCGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaa < 1:1949756‑M2/150‑7 (MQ=255) cacCCCGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaa < 1:1949755‑M2/150‑7 (MQ=255) acCCCGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaat < 1:1026972‑M2/150‑8 (MQ=255) cccGTCAGCGCCTCCGGGGCGGCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACATGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatgg > 1:1401912‑M2/1‑141 (MQ=255) cccGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatgg > 1:858057‑M2/1‑141 (MQ=255) ccGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGACTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGTCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATATCGGTATCAATGCtgtgaatggc > 1:2088841‑M2/1‑140 (MQ=255) ccGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGACTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATATCGGTATCAATGCtgtgaatggc > 1:2088843‑M2/1‑140 (MQ=255) gTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgtttt > 1:1630022‑M2/1‑121 (MQ=255) gTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgtttt > 1:3559636‑M2/1‑121 (MQ=255) cGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttcc > 1:2110053‑M2/1‑119 (MQ=255) cGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACACCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttcc > 1:2538598‑M2/1‑119 (MQ=255) cGGGTGAGTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCAATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttcc > 1:2110061‑M2/1‑119 (MQ=255) gggTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgtttt < 1:809897‑M2/147‑30 (MQ=255) gTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacattttccttt > 1:1004740‑M2/1‑116 (MQ=255) tGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGATATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttcctttt > 1:3057845‑M2/1‑115 (MQ=255) aTTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttac < 1:2908242‑M2/150‑38 (MQ=255) tGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactg < 1:8990‑M2/150‑42 (MQ=255) ggTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgc > 1:2203248‑M2/1‑108 (MQ=255) gTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcg < 1:2585126‑M2/150‑44 (MQ=255) ccTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgacc < 1:2557508‑M2/150‑47 (MQ=255) tGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccgg < 1:13769‑M2/150‑49 (MQ=255) aaTCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaa < 1:1931940‑M2/150‑51 (MQ=255) aaTCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaa < 1:250454‑M2/150‑51 (MQ=255) aaTCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaa < 1:250457‑M2/150‑51 (MQ=255) aTCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaa > 1:3645405‑M2/1‑99 (MQ=255) aTCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaa > 1:2665516‑M2/1‑99 (MQ=255) aTCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCAGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaa < 1:4173727‑M2/150‑52 (MQ=255) tCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCAATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaat > 1:1619239‑M2/1‑98 (MQ=255) aCGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcc < 1:3224263‑M2/150‑55 (MQ=255) aCGCCTGCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTATCCAGCATCGTTTCGGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggcatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcc > 1:3878744‑M2/1‑96 (MQ=255) gCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccc < 1:3065100‑M2/150‑57 (MQ=255) ccTTCAGGGACAGGCTGCCTCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTCAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatccccc > 1:2707858‑M2/1‑93 (MQ=255) ccTTCAGGGACAGGCTGCCTCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTCAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatccccc > 1:2743703‑M2/1‑93 (MQ=255) ccTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatccccc < 1:3848489‑M2/150‑58 (MQ=255) cTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatc < 1:1610183‑M2/145‑54 (MQ=255) cAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatccccccttt < 1:6740‑M2/150‑62 (MQ=255) gggACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcg > 1:3595341‑M2/1‑87 (MQ=255) gACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgta > 1:3390304‑M2/1‑85 (MQ=255) cATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacag < 1:4212593‑M2/150‑75 (MQ=255) aTCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagc < 1:3733952‑M2/150‑76 (MQ=255) tCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagcc < 1:291676‑M2/150‑77 (MQ=255) tCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagcc > 1:4120852‑M2/1‑74 (MQ=255) aGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagcctg < 1:1465844‑M2/150‑79 (MQ=255) aGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagcctg < 1:2483704‑M2/150‑79 (MQ=255) gcgcAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagcctga < 1:645968‑M2/150‑80 (MQ=255) gcgcAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagcctga < 1:3318935‑M2/150‑80 (MQ=255) gcgcAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCAATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagcctga > 1:3708002‑M2/1‑71 (MQ=255) cgcAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagcctgaa < 1:81859‑M2/150‑81 (MQ=255) cAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagcctgaacc > 1:3113214‑M2/1‑68 (MQ=255) ccAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagcctgaaccgtctggtc < 1:4009557‑M2/150‑91 (MQ=255) gCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagcctgaaccgtctggtcaga > 1:764044‑M2/1‑57 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |