| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_134 | 1002 = | 98 (0.930) | 51 (0.670) +TATCAGGAAGAGCAGACGACACGATAACAGGGTTGTTGGTGCGGGGGGCT |
27/196 | 1.0 | 47.7% | intergenic (‑79/+19) | Xen14_04742/Xen14_04743 | tRNA‑Arg(tct)/tRNA‑Met(cat) |
| ? | Xen14_96 | = 5905 | 71 (0.570) | noncoding (59/77 nt) | Xen14_04572 | tRNA‑Arg(tcg) | |||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
AAAAAAAAGGCCCGCAAAAGCGAGCCAGGGAAAATAAGTGTGGCGCGTTGTACTGGATTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGATGGTGGCCCTTGCTGGATTTGAACCAGCGACCTGGCGATTATGAGTCGCTCGCTCTCACCACTGAGCTAAAGGGCCGCGCGCA > Xen14_96/5757‑6053 | aaaaaaaaGGCCCGCAAAAGCGAGCCAGGGAAAATAAGTGTGGCGCGTTGTACTGGATTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGAccc > 1:2978120/1‑150 (MQ=255) aaaaaaaGGCCCGCAAAAGCGAGCCAGGGAAAATAAGTGTGGCGCGTTGTACTGGATTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTCCGGGGACCCg > 1:2707600/1‑150 (MQ=255) aaaaaaaGGCCCGCAAAAGCGAGCCAGGGAAAATAAGTGTGGCGCGTTGTACTGGATTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTCCGGGGACCCg > 1:836087/1‑150 (MQ=255) aaaaaaGGCCCGCAAAAGCGAGCCAGGGAAAATAAGTGTGGCGCGTTGTACTGGATTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGa > 1:2922319/1‑150 (MQ=255) aacaGGCCCGCAAAAGCGAGCCAGGGAAAATAAGTGTGACGCGTTGTACTGGATTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAAc < 1:3648706/147‑1 (MQ=255) aaaGGCCCGCAAAAGCGAGCCAGGGAAAATAAGTGTGGCGCGTTGTACTGGATTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACt > 1:2264157/1‑150 (MQ=255) ggCCCGCAAAAGCGAGCCAGGGAAAATAAGTGTGGCGCGTTGTACTGGATTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCcg < 1:2859862/150‑1 (MQ=255) gCCCGCAAAAGCGAGCCAGGGAAAATAAGTGTGGCGCGTTGTACTGGATTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCcgc > 1:2124372/1‑150 (MQ=255) aaaaGCGAGCCAGGGAAAATAAGTGTGGCGCGTTGTACTGGATTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAAcc < 1:3246475/150‑1 (MQ=255) aGCGAGCCAGGGAAAATAAGTGTGGCGCGTTGTACTGGATTCGAACCAGTGACCGACTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGc > 1:1906527/1‑150 (MQ=255) aGCCAGGGAAAATAAGTGTGGCGCGTTGTACTGGATTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCg > 1:2205672/1‑150 (MQ=255) ctggaaggatgaatatggcgcgttgtactggaTTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCTGAATACCGATAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgtta < 1:2337882‑M2/135‑27 (MQ=255) aggatgaatatggcgcgttgtaCTGGATTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCTGAATACCGATAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtg > 1:164019‑M2/11‑119 (MQ=255) gatgaatatggcgcgttgTACTGGATTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCTGAATACCGATAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtc < 1:3586896‑M2/142‑34 (MQ=255) gatgaatatggcgcgttgTACTGGATTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCTGAATACCGATAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtc < 1:4091177‑M2/142‑34 (MQ=255) gatgaatatggcgcgttgTACTGGATTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCTGAATACCGATAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccatgttatcgtgtc < 1:4032980‑M2/142‑34 (MQ=255) aGTGTGGCGCGTTGTACTGGATTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGctct < 1:4226869/150‑1 (MQ=255) tatggcGCGTTGTACTGGATTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCTGAATACCGATAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgc > 1:2700133‑M2/3‑111 (MQ=255) ggCGCGTTGTACTGGATTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGTTAACAACGCTGAATACCGATAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtct < 1:1149517‑M2/145‑38 (MQ=255) ggCGCGTTGTACTGGATTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGTTAACAACGCTGAATACCGATAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtct < 1:1149513‑M2/145‑38 (MQ=255) ggCGCGTTGTACTGGATTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAGCCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCt > 1:139545/1‑150 (MQ=255) gcgcGTTGTACTGGATTCGAACCAGTGACCGATTGCTCAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCTGAATACCGATAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtct < 1:2672516‑M2/144‑38 (MQ=255) cgcgTTGTACTGGATTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCtga < 1:62554/150‑1 (MQ=255) gTACTGGATTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCTGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCtgatga < 1:3372989/147‑1 (MQ=255) gTACTGGATTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCCGAGCTAACAACGCTGAATACCGATAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgata < 1:1645274‑M2/150‑51 (MQ=255) cTGGATTCGAACCAGTGACCGATCGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCTGAATACCGATAATGGACCGCCATCGGGGATCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagc < 1:3882701‑M2/150‑54 (MQ=255) ggATTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCTGAATACCGATAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagcta < 1:2042431‑M2/150‑56 (MQ=255) aTTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATACTGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCg < 1:3841006/150‑1 (MQ=255) aTTCGAACCAGTGACCGATTACTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCg > 1:2335051/1‑150 (MQ=255) cGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCTGAATACCGATAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatggc > 1:2025130‑M2/1‑90 (MQ=255) cGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCTGAATACCGATAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatggc > 1:2025133‑M2/1‑90 (MQ=255) ccAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTTTCCGGTTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACGCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTAtgtg < 1:3613257/150‑1 (MQ=255) gTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCTGAATACCGATAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatggcggtttgt > 1:1364030‑M2/1‑83 (MQ=255) tGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCTGAATACCGATAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccgacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatggcggtttgtg < 1:1691496‑M2/150‑69 (MQ=255) tGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCTGAATACCGATAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatggcggtttgtg < 1:630865‑M2/150‑69 (MQ=255) gACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGAtggt > 1:3526049/1‑150 (MQ=255) aCCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGAtggtg < 1:1949869/150‑1 (MQ=255) cGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCTGAATACCGATAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatggcggtttgtgatgg > 1:2591836‑M2/1‑78 (MQ=255) cGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGATGGTGGc < 1:3098713/150‑1 (MQ=255) cGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGATGGTGGc < 1:1887575/150‑1 (MQ=255) gATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGATGGTGGcc < 1:906725/150‑1 (MQ=255) cTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCTGAATACCGCTAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatggcagtttgtgatggtggccc < 1:3153011‑M2/150‑79 (MQ=255) cTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGGAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGATGGTGGCCCTTGc > 1:405816/1‑150 (MQ=255) cTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGATGGTGGCCCTTGc < 1:3928360/150‑1 (MQ=255) cTTAGAAGGCAATTCCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCTAAATACCGATAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatgacggtttgtgatggtggcct < 1:4053034‑M2/150‑79 (MQ=255) ttAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGATGGTGGCCCTTGCt < 1:4181507/150‑1 (MQ=255) tAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGATGGTGGCCCTTGCTg < 1:3243518/150‑1 (MQ=255) aGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGATGGTGGCCCTTGCTgg < 1:3918839/150‑1 (MQ=255) aGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGATGGTGGCCCTTGCTgg > 1:1713035/1‑150 (MQ=255) aaGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCTGAATACCGATAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatggcggtttgtgatggtggcccttgct > 1:4153651‑M2/1‑67 (MQ=255) ggCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGATGGTGGCCCTTGCTGGAttt < 1:832603/150‑1 (MQ=255) ggCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGATGGTGGCCCTTGCTGGAttt < 1:3606672/150‑1 (MQ=255) ggCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGATGGTGGCCCTTGCTGGAttt > 1:636469/1‑150 (MQ=255) ggCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGATGGTGGCCCTTGCTGGAttt > 1:872744/1‑150 (MQ=255) cAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCTGAATACCGATAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatggcggtttgtgatggtggcccttgctggat < 1:1226140‑M2/150‑88 (MQ=255) cAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCTGAATACCGATAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatggcggtttgtgatggtggcccttgctggat < 1:2103028‑M2/150‑88 (MQ=255) aaTTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCTGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATGATGGCGGTATGTGATGGTGGCCCTTGCTGGATTTGaa < 1:573157/150‑1 (MQ=255) aTTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGATGGTGGCCCTTGCTGGATTTGAAc < 1:4118462/150‑1 (MQ=255) 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caacGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGATGGTGGCCCTTGCTGGATTTGAACCAGCGACCTGGCGATTATGAGtc > 1:609680/1‑150 (MQ=255) cgctgaataccgaTAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatggcggtttgtgatggtggcccttgctggatttgaaccagcgacctggcgattatgagt < 1:2395007‑M2/144‑116 (MQ=255) gCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAGCCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGATGGTGGCCCTTGCTGGATTTGAACCAGCGACCTGGCGATTATGAGtcgctc < 1:1604686/150‑1 (MQ=255) gCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGATGGTGGCCCTTGCTGGATTTGAACCAGCGACCTGGCGATTATGAGtcgctc < 1:4122506/150‑1 (MQ=255) tgaatacCGATAATGGACCGCCATCGGGGACCggccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatggcggtttatgatggtggcccttgctggatttgaaccagcgacctggcgattatgagtcgc > 1:700750‑M2/4‑32 (MQ=255) tACCGATAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaaaggcggtttgtgatggtggcccttgctggatttgaaccagcgacctggcgattatgagtcgctcgc < 1:3139837‑M2/150‑123 (MQ=255) ccgatAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatggcggtttgtgatggtggcccttgctggatttgaaccagcgacctggcgattatgagtcgctcgctc < 1:3960698‑M2/148‑125 (MQ=255) aTAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGATGGTGGCCCTTGCTGGATTTGAACCAGCGACCTGGCGATTATGAGTCGCTCGCTCTcaccac > 1:3162394/1‑150 (MQ=255) tAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGATGGTGGCCCTTGCTGGATTTGAACCAGCGACCTGGCGATTATGAGTCGCTCGCTCTCACCACt > 1:894200/1‑150 (MQ=255) tAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatggcggtttgtgatggtggcccttgctggatttgaaccagcgacctggcgattatgagtcgctcgctctcac < 1:2615935‑M2/150‑129 (MQ=255) tAATGGACCGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatggcggtttgtgatggtggcccttgctggatttgaaccagcgacctggcgattatgagtcgctcgctctcac < 1:2732971‑M2/150‑129 (MQ=255) tGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGATGGTGGCCCTTGTTGGATTTGAACCAGCGACCTGGCGATTATGAGTCGCTCGCTCTCACCACTGAg < 1:2267345/150‑1 (MQ=255) ggACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGATGGTGGCCCTTGCTGGATTTGAACCAGCGACCTGGCGATTATGAGTTGCTCGCTCTCACCACTGAGc < 1:693007/150‑1 (MQ=255) aCCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGATGGTGGCCCTTGCTGGATTTGAACCAGCGACCTGGCGATTATGAGTCGCTCGCTCTCACCACTGAGCTa > 1:2517148/1‑150 (MQ=255) ccGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatggcggtttgtgatggtggcccttgctggatttgaaccagcgacctggcgattatgagtcgctcgctctcaccactgag < 1:206910‑M2/150‑136 (MQ=255) ccGCCATCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatggcggtttgtgatggtggcccttgctggatttgaaccagcgacctggcgattatgagtcgctcgctctcaccactgag < 1:749426‑M2/150‑136 (MQ=255) ccTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGATGGTGGCCCTTGCTGGATTTGAACCAGCGACCTGGCGATTATGAGTCGCTCGCTCTCACCACTGAGCTAAAgg > 1:4213228/1‑150 (MQ=255) atcGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatggcggtttgtgatggtggcccttgctggatttgaaccagcgacctggcgattatgagtcgctcgctctcaccactgagctaaa < 1:193017‑M2/149‑141 (MQ=255) tCGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatggcggtttgtgatggtggcccttgctggatttgaaccagcgacctggcgattatgagtcgctcgctctcaccactgagctaaag < 1:2214326‑M2/150‑142 (MQ=255) cGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatggcggtttgtgatggtggcccttgctggatttgaaccagcgacctggcgattatgagtcgctcgctctcaccactgagctaaagg > 1:2033683‑M2/1‑8 (MQ=255) cGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatggcggtttgtgatggtggcccttgctggatttgaaccagcgacctggcgattatgagtcgctcgctctcaccactgagctaaagg > 1:2033682‑M2/1‑8 (MQ=255) cGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatggcggtttgtgatggtggcccttgctggatttgaaccagcgacctggcgattatgagtcgctcgctctcaccactgagctaaagg > 1:2033681‑M2/1‑8 (MQ=255) cGGGGACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatggcggtttgtgatggtggcccttgctggatttgaaccagcgacctggcgattatgagtcgctcgctctcaccactgagctaaagg > 1:2033676‑M2/1‑8 (MQ=255) ggggACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctactggcggtttgtgatggtgtcccttgctggatttgaaccagcgacctggcgatcctgagtcgctcgctctcacaactgagctaaaggg < 1:3229060‑M2/150‑144 (MQ=255) ggggACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatggcggtttgtgatggtggcccttgctggatttgaaccagcgacctggcgattatgagtcgctcgctctcaccactgagctaaaggg < 1:923140‑M2/150‑144 (MQ=255) ggggACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatggcggtttgtgatggtggcccttgctggatttgaaccagcgacctggcgattatgagtcgctcgctctcaccactgagctaaaggg < 1:2541729‑M2/150‑144 (MQ=255) gACCagccccccgcaccaacaaccctgttatcgtgtcgtctgctcttcctgataagctaatggcggtttgtgatggtggcccttgctggatttgaaccagcgacctggcgattatgagtcgctcgctctcaccactgagctaaagggccg < 1:3031109‑M2/150‑147 (MQ=255) | AAAAAAAAGGCCCGCAAAAGCGAGCCAGGGAAAATAAGTGTGGCGCGTTGTACTGGATTCGAACCAGTGACCGATTGCTTAGAAGGCAATTGCTCTGTCCGGCTGAGCTAACAACGCAGGATACAGATAATGGACCGCCTTCGGGGACCCGAACTCCGCGCAACCAGCTTCGAAGGCTGGCGCTCTTTCCTGATGAGATAATGGCGGTATGTGATGGTGGCCCTTGCTGGATTTGAACCAGCGACCTGGCGATTATGAGTCGCTCGCTCTCACCACTGAGCTAAAGGGCCGCGCGCA > Xen14_96/5757‑6053 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |