| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_105 | 3688 = | 454 (2.660) | 127 (1.010) +G |
42/294 | 1.0 | 31.3% | intergenic (‑18/‑140) | Xen14_04636/Xen14_04637 | IS3 family transposase IS1397/hypothetical protein |
| ? | Xen14_12 | = 188 | 107 (1.290) | intergenic (–/+140) | –/Xen14_01540 | –/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 517 total aligned reads displayed.
AACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCAGGGGTCAGTAGTGCTCTCACGGTCACCTCAGCGAACGGTATTGCATGAACGCAGAAGAAAAAATTCAGCCA > Xen14_12/38‑327 | cTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAgg < 1:2230682/150‑1 (MQ=255) cTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGc > 1:266522‑M2/1‑149 (MQ=255) cTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGc < 1:237332‑M2/150‑2 (MQ=255) cTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTAAATGGCGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAgg > 1:2271418/1‑150 (MQ=255) tGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGtc > 1:1859047‑M1/1‑148 (MQ=255) tGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGCGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGAGATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGcc > 1:3470432‑M2/1‑148 (MQ=255) ggCGAAACTTGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGctg > 1:3873239‑M2/1‑147 (MQ=255) ggCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGccc < 1:3554274‑M2/150‑4 (MQ=255) ggCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGagc > 1:729510‑M1/1‑147 (MQ=255) ggCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGcc > 1:2769430/1‑149 (MQ=255) ggCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCa > 1:2980649/1‑150 (MQ=255) ggCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCAGGTTGGGTAGTAATGTGGAATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTAACTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGCGATCTGATCAAGAGACAGccc < 1:3917457‑M2/150‑4 (MQ=255) ggCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCG‑CCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAATTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGtcag < 1:1353769‑M1/150‑5 (MQ=255) ggCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCG‑CCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGtcag > 1:3354477‑M1/1‑146 (MQ=255) 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aaCTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGccgcccgg > 1:1171105‑M2/1‑142 (MQ=255) aaCTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAAc > 1:1383588/1‑150 (MQ=255) cTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGctggcgcagg > 1:2178602‑M2/1‑140 (MQ=255) cTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGccccagagga < 1:3145205‑M2/150‑11 (MQ=255) cTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCG‑CTCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGtcagcatgagg < 1:1702543‑M1/150‑12 (MQ=255) cTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACACACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAATTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGtcctcgggag < 1:1432797‑M1/150‑11 (MQ=255) tGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCNCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGctgtccgccag > 1:1514971‑M2/1‑139 (MQ=255) tGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACTTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGctggcgcaggg < 1:4152006‑M2/150‑12 (MQ=255) tGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCC‑GGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGATGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGccaaaaggggcg > 1:3642410‑M2/1‑138 (MQ=255) tGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCACCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATTAGGAGATCTGATCAAGAGACAGctggcgcaggg < 1:2550631‑M2/150‑12 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |