| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | Xen14_1 | 242480 = | NA (NA) | 370 (3.010) | 115/296 | 0.0 | 74.9% | coding (66/375 nt) | Xen14_00217 | IS3 family transposase ISLad1 |
| ? | Xen14_105 | 4697 = | 124 (0.730) | coding (418/480 nt) | Xen14_04638 | IS3 family transposase ISCfr6 | |||||
Only 100 of 496 total aligned reads displayed.
GCTATCTGGCGGTTGTGATGGATCTTTTTGCCCGCAGGGTTATCGGCTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCGGA > Xen14_105/4548‑4846 | gCGGTTGTGATGGATCTTTTTGCCCGCAGAGTTATCGGCTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTaataat > 1:3439921/1‑150 (MQ=255) cGGTTGTGATGGATCTTTTTGCCCGCAGGGTTATCGGCTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATg > 1:770217/1‑150 (MQ=255) gATGGATCTTTTTGCCCGCAGGGTTATCGGCTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTAt < 1:676962/150‑1 (MQ=255) gATGGATCTTTTTGCCCGCAGGGTTATCGGCTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTAt > 1:1572667/1‑150 (MQ=255) tCTTTTTGCCCGCAGGGTTATCGGCTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGttt > 1:2685049/1‑150 (MQ=255) cccGCAGGGTTATCGGCTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTatcatc > 1:2244864/1‑150 (MQ=255) gctgggttCTGGCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGtt < 1:2859075/143‑1 (MQ=255) cTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCCGTTTGCTGttt > 1:3596077/1‑150 (MQ=255) tGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTATGTTTGCTGTTTAACCAGAc > 1:3104840/1‑150 (MQ=255) gTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACt > 1:148402/1‑150 (MQ=255) cacaTGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGgtgt < 1:1139856/150‑1 (MQ=255) ctcgccggacagcaggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGcgtg < 1:1026379‑M2/62‑1 (MQ=255) ctcgccggacagcaggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatattccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGtgtg > 1:2443899‑M2/89‑150 (MQ=255) ctcgccggacagcaggctcaccatgaaagcgctgaaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGtt < 1:2356070‑M2/39‑1 (MQ=255) tcgccggacagcaggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGa > 1:3681106‑M2/88‑150 (MQ=255) cgccggacagcaggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGAt > 1:3934958‑M2/87‑150 (MQ=255) gccggacagcaggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaccccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGAtt < 1:4093657‑M2/65‑1 (MQ=255) gccggacagcaggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGAtt < 1:1862589‑M2/65‑1 (MQ=255) cagcaggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGAt < 1:3265950‑M2/71‑1 (MQ=255) agcaggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATg < 1:3923197‑M2/72‑1 (MQ=255) agcaggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATg < 1:2455261‑M2/72‑1 (MQ=255) gcaggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGc > 1:899665‑M2/78‑150 (MQ=255) cTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCAGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGc > 1:4015975/1‑150 (MQ=255) caggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCa > 1:1984025‑M2/77‑150 (MQ=255) ggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccatagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGt > 1:1308061‑M2/75‑150 (MQ=255) ggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGt > 1:3286213‑M2/75‑150 (MQ=255) ggctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGt < 1:3339923‑M2/76‑1 (MQ=255) ctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGa < 1:3726255‑M2/78‑1 (MQ=255) ctcaccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGa > 1:234451‑M2/73‑150 (MQ=255) ctcaccatgaaagcgctggaaacggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACCGGTGTGATTACTGATGCAGTGa > 1:1626707‑M2/73‑150 (MQ=255) caccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAg < 1:1612082‑M2/80‑1 (MQ=255) caccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAg < 1:3064273‑M2/80‑1 (MQ=255) accatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGa < 1:232080‑M2/81‑1 (MQ=255) ccatgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGAc > 1:3393989‑M2/69‑150 (MQ=255) catgaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGAcc < 1:2192664‑M2/83‑1 (MQ=255) aaGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGAcc < 1:2270601/150‑1 (MQ=255) gaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTc > 1:2381172‑M2/65‑150 (MQ=255) gaaagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTc < 1:1326590‑M2/86‑1 (MQ=255) aagcgctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTccc < 1:278344‑M2/88‑1 (MQ=255) ctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCAGTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCGGTGAAGACCTTCCCGCATc > 1:3896699‑M2/58‑150 (MQ=255) ctggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCgcagc < 1:3483083‑M2/93‑3 (MQ=255) cTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGTTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATc < 1:2929329/150‑1 (MQ=255) tggaaatggcatgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATcc < 1:3177032‑M2/94‑1 (MQ=255) 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catgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTCTCAGTTTTTATCATCACGCTGTTTGCTGTTTAACCAGAATGGTGTGATTACTGCTGCAGTGa > 1:950283‑M2/48‑125 (MQ=255) catgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTcaca > 1:2961714‑M2/48‑150 (MQ=255) catgggaaacccgtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTcaca > 1:2878456‑M2/48‑150 (MQ=255) tgggaaacctgtggtaaacccggcgggggggggttccacagcgatAGTAATAAGGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTcacaca < 1:1439415‑M2/105‑1 (MQ=255) tgggaaaccagtggtaaacccggcggggtgatgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTcacaca < 1:1118199‑M2/105‑1 (MQ=255) 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tatgttCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGa > 1:1685897/1‑150 (MQ=255) atgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGAc < 1:1065576‑M2/135‑1 (MQ=255) atgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGAc < 1:1903293‑M2/135‑1 (MQ=255) atgttCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGAc < 1:2213044/150‑1 (MQ=255) tgttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTATGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCTATCGACCCTTTATGTCCTGCCCTGGAcc < 1:618389‑M2/136‑1 (MQ=255) tgttCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGAcc > 1:557371/1‑150 (MQ=255) gttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCt > 1:47870‑M2/14‑150 (MQ=255) ttccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTg < 1:527770‑M2/138‑1 (MQ=255) ttCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCATTTGTGTCCTGCCCTGGACCTg > 1:3688710/1‑150 (MQ=255) ccacagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTc > 1:1925807‑M2/11‑150 (MQ=255) acagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCgg < 1:3630272‑M2/142‑1 (MQ=255) cagcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGt > 1:3998050‑M2/8‑150 (MQ=255) agcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGtt < 1:591118‑M2/144‑1 (MQ=255) agcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGtt < 1:1404976‑M2/144‑1 (MQ=255) gcgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTg < 1:822554‑M2/145‑1 (MQ=255) gCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTg < 1:3800312/150‑1 (MQ=255) cgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGc < 1:2725352‑M2/146‑1 (MQ=255) cgatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGCGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGc < 1:3969051‑M2/146‑1 (MQ=255) cGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTTTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGc < 1:3024197/150‑1 (MQ=255) gatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTCACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGcc > 1:1377617‑M2/4‑150 (MQ=255) gatAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGcc < 1:794303‑M2/147‑1 (MQ=255) atAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCACGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCg < 1:460276‑M2/148‑1 (MQ=255) | GCTATCTGGCGGTTGTGATGGATCTTTTTGCCCGCAGGGTTATCGGCTGGAGTCTGTCCGCACATGCCGATACTGCACTGATAAGCGATGCCCTGCGGATGGCCTATGAGACGCGTGGTCAACCACATGATGTTATGTTCCATAGCGACAGTAATAATGCCGGTATCAGTTTTTATCATCACTCTGTTTGCTGTTTAACCAGACTGGTGTGATTACTGATGCAGTGAAGACCTTCCCGCATCCTGACTCACACAGCGATCGACCCTTTGTGTCCTGCCCTGGACCTGTCGGTTGCCGGA > Xen14_105/4548‑4846 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |