| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_174 | 1 = | 0 (0.000) | 68 (0.640) +TTGCCCGGCCAGTACGATGACGTAGTACC |
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| ? | Xen14_96 | 5121 = | 75 (0.600) | coding (187/1782 nt) | Xen14_04570 | hypothetical protein | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCATTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAACGACATCATTCCTGCTGACCATTG > Xen14_174/1‑149 | caaactgaaagagggctggcagccatacggcggaccggttgccattacgccgtacacactgatgcaggcggtggctattgaaggagagccacaggtcggcccttcatctgagccggattggtactacgtcatcgtactggccgggcaaTc < 1:2620227‑M1/2‑1 (MQ=255)caaactgaaagagggctggcagccatacggcggaccggttgccattacgccgtacacactgatgcaggcggtggctattgaaggagagccacaggtcggcccttcatctgagccggattggtactacgtcatcgtactggccgggcaaTc > 1:3376560‑M1/149‑150 (MQ=255) aaactgaaagagggctggcagccatacggcggaccggttgccattacgccgtacatactgatgcaggcggtggctattgaaggagagccacaggtcggcccttcatctgagccggattggtactacgtcatcgtactggccgggcaaTcc > 1:3867976‑M1/148‑150 (MQ=255) 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gtactggccgggcagTCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCATTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAACGACATCAtt < 1:2017605‑M1/135‑1 (MQ=255) ggccgggcaaTCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCATTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAACGACATCATTCctgc > 1:1981855‑M1/11‑150 (MQ=255) ccgggcagTCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCATTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAACGACATCATTCctgctg < 1:2430560‑M1/142‑1 (MQ=255) gggcagTCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCATTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAACGACATCATTCCTGCTGAc > 1:3412005‑M1/7‑150 (MQ=255) gggcaaTCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCATTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAACGACATCATTCCTGCTGAc < 1:2587077‑M1/144‑1 (MQ=255) gcaaTCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCATTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAACGACATCATTCCTGCTGACCa < 1:38946‑M1/146‑1 (MQ=255) gcaaTCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCATTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAACGACACCATTCCTGCTGACCa < 1:2332392‑M1/146‑1 (MQ=255) gcaaTCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCCTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCATTCCGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAACGACATCATTCCTGCTGaccg < 1:3056025‑M1/146‑2 (MQ=255) aaTCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGTGCCCCATCTGCGCATTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAACGACATCATTCCTGCTGACCAtt < 1:2716041‑M1/148‑1 (MQ=255) aaTCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCATTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAACGACATCATTCCTGCTGACCAtt < 1:2226230‑M1/148‑1 (MQ=255) gtCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCATTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAACGACATCATTCCTGCTGACCATTg > 1:3888479/2‑150 (MQ=255) aTCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCATTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAAc > 1:3326754‑M1/2‑127 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCATTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAACGACATCATTCCTGCTGACCATTG > Xen14_174/1‑149 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |