| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | Xen14_166 | = 685 | 0 (0.000) | 3120 (2.820) | 237/244 | -0.0 | 95.9% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | Xen14_17 | = 79810 | 265 (1.680) | coding (460/741 nt) | Xen14_02064 | IS4 family transposase ISEc13 | |||||
Only 100 of 3135 total aligned reads displayed.
CATTACGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_166/536‑685 | cATTACGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTg > 1:2469587/1‑150 (MQ=255) ttACGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcg > 1:2861836‑M1/1‑148 (MQ=255) ttACGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTACGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCAGTGCGGGTGCTGGGCCTGcg > 1:1204792‑M1/1‑148 (MQ=255) tACGAGCGACGCTGGCTGATAGAGGAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcgg > 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gAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaaaca < 1:3681430‑M1/150‑28 (MQ=255) gAATACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaaaca > 1:161255‑M1/1‑123 (MQ=255) tACCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaaacacaa < 1:2792622‑M1/150‑31 (MQ=255) aCCACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAACCTCGAGCGCATGGTGGTTATCAAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTGcggcagggcggtatcagtgaagaaacacaaa < 1:2714273‑M1/150‑32 (MQ=255) ccACAAGGCGTGGAAAAGTGGTGGTACATGTGTGGAATCGCTGCGAATGCAGACCCGGGATAAACTCGAGCGCATGGTGGTTATCCAGGCGTTTATCGCGGTGCGGGTGCTGGGCCTTcggcagggcgggatccgtgaagaaacacaaaa > 1:4232689‑M1/1‑118 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |