| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | Xen14_106 | = 1601 | 135 (1.130) | 94 (0.190) | 42/296 | 2.4 | 58.2% | coding (17/453 nt) | Xen14_04641 | IS256 family transposase IS1414 |
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Only 100 of 229 total aligned reads displayed.
AATCATTGGAATATCGCGATGGAGCGCCCCATTACCCATGAGGCGATCAATTGCAAAAGAGCCTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTAACGAACTGTCCAAAAACCTCAAAACCCCTGAAGACCTCAGTCAGTTTGATCGGCTGCTGAAAAAGCTCAGCGTTGAAGCCGCTCTCAATGCTGAGATGACACACCATCTTGGGTATGAGAAAAATCAGTCCAGAC > Xen14_106/1455‑1750 | aaTCATTGGAATATCGCGATGGAGCGCCCCATTACCCATGAGGCGATCAATTGCAAAAGAGCCTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACa > 1:650487/1‑150 (MQ=255) tCATTGGAATATCGCGATGGAGCGCCCCATTACCCATGAGGCGATCAATTGCAAAAGAGCCTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAgg > 1:1870978/1‑150 (MQ=255) aTTGGAATATCGCGATGGAGCGCCCCATTACCCATGAGGCGATCAATTGCAAAAGAGCCTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATAGACGAAAAACAGTTACAGGct > 1:674347/1‑150 (MQ=255) 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aTGGAGCGCCCCATTACCCATGATGCGATCAATTGCAAAAGAGCCTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTAACGAACt < 1:3404935/150‑1 (MQ=255) tGGAGCGCCCCATTACCCATGAGGCGATCAATTGCAAAAGAGCCTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAACTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTAACGAACTg > 1:2358911/1‑150 (MQ=255) gAGCGCCCCATTACCCATGAGGCGATCAATTGCAAAAGAGCCTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTAACGAACTGTc < 1:172446/150‑1 (MQ=255) cgcCCCATTACCCATGAGGCGATCAATTGCAAAAGAGCCTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTAACGAACTGTCCaa < 1:3064392/150‑1 (MQ=255) tACCCATGAGGCGATCAATTGCAAAAGAGCCTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTAACGAACTGTCCAAAAACCTCa < 1:2051982/150‑1 (MQ=255) 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1:1090176‑M1/150‑150 (MQ=255) ttgaaccgccccgggtttcctggagagtgttttatttgtgaactcaggctgccagatcatcgtttccgatggaagcataataagctttttctgcttctgccggaggagtatggcccagcctttccagcaatcgtcgattgttataccagt < 1:1090174‑M1/150‑150 (MQ=255) | AATCATTGGAATATCGCGATGGAGCGCCCCATTACCCATGAGGCGATCAATTGCAAAAGAGCCTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTAACGAACTGTCCAAAAACCTCAAAACCCCTGAAGACCTCAGTCAGTTTGATCGGCTGCTGAAAAAGCTCAGCGTTGAAGCCGCTCTCAATGCTGAGATGACACACCATCTTGGGTATGAGAAAAATCAGTCCAGAC > Xen14_106/1455‑1750 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |