| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_1 | 1 = | 0 (0.000) | 25 (0.420) +CAAAATGAATCAATCTTTACTTTCT |
17/246 | 2.3 | 100% | intergenic (–/‑286) | –/Xen14_00001 | –/hypothetical protein |
| ? | Xen14_148 | 943 = | NA (NA) | intergenic (‑46/–) | Xen14_04761/– | hypothetical protein/– | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCATGGAATTCTTTAACCAGAAACCTGACTTCTCCTGACAGTCGTATTTTATCCTCTGTAAGGGATGCAGCTGCTAGCTCGGATAATGGGGCGCAAGTA > Xen14_1/1‑145 | agtccggctccggtttttgttgtcatgccatggtgatgtttgttaagaaagtaaagattgattcattttgAAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCATGGAATTCTTTAACCAGAAACCTGACTtctc < 1:739956‑M1/80‑1 (MQ=255)agtccggctccggtttttgttgtcatgccatggtgatgtttgttaagaaagtaaagattgattcattttgAAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCATGGAATTCTTTAACCAGAAACCTGACTtctc < 1:2169444‑M1/80‑1 (MQ=255) ccggctccggtttttgttgtcatgccatggtgatgtttgttaagaaagtaaagattgattcattttgAAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCATGGAATTCTTTAACCAGAAACCTGacttctcatg < 1:666176‑M1/83‑4 (MQ=255) ccggctccggtttttgttgtcatgccatggtgatgtttgttaagaaagtaaagattgattcattttgAAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCATGGAATTCTTTAACCAGAAACCTGACTTCTCCTg < 1:1192280‑M1/83‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |