| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_119 | = 73 | NA (NA) | 35 (0.040) +AGCTAGGCTGGGGGG |
27/266 | 2.9 | 100% | intergenic (–/‑393) | –/lipA | –/Lipoyl synthase |
| ? | Xen14_168 | = 629 | 0 (0.000) | intergenic (‑111/–) | Xen14_04774/– | IS200/IS605 family transposase IS200C/– | |||||
TGGAAAGAGTCCCCCTAAAGCAGACTGACAGACATCACAAATCCCCGGGTGGGGATTTGTGTATAAGAGACAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_119/1‑73‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAACGAAAAGAGCTTAGCGCACACCCGATGGA < Xen14_168/629‑482 ||||||||||||||| TGGAAAGAGTCCCCCTAAAGCAGACTGACAGACATCACAAATCCCCGGGTGGGGATTTGTGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTT > 1:3582517/1‑150 CCCCTAAAGCAGACTGACAGACATCACAAATCCCCGGGTGGGGATTTGTGTATAGGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCA < 1:3286964/150‑1 CCCCTAAAGCAGACTGACAGACATCACAAATCCCCGGGTGGGGATTTGTGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCA < 1:977561/150‑1 CCCTAAAGCAGACTGACAGACATCACAAATCCAAGGGTGGGGATTTGTGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAA > 1:3840883/1‑150 CTAAAGCAGACTGACAGACATCACAAATCCCCGGGTGGGGATTTGTGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAAC < 1:1693860/131‑1 AAAGCAGACTGACAGACATCACAAATCCCCGGGTGGGGATTTGTGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGC > 1:2963846/1‑150 AGCAGACTGACAGACATCACAAATCCCCGGGTGGGGATTTGTGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAA < 1:1271152/150‑1 AGACTGACATACATCACAAATCCCCGGGTGGGGATTTGTGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTTCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTG < 1:1393872/150‑1 AGACTGACAGACATCACAAATCCCCGGGTGGGGATTTGTGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTG < 1:3257100/150‑1 ACAGACATCACAAATCCCCGGGTGGGGATTTGTGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAAC < 1:3100823/150‑1 CAGACATCACAAATCCCCGGGTGGGGATTTGTGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACA > 1:3619543/1‑150 GACATCACAAATCCCCGGGTGGGGATTTGTGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCCGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAG < 1:1643094/150‑1 ATCACAAATCCCCGGGTGGGGATTTGTGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAA > 1:232517/1‑150 CACAACTCCCCGGGTGGGGATTTGTGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATC > 1:458163/1‑150 CACAAATCCCCGGGTGGGGATTTGTGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATC < 1:1944542/150‑1 CACAAATCCCCGGGTGGGGATTTGTGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATC > 1:458164/1‑150 CACAAACCCCCGGGGGGGGATTTGGGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATC < 1:1944540/150‑1 ACAAATCCCCGGGTGGGGATTTGTGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCA < 1:531620/150‑1 AAATCCCCGGGTGGGGATTTGTGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAA < 1:1274910/150‑1 GGTGGGGATTTGTGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCC > 1:2680284/1‑150 tggtGATTTGTGTATAAGATACATATCTAGGCTTGTGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGGCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCA < 1:3397138/146‑1 GGGATTTGTGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTAGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAAT > 1:3191053/1‑150 GGATTTGTGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTATAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATG < 1:3544896/150‑1 gcGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAAC > 1:3951421/3‑150 GTGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAAC < 1:4032358/150‑1 GTGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAAC < 1:594519/150‑1 GTGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAAC < 1:834915/150‑1 GTGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAAC < 1:834916/150‑1 TGTATAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAACG < 1:1491330/150‑1 TAAGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAACGAAAA > 1:56504/1‑150 AGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAACGAAAAGA < 1:3062544/150‑1 AGAGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAACGAAAAGA > 1:4026603/1‑150 AGACAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAGCAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAACGAAAAGAGC > 1:3120945/1‑150 cccAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATCAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAACGAAAAGAGCTTA > 1:3178038/4‑150 CAGAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAACGAAAAGAGCTTA < 1:2271743/150‑1 GAGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAACGAAAAGAGCTTAGC > 1:4054919/1‑150 AGCTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAACGAAAAGAGCTTAGCG < 1:3188678/150‑1 CTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAGAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGACAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAACGAAAAGAGCTTAGCGCA > 1:1048182/1‑150 CTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAGAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGACAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAACGAAAAGAGCTTAGCGCA > 1:1371681/1‑150 CTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAACGAAAAGAGCTTAGCGCA > 1:2630529/1‑150 CTAGGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAACGAAAAGAGCTTAGCGCA < 1:197548/150‑1 GGCTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGGTTTGTTAAAACACTTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCGATGGGGAACGAAAAGAGCCTAGCGCACAC < 1:1675218/150‑1 CTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAACGAAAAGAGCTTAGCGCACACCC > 1:1384708/1‑150 CTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAACGAAAAGAGCTTAGCGCACACCC > 1:1384710/1‑150 CTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAACGAAAAGAGCTTAGCGCACACCC > 1:197623/1‑150 CTGGGGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAACGAAAAGAGCTTAGCGCACACCC > 1:1970999/1‑150 GGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAACGAAAAGAGCTTAGCGCACACCCGATG > 1:613927/1‑150 GGGGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAACGAAAAGAGCTTAGCGCACACCCGATG < 1:820858/150‑1 GGTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAACGAAAAGAGCTTAGCGCACACCCGATGGA > 1:2397054/1‑150 ||||||||||||||| TGGAAAGAGTCCCCCTAAAGCAGACTGACAGACATCACAAATCCCCGGGTGGGGATTTGTGTATAAGAGACAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_119/1‑73‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCAATGGGGAACGAAAAGAGCTTAGCGCACACCCGATGGA < Xen14_168/629‑482 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |